MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014334	AAGC	2	8	2181791	2181798	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6502	NC_014334	T	6	6	2181911	2181916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_014334	CG	3	6	2181940	2181945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6504	NC_014334	ATT	2	6	2181982	2181987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_014334	AAG	2	6	2181992	2181997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_014334	CTG	2	6	2183961	2183966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_014334	A	6	6	2184128	2184133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_014334	ATA	2	6	2184147	2184152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_014334	ATG	2	6	2184205	2184210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_014334	TGT	2	6	2184226	2184231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_014334	ATC	2	6	2184572	2184577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_014334	GGC	2	6	2184626	2184631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_014334	ACG	2	6	2185705	2185710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_014334	CCCT	2	8	2186969	2186976	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6515	NC_014334	AGAGC	2	10	2187015	2187024	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6516	NC_014334	TGC	2	6	2187119	2187124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_014334	AGC	2	6	2187883	2187888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_014334	T	8	8	2187900	2187907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_014334	GCTT	2	8	2188091	2188098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6520	NC_014334	T	6	6	2188646	2188651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_014334	TTCCG	2	10	2188721	2188730	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6522	NC_014334	GCA	2	6	2188731	2188736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_014334	TTCGCA	2	12	2188820	2188831	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_014334	T	6	6	2188832	2188837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_014334	GATT	2	8	2188907	2188914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_014334	T	7	7	2189001	2189007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_014334	CGCAA	2	10	2190124	2190133	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6528	NC_014334	T	6	6	2190157	2190162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_014334	CTC	2	6	2190931	2190936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6530	NC_014334	CCT	2	6	2193532	2193537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6531	NC_014334	TAA	2	6	2194411	2194416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_014334	A	6	6	2194433	2194438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_014334	CCT	2	6	2194570	2194575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6534	NC_014334	A	6	6	2194585	2194590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_014334	TTG	2	6	2194635	2194640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_014334	CT	3	6	2194673	2194678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6537	NC_014334	A	6	6	2194688	2194693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_014334	T	6	6	2194787	2194792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_014334	TTG	2	6	2195672	2195677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_014334	TGA	2	6	2195693	2195698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_014334	ATG	2	6	2195733	2195738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_014334	GTT	2	6	2195780	2195785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_014334	CTT	2	6	2195813	2195818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_014334	GAT	2	6	2195819	2195824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_014334	TTG	2	6	2195837	2195842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_014334	TCA	2	6	2196288	2196293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_014334	GCC	2	6	2198002	2198007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6548	NC_014334	CTT	2	6	2198033	2198038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_014334	ACA	2	6	2198100	2198105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_014334	ACCT	2	8	2198168	2198175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_014334	TGC	2	6	2198179	2198184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_014334	TTCC	2	8	2198185	2198192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6553	NC_014334	CAT	2	6	2198216	2198221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_014334	AATA	2	8	2198793	2198800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_014334	TTTA	2	8	2198852	2198859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_014334	CCTGA	2	10	2199248	2199257	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6557	NC_014334	CCT	2	6	2199889	2199894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_014334	TAA	2	6	2199965	2199970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_014334	TGC	2	6	2202595	2202600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_014334	TCC	2	6	2202602	2202607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6561	NC_014334	GAT	2	6	2202693	2202698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_014334	A	6	6	2202701	2202706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_014334	T	6	6	2202707	2202712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_014334	T	6	6	2202716	2202721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_014334	TCAA	2	8	2202823	2202830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6566	NC_014334	CAG	2	6	2202833	2202838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_014334	TCAA	2	8	2202845	2202852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6568	NC_014334	AGG	2	6	2202858	2202863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_014334	ACTGGA	2	12	2203414	2203425	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6570	NC_014334	A	6	6	2204380	2204385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_014334	GCA	2	6	2204386	2204391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_014334	TGC	2	6	2204422	2204427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_014334	GCT	2	6	2204446	2204451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_014334	TA	3	6	2210252	2210257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_014334	GAA	2	6	2210263	2210268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_014334	TTA	2	6	2210294	2210299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_014334	TTA	2	6	2210330	2210335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_014334	TAT	2	6	2210376	2210381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_014334	AATA	2	8	2210427	2210434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_014334	A	7	7	2211475	2211481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_014334	CAC	2	6	2211503	2211508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6582	NC_014334	TCC	2	6	2211923	2211928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6583	NC_014334	TTA	2	6	2211931	2211936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_014334	T	7	7	2212464	2212470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_014334	A	7	7	2212505	2212511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_014334	ACC	2	6	2212554	2212559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6587	NC_014334	GGCC	2	8	2212679	2212686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6588	NC_014334	T	6	6	2212729	2212734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_014334	ATTA	2	8	2212847	2212854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_014334	A	7	7	2214117	2214123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_014334	T	7	7	2214146	2214152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_014334	TATT	2	8	2215526	2215533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_014334	A	6	6	2215598	2215603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_014334	TCA	2	6	2215629	2215634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_014334	GTTT	2	8	2215695	2215702	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_014334	AGG	2	6	2215756	2215761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_014334	ACA	2	6	2216984	2216989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_014334	A	6	6	2216989	2216994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_014334	T	6	6	2217033	2217038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_014334	TACT	2	8	2218442	2218449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6601	NC_014334	AATT	2	8	2218490	2218497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_014334	TAA	2	6	2218508	2218513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_014334	CA	3	6	2218518	2218523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6604	NC_014334	A	7	7	2218557	2218563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_014334	AGTG	2	8	2218571	2218578	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_014334	TCC	2	6	2219306	2219311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6607	NC_014334	CCT	2	6	2219830	2219835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6608	NC_014334	ATG	2	6	2219854	2219859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_014334	AACA	2	8	2219985	2219992	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6610	NC_014334	TAA	2	6	2220002	2220007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_014334	GTTT	2	8	2220022	2220029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_014334	GCG	2	6	2220053	2220058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_014334	CCA	2	6	2222786	2222791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6614	NC_014334	ATG	2	6	2222844	2222849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_014334	GTT	2	6	2222852	2222857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_014334	CTC	2	6	2226400	2226405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6617	NC_014334	CCT	2	6	2228669	2228674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_014334	TAACAA	2	12	2228725	2228736	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6619	NC_014334	TGG	2	6	2228756	2228761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_014334	A	6	6	2228804	2228809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_014334	CGA	2	6	2228831	2228836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_014334	TCC	2	6	2229303	2229308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_014334	CAG	2	6	2229326	2229331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_014334	A	6	6	2230777	2230782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_014334	A	6	6	2230823	2230828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_014334	TTC	2	6	2231262	2231267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_014334	TTCA	2	8	2231281	2231288	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6628	NC_014334	AAT	2	6	2231295	2231300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_014334	AAC	2	6	2231435	2231440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6630	NC_014334	TGT	2	6	2231465	2231470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_014334	CAAT	2	8	2231535	2231542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6632	NC_014334	TCC	2	6	2234535	2234540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6633	NC_014334	TA	3	6	2234581	2234586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6634	NC_014334	AAGAA	2	10	2234602	2234611	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6635	NC_014334	A	6	6	2234619	2234624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6636	NC_014334	AGTT	2	8	2235639	2235646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6898	NC_014334	CAT	2	6	2309515	2309520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6902	NC_014334	TG	3	6	2310433	2310438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6931	NC_014334	CTG	2	6	2317454	2317459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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