MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 6410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014106	GAT	2	6	252919	252924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014106	TACC	2	8	252942	252949	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_014106	CAG	2	6	253050	253055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_014106	AGA	2	6	253085	253090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014106	TAA	2	6	253104	253109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014106	TACAGT	2	12	253146	253157	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1007	NC_014106	TGA	2	6	253161	253166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014106	CAG	2	6	253296	253301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_014106	AGA	2	6	253331	253336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014106	TAA	2	6	253350	253355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014106	TACAGT	2	12	253392	253403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1012	NC_014106	TGA	2	6	253407	253412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014106	CAG	2	6	253542	253547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_014106	AGA	2	6	253577	253582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014106	TAA	2	6	253596	253601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014106	TACAGT	2	12	253638	253649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1017	NC_014106	TGA	2	6	253653	253658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014106	N	590	590	253830	254419	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014106	CAG	2	6	254490	254495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_014106	AGA	2	6	254525	254530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014106	TAA	2	6	254544	254549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014106	TACAGT	2	12	254586	254597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1023	NC_014106	TGA	2	6	254601	254606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014106	CAG	2	6	254736	254741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014106	AGA	2	6	254771	254776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014106	TAA	2	6	254790	254795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014106	TACAGT	2	12	254832	254843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1028	NC_014106	TGA	2	6	254847	254852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014106	AAG	2	6	255019	255024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014106	AAC	2	6	255034	255039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_014106	CAA	2	6	255051	255056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_014106	CAG	2	6	255068	255073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_014106	GGC	2	6	255217	255222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_014106	TGA	3	9	255255	255263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014106	AAG	2	6	255265	255270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014106	AAC	2	6	255280	255285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_014106	TGA	3	9	255501	255509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014106	AAC	2	6	255526	255531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_014106	CAA	2	6	255543	255548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014106	CAG	2	6	255560	255565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_014106	TGA	2	6	255585	255590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014106	TGA	3	9	255747	255755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014106	AAC	2	6	255772	255777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_014106	CAA	2	6	255789	255794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_014106	CAG	2	6	255806	255811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_014106	GAT	2	6	255832	255837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014106	ACC	2	6	255841	255846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_014106	TGA	3	9	255993	256001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014106	AAG	2	6	256015	256020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014106	TAA	2	6	256035	256040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014106	TGA	2	6	256077	256082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014106	ATC	2	6	256144	256149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_014106	GCT	2	6	256150	256155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_014106	CA	3	6	256190	256195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_014106	GCA	2	6	256253	256258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_014106	AAC	2	6	256273	256278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_014106	TAA	2	6	256347	256352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014106	CTA	2	6	256358	256363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_014106	AAG	3	9	256456	256464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014106	AAT	2	6	256475	256480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014106	T	6	6	256490	256495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014106	TG	3	6	256591	256596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014106	AAT	2	6	256627	256632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014106	A	7	7	256706	256712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014106	CTTT	2	8	256780	256787	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_014106	TTAAG	2	10	256824	256833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014106	A	7	7	256849	256855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014106	CAT	2	6	256865	256870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_014106	T	6	6	256897	256902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014106	AATT	2	8	257581	257588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014106	CCT	2	6	257651	257656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_014106	GCG	2	6	257675	257680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_014106	GGA	2	6	257891	257896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014106	CCG	2	6	257904	257909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_014106	AAT	2	6	257930	257935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014106	TTTG	2	8	257947	257954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014106	AGA	2	6	257959	257964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014106	A	6	6	257975	257980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014106	ATA	2	6	258354	258359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014106	CTT	2	6	258428	258433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_014106	CTTA	2	8	258448	258455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_014106	AATT	2	8	258457	258464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_014106	AAGG	2	8	258472	258479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014106	CTT	2	6	261287	261292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_014106	TTTTG	2	10	261296	261305	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014106	AAT	2	6	261315	261320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014106	AAGG	2	8	261324	261331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014106	ATC	2	6	261373	261378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_014106	T	6	6	261383	261388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_014106	T	6	6	261405	261410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014106	GGT	2	6	261440	261445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014106	TTA	2	6	261492	261497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014106	GCG	2	6	261504	261509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_014106	T	6	6	261516	261521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_014106	TGA	2	6	261526	261531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014106	T	6	6	261741	261746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014106	CCT	2	6	263074	263079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_014106	A	7	7	263711	263717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014106	CAC	2	6	263721	263726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_014106	AT	3	6	263779	263784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014106	TTG	2	6	263793	263798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014106	GTA	2	6	263834	263839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014106	GGA	2	6	263864	263869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014106	CCG	2	6	263877	263882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_014106	TTTG	2	8	263919	263926	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014106	A	6	6	263929	263934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014106	A	6	6	263946	263951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014106	T	6	6	264491	264496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014106	CCAT	2	8	264522	264529	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_014106	TTA	2	6	264546	264551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014106	ATTA	2	8	265096	265103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014106	A	6	6	265209	265214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014106	AGG	2	6	266201	266206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014106	T	6	6	269668	269673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014106	TAA	2	6	269707	269712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014106	GTT	2	6	269757	269762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014106	ATT	2	6	269771	269776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014106	ATG	2	6	269830	269835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014106	ATA	2	6	269840	269845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014106	TAC	2	6	269865	269870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_014106	AAG	2	6	269908	269913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014106	TAT	2	6	269932	269937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014106	GATT	2	8	269944	269951	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014106	GGC	2	6	271892	271897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014106	TAA	2	6	271906	271911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014106	A	6	6	271910	271915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014106	AAT	2	6	271921	271926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014106	A	7	7	273551	273557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014106	T	6	6	273583	273588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014106	ATT	2	6	274486	274491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014106	TAT	2	6	274494	274499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014106	TAA	2	6	276257	276262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1134	NC_014106	GCT	2	6	276544	276549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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