MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014334	TAAA	2	8	2004319	2004326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_014334	CTCA	2	8	2004336	2004343	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_014334	TTG	2	6	2004352	2004357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_014334	GTT	2	6	2004387	2004392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_014334	G	7	7	2004422	2004428	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_014334	AGA	2	6	2005121	2005126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_014334	TC	3	6	2005223	2005228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_014334	GCA	2	6	2005256	2005261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_014334	A	6	6	2005404	2005409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_014334	TC	3	6	2006789	2006794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_014334	CTT	2	6	2006795	2006800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_014334	GCA	2	6	2006811	2006816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_014334	CAG	2	6	2006885	2006890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_014334	ATC	2	6	2006936	2006941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_014334	CGT	2	6	2006992	2006997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_014334	T	6	6	2006997	2007002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_014334	GAT	2	6	2007073	2007078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_014334	TAT	2	6	2007082	2007087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_014334	CGC	2	6	2007757	2007762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_014334	AATTT	2	10	2008610	2008619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_014334	TGT	2	6	2008623	2008628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_014334	CAT	2	6	2008634	2008639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_014334	TTA	2	6	2008772	2008777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_014334	TTC	2	6	2013434	2013439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_014334	CGC	2	6	2020378	2020383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_014334	CTC	2	6	2024042	2024047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_014334	TCT	2	6	2025272	2025277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_014334	TTA	2	6	2025341	2025346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_014334	CCTA	2	8	2025439	2025446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_014334	TA	3	6	2025487	2025492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_014334	CAC	2	6	2025497	2025502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_014334	CGT	2	6	2026791	2026796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_014334	GAT	2	6	2026865	2026870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_014334	AAT	2	6	2026919	2026924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_014334	ATC	2	6	2026930	2026935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_014334	AAT	2	6	2026938	2026943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_014334	AGA	2	6	2026963	2026968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_014334	T	6	6	2026972	2026977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_014334	AGA	2	6	2026990	2026995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_014334	ACA	2	6	2027068	2027073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_014334	TGT	2	6	2027096	2027101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_014334	TTA	2	6	2027299	2027304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014334	TCC	2	6	2030947	2030952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_014334	T	6	6	2032100	2032105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_014334	A	6	6	2032118	2032123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_014334	ACC	2	6	2033645	2033650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_014334	CAT	2	6	2033670	2033675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_014334	AT	3	6	2033674	2033679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_014334	ACC	2	6	2033759	2033764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_014334	GTG	2	6	2033784	2033789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_014334	GTG	2	6	2033805	2033810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_014334	GCAG	2	8	2033875	2033882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_014334	CAC	2	6	2033905	2033910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_014334	CGC	2	6	2033920	2033925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_014334	AGAT	2	8	2033962	2033969	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_014334	CAAC	2	8	2033986	2033993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_014334	A	6	6	2034005	2034010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_014334	T	6	6	2034068	2034073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_014334	GGA	2	6	2034079	2034084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_014334	ATC	2	6	2034214	2034219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_014334	T	6	6	2035139	2035144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_014334	AAG	2	6	2036386	2036391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_014334	A	6	6	2036416	2036421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_014334	CCG	2	6	2036424	2036429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_014334	GT	3	6	2036442	2036447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_014334	TGC	2	6	2037255	2037260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_014334	GAA	2	6	2037307	2037312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_014334	CAAT	2	8	2037338	2037345	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_014334	GCGTC	2	10	2037353	2037362	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6070	NC_014334	TCA	2	6	2037371	2037376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_014334	TCCT	2	8	2038210	2038217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_014334	CA	3	6	2039696	2039701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_014334	CCT	2	6	2040169	2040174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_014334	TCC	2	6	2041958	2041963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_014334	CCT	2	6	2043630	2043635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_014334	CAG	2	6	2044949	2044954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_014334	CTGCGA	2	12	2044977	2044988	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_014334	CTT	2	6	2045983	2045988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_014334	A	7	7	2046487	2046493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_014334	CCT	2	6	2046955	2046960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_014334	CTTT	2	8	2047003	2047010	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6082	NC_014334	T	6	6	2047165	2047170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_014334	AACTA	2	10	2047293	2047302	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6084	NC_014334	T	6	6	2047348	2047353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_014334	TAT	2	6	2047359	2047364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_014334	CAA	2	6	2048569	2048574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_014334	T	6	6	2049813	2049818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_014334	TTA	2	6	2049840	2049845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_014334	GTG	2	6	2049944	2049949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_014334	CA	3	6	2050003	2050008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_014334	A	8	8	2050008	2050015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_014334	T	7	7	2050048	2050054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_014334	TGCT	2	8	2050266	2050273	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6094	NC_014334	CAG	2	6	2050303	2050308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_014334	TTAC	2	8	2050340	2050347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6096	NC_014334	TGC	2	6	2051177	2051182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_014334	CCG	2	6	2051221	2051226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_014334	CAAA	2	8	2051289	2051296	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6099	NC_014334	TCA	2	6	2051369	2051374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_014334	A	7	7	2052186	2052192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_014334	TGC	2	6	2052210	2052215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_014334	T	7	7	2052229	2052235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_014334	CCTT	2	8	2053292	2053299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_014334	T	6	6	2053304	2053309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_014334	GAC	2	6	2053332	2053337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_014334	CTT	2	6	2053350	2053355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_014334	ACA	2	6	2053362	2053367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_014334	T	6	6	2053395	2053400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_014334	T	6	6	2054587	2054592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_014334	GTC	2	6	2054698	2054703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_014334	AG	3	6	2054726	2054731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_014334	TC	3	6	2054822	2054827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_014334	GAC	2	6	2054852	2054857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_014334	TTAG	2	8	2055548	2055555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_014334	GTTA	2	8	2055593	2055600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_014334	CTAC	2	8	2055614	2055621	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6117	NC_014334	TAGT	2	8	2057440	2057447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_014334	TA	3	6	2057452	2057457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_014334	CTAA	2	8	2057459	2057466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_014334	CAA	3	9	2057502	2057510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_014334	AAC	2	6	2058186	2058191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_014334	CCAA	2	8	2058193	2058200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_014334	CAAA	2	8	2058210	2058217	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_014334	GAC	2	6	2058220	2058225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_014334	TCT	2	6	2059016	2059021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_014334	TTG	2	6	2059097	2059102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_014334	ACG	2	6	2059115	2059120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_014334	T	6	6	2059435	2059440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_014334	CATA	2	8	2059490	2059497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6130	NC_014334	T	7	7	2060676	2060682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_014334	GTC	2	6	2060684	2060689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_014334	A	7	7	2062901	2062907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_014334	TCGC	2	8	2062918	2062925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6265	NC_014334	CTC	3	9	2097785	2097793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6384	NC_014334	A	6	6	2136595	2136600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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