MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 6410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014106	CTT	2	6	1440	1445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014106	CTA	4	12	1473	1484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014106	ATTA	2	8	1485	1492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014106	TA	3	6	1491	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014106	TAA	2	6	1502	1507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014106	CA	3	6	1516	1521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014106	GGA	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014106	GTC	2	6	2703	2708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014106	TATT	2	8	2763	2770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014106	T	7	7	2769	2775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014106	A	7	7	2804	2810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014106	TA	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014106	A	7	7	8735	8741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014106	T	6	6	8751	8756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014106	TAA	2	6	8760	8765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014106	A	7	7	8778	8784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014106	T	6	6	8816	8821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014106	AGG	2	6	8904	8909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014106	AGGAA	2	10	9245	9254	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014106	AAAG	2	8	9793	9800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014106	AGGAC	2	10	10070	10079	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014106	T	7	7	10094	10100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014106	TC	3	6	10589	10594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014106	TC	3	6	10604	10609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014106	A	6	6	11589	11594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014106	TAAA	3	12	11640	11651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014106	AAG	2	6	11652	11657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014106	TAA	2	6	11670	11675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014106	ATA	2	6	16965	16970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014106	AAT	2	6	16973	16978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014106	TAA	2	6	17059	17064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014106	GGA	2	6	17078	17083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014106	AAT	2	6	18036	18041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014106	TA	3	6	18086	18091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014106	AT	3	6	18092	18097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014106	GAA	2	6	18123	18128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014106	AGA	2	6	18129	18134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014106	CAA	2	6	19072	19077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014106	TACA	2	8	19085	19092	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014106	T	6	6	19118	19123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014106	AGC	2	6	19136	19141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014106	AAGA	2	8	20110	20117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014106	T	6	6	20131	20136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014106	TTA	2	6	20189	20194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014106	T	6	6	20743	20748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014106	ATTA	2	8	22006	22013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014106	CAA	2	6	22817	22822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014106	TTA	2	6	22823	22828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014106	T	7	7	22875	22881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014106	T	6	6	22886	22891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014106	A	7	7	22893	22899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014106	TAA	2	6	22928	22933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014106	TGT	2	6	22938	22943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014106	GAG	2	6	23004	23009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014106	T	6	6	23074	23079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014106	A	6	6	23087	23092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014106	AGCCT	2	10	23187	23196	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014106	A	6	6	23441	23446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014106	T	7	7	23512	23518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014106	CT	3	6	23560	23565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014106	TAT	2	6	24717	24722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014106	GATA	2	8	24726	24733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014106	AAAC	2	8	24753	24760	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014106	A	6	6	25562	25567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014106	GAT	2	6	25572	25577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014106	T	6	6	26125	26130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014106	A	6	6	26144	26149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014106	A	6	6	26479	26484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014106	TGA	2	6	26495	26500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014106	CAT	2	6	26504	26509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014106	TTA	2	6	26565	26570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014106	ATTTTT	2	12	26604	26615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014106	T	7	7	26611	26617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014106	T	6	6	26629	26634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014106	TATC	2	8	26654	26661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014106	TTATA	2	10	26680	26689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014106	TAA	2	6	26697	26702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014106	ATT	2	6	26710	26715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014106	GAG	2	6	26745	26750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014106	TAGA	2	8	30533	30540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014106	T	6	6	30565	30570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014106	ACT	2	6	30826	30831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014106	TTTA	2	8	31647	31654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014106	TG	3	6	31663	31668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014106	T	6	6	31702	31707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014106	A	6	6	31713	31718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014106	TCA	2	6	31748	31753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014106	AAAT	2	8	33632	33639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014106	A	7	7	33677	33683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014106	ATT	2	6	33715	33720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014106	ATT	2	6	33726	33731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014106	TCTT	2	8	33752	33759	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014106	GGA	2	6	33803	33808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014106	TAC	2	6	35668	35673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014106	TAATA	2	10	35684	35693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014106	A	7	7	37169	37175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014106	CAT	2	6	37185	37190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014106	T	6	6	37217	37222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014106	T	6	6	37254	37259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014106	A	8	8	37337	37344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014106	GAATC	2	10	37345	37354	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014106	GATTC	2	10	37360	37369	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014106	CTTAA	2	10	37400	37409	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014106	T	6	6	37439	37444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014106	TTA	2	6	37476	37481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014106	TAA	2	6	37482	37487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014106	CAAA	2	8	40218	40225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014106	A	6	6	40223	40228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014106	T	6	6	40238	40243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014106	AAAAC	2	10	40256	40265	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014106	AAC	2	6	40359	40364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014106	GATT	2	8	40386	40393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014106	T	6	6	40480	40485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014106	TAT	2	6	42113	42118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014106	A	6	6	42130	42135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014106	TAA	2	6	43067	43072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014106	ATC	2	6	43084	43089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014106	AGAA	2	8	43092	43099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014106	T	6	6	44702	44707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014106	T	6	6	44730	44735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014106	T	7	7	44765	44771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014106	A	6	6	44775	44780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014106	AAAAG	2	10	45665	45674	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014106	T	6	6	45711	45716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014106	CTTT	2	8	46433	46440	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014106	ATATTA	2	12	46472	46483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014106	TTA	2	6	46485	46490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014106	GTA	2	6	46585	46590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014106	TAACAC	2	12	46628	46639	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014106	AACC	2	8	46737	46744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014106	CTT	2	6	46767	46772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014106	TA	3	6	47915	47920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014106	GAAAA	2	10	47958	47967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014106	ATT	2	6	47972	47977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014106	T	6	6	48010	48015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014106	GAAA	2	8	50038	50045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014106	TTA	2	6	50053	50058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014106	A	6	6	50952	50957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014106	TTA	2	6	52044	52049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014106	CAA	2	6	52085	52090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014106	T	7	7	52106	52112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014106	A	6	6	52156	52161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014106	T	6	6	52169	52174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014106	A	7	7	52176	52182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014106	TAT	2	6	52206	52211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014106	ATT	2	6	52248	52253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014106	TA	3	6	52258	52263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014106	GTA	2	6	52280	52285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014106	TA	3	6	52316	52321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014106	TA	3	6	52330	52335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014106	AAAC	2	8	52353	52360	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014106	AAG	2	6	53158	53163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014106	AGCT	2	8	53182	53189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_014106	T	6	6	53193	53198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014106	TA	3	6	53265	53270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014106	TCT	2	6	53326	53331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_014106	TTA	2	6	53362	53367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_014106	A	7	7	53556	53562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_014106	AAG	2	6	54565	54570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_014106	T	6	6	56063	56068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_014106	A	6	6	58927	58932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_014106	AGC	2	6	60081	60086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_014106	A	6	6	61942	61947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_014106	CTT	2	6	73771	73776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_014106	TCA	2	6	73878	73883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_014106	A	6	6	138970	138975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_014106	AAG	2	6	139010	139015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_014106	A	6	6	139101	139106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_014106	GA	3	6	139312	139317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_014106	A	7	7	139327	139333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_014106	TAT	2	6	139774	139779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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