MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 chromosome

Total Repeats: 5350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014136	AT	3	6	1837277	1837282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014136	GAAA	2	8	1837288	1837295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_014136	CAA	2	6	1838099	1838104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_014136	ATG	2	6	1838124	1838129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_014136	GTTTC	2	10	1844732	1844741	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5006	NC_014136	TAT	2	6	1845489	1845494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014136	AAT	2	6	1845499	1845504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_014136	A	7	7	1848259	1848265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014136	A	6	6	1848325	1848330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014136	A	6	6	1848347	1848352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_014136	GTTT	2	8	1848425	1848432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_014136	T	6	6	1848780	1848785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014136	CA	3	6	1848795	1848800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_014136	T	7	7	1848802	1848808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_014136	T	6	6	1848820	1848825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014136	AT	4	8	1849533	1849540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014136	CAT	2	6	1849568	1849573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_014136	TAT	3	9	1850024	1850032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_014136	T	6	6	1850044	1850049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_014136	ATA	2	6	1850073	1850078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_014136	ATA	2	6	1850093	1850098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014136	TTTG	2	8	1850408	1850415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_014136	ATT	2	6	1850422	1850427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_014136	GATT	2	8	1850498	1850505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_014136	ACC	2	6	1850594	1850599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_014136	TGA	2	6	1850600	1850605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_014136	GT	3	6	1850614	1850619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_014136	T	6	6	1850716	1850721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_014136	T	6	6	1850768	1850773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_014136	T	6	6	1850815	1850820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_014136	TGAA	2	8	1850838	1850845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_014136	CAAA	2	8	1850882	1850889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_014136	CAA	2	6	1850902	1850907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_014136	GCT	2	6	1850973	1850978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_014136	TATCA	2	10	1851013	1851022	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5036	NC_014136	ATT	2	6	1851071	1851076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_014136	T	6	6	1851651	1851656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_014136	GTT	2	6	1852298	1852303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_014136	T	7	7	1853080	1853086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_014136	TAA	2	6	1853144	1853149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014136	ATT	2	6	1853151	1853156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_014136	AAG	2	6	1853165	1853170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_014136	TTAT	2	8	1854745	1854752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014136	TAGT	2	8	1854754	1854761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_014136	TA	4	8	1854774	1854781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_014136	A	6	6	1854803	1854808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_014136	AGGA	2	8	1854817	1854824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_014136	T	6	6	1856783	1856788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_014136	GA	3	6	1856843	1856848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_014136	CCG	2	6	1856864	1856869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_014136	AT	3	6	1856924	1856929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_014136	ATTT	2	8	1856985	1856992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_014136	CTT	3	9	1858090	1858098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_014136	TAA	2	6	1858112	1858117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_014136	TA	3	6	1858133	1858138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_014136	TCC	2	6	1859286	1859291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_014136	CAAC	2	8	1859328	1859335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_014136	A	6	6	1859364	1859369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_014136	AAAAGA	2	12	1859371	1859382	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_014136	ATA	2	6	1859495	1859500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_014136	GAC	2	6	1859503	1859508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_014136	TAA	2	6	1859517	1859522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_014136	TA	3	6	1859557	1859562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014136	TAA	2	6	1859577	1859582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014136	TAT	2	6	1859587	1859592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_014136	ATT	2	6	1859602	1859607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_014136	TTTAA	2	10	1859620	1859629	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_014136	TG	3	6	1860705	1860710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_014136	ATAA	2	8	1860780	1860787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_014136	GA	3	6	1860797	1860802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_014136	ATA	2	6	1861553	1861558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_014136	GTG	2	6	1862970	1862975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_014136	TTGA	2	8	1863020	1863027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_014136	AATA	2	8	1863033	1863040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_014136	AAAT	2	8	1864184	1864191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_014136	AGTA	2	8	1864228	1864235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_014136	AGG	2	6	1864274	1864279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5082	NC_014136	CGG	2	6	1869424	1869429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5085	NC_014136	T	7	7	1869575	1869581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_014136	TAC	2	6	1870234	1870239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5088	NC_014136	AGG	2	6	1871584	1871589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_014136	AGA	2	6	1872801	1872806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_014136	GAA	2	6	1872833	1872838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_014136	TAG	2	6	1872854	1872859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_014136	AAGAA	2	10	1872871	1872880	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_014136	TTTC	2	8	1874232	1874239	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_014136	T	7	7	1874250	1874256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_014136	AAT	2	6	1874337	1874342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_014136	TAA	2	6	1874374	1874379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_014136	TA	3	6	1874676	1874681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_014136	TA	3	6	1874688	1874693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_014136	GTA	2	6	1874697	1874702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_014136	ACA	2	6	1874764	1874769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_014136	CTGA	2	8	1874816	1874823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_014136	T	6	6	1874834	1874839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_014136	ATT	2	6	1874852	1874857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_014136	AT	3	6	1874895	1874900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_014136	T	7	7	1874906	1874912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_014136	ATA	2	6	1874913	1874918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_014136	AT	3	6	1878898	1878903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_014136	AAT	2	6	1878962	1878967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5112	NC_014136	CCT	2	6	1880113	1880118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_014136	T	6	6	1880217	1880222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014136	A	7	7	1880228	1880234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014136	GA	3	6	1880235	1880240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_014136	TA	3	6	1880273	1880278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_014136	CAT	2	6	1880336	1880341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_014136	ATT	2	6	1880343	1880348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_014136	AT	3	6	1881119	1881124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014136	CAA	2	6	1881799	1881804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_014136	CAAA	2	8	1881860	1881867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_014136	A	7	7	1881865	1881871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_014136	TATC	2	8	1881878	1881885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5124	NC_014136	AAC	2	6	1881910	1881915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_014136	GTAAA	2	10	1881966	1881975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_014136	ACAA	2	8	1881980	1881987	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5127	NC_014136	ATA	2	6	1881999	1882004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_014136	AGG	2	6	1882008	1882013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_014136	AGG	2	6	1882963	1882968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_014136	TAA	2	6	1882969	1882974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_014136	TA	3	6	1882985	1882990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_014136	A	7	7	1883029	1883035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_014136	ATTT	2	8	1883418	1883425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_014136	ATAA	2	8	1883440	1883447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5136	NC_014136	AGG	2	6	1883484	1883489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.