MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 8369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013766	CCT	2	6	228976	228981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_013766	ATA	2	6	229029	229034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_013766	CAA	2	6	229053	229058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_013766	ATA	2	6	229059	229064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013766	CCT	2	6	229077	229082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_013766	TTTA	2	8	229118	229125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013766	TAAC	2	8	229132	229139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_013766	AAAAT	2	10	231064	231073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013766	TAT	3	9	231094	231102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013766	CCT	2	6	231126	231131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_013766	TCTAA	2	10	231159	231168	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
512	NC_013766	TTTG	2	8	231250	231257	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013766	GGTT	2	8	231274	231281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013766	ATT	2	6	231309	231314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013766	TTGTA	2	10	231380	231389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013766	CAAA	2	8	231437	231444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_013766	T	7	7	232430	232436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013766	T	7	7	232482	232488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013766	TAT	3	9	233626	233634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013766	AGA	2	6	233635	233640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013766	CTT	2	6	234675	234680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013766	T	6	6	235507	235512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013766	TCT	2	6	235576	235581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_013766	T	6	6	235614	235619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013766	TAC	2	6	235635	235640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013766	ATA	2	6	235654	235659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013766	TGA	2	6	235735	235740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013766	AC	3	6	235756	235761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_013766	AGG	2	6	235832	235837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013766	AT	3	6	236159	236164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013766	AGG	2	6	236174	236179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013766	AGG	2	6	236829	236834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013766	TAAA	2	8	237763	237770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013766	GAG	2	6	237777	237782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013766	GAG	2	6	238996	239001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013766	AGG	2	6	240658	240663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013766	AGG	2	6	241002	241007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013766	AGG	2	6	241406	241411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013766	AGGA	2	8	241741	241748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013766	TAG	2	6	242312	242317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013766	AAGG	2	8	242526	242533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013766	TAT	2	6	242538	242543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013766	AGG	2	6	242961	242966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013766	AGG	2	6	243916	243921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013766	ATT	2	6	244639	244644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013766	AGG	3	9	244670	244678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013766	TAA	2	6	246464	246469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013766	GTA	2	6	247186	247191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013766	ATG	2	6	247235	247240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013766	GA	3	6	247244	247249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013766	ATC	2	6	247261	247266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_013766	ACCTG	2	10	247286	247295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
553	NC_013766	TTC	2	6	247325	247330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_013766	T	7	7	247425	247431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013766	AAG	2	6	247495	247500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013766	TA	3	6	247755	247760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013766	TAA	2	6	247813	247818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013766	AGG	2	6	247822	247827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013766	AGG	2	6	247952	247957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013766	AGG	2	6	248341	248346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013766	TAGT	2	8	248347	248354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013766	TAG	2	6	248768	248773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013766	AG	3	6	248800	248805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013766	AGG	2	6	248840	248845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013766	AGG	2	6	249804	249809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013766	T	7	7	250331	250337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013766	AGG	2	6	250419	250424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013766	AT	3	6	253259	253264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013766	GGAT	2	8	253311	253318	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013766	TAA	2	6	253329	253334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013766	AATG	2	8	253337	253344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013766	T	7	7	256611	256617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013766	TAT	2	6	256651	256656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013766	GTT	2	6	256696	256701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013766	ATTT	2	8	256774	256781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013766	AGG	2	6	256782	256787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013766	AGG	2	6	257240	257245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013766	T	7	7	257681	257687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013766	TA	3	6	257700	257705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013766	CTATT	2	10	257743	257752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
581	NC_013766	CAAA	2	8	257756	257763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_013766	A	6	6	257761	257766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013766	T	6	6	257779	257784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013766	TTAA	2	8	257799	257806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013766	GTTTT	2	10	257825	257834	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013766	T	8	8	257831	257838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013766	TAT	2	6	258756	258761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013766	T	6	6	258778	258783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013766	A	6	6	258784	258789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013766	TTA	2	6	258808	258813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013766	AGTT	2	8	258818	258825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013766	AG	3	6	258928	258933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013766	A	7	7	258957	258963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013766	ATTTTT	2	12	258972	258983	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013766	TAAT	2	8	259084	259091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013766	A	7	7	259102	259108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013766	ACG	2	6	259161	259166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_013766	AAATA	2	10	259174	259183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013766	ATT	2	6	259220	259225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_013766	AG	3	6	259328	259333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013766	T	6	6	259334	259339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013766	A	7	7	259348	259354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013766	CCTTG	2	10	259367	259376	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
606	NC_013766	AACGA	2	10	259413	259422	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
607	NC_013766	AGG	2	6	259864	259869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013766	A	7	7	260733	260739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013766	T	7	7	260762	260768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013766	TA	3	6	262317	262322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013766	TAT	2	6	262333	262338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013766	A	6	6	262340	262345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013766	TGA	2	6	262462	262467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013766	A	7	7	262479	262485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013766	A	6	6	262499	262504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013766	TAA	2	6	262521	262526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_013766	CATT	2	8	262541	262548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_013766	AGA	3	9	263709	263717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013766	CAA	2	6	263781	263786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013766	TAATT	2	10	263797	263806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013766	ATTCAA	2	12	263859	263870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
622	NC_013766	AG	3	6	263883	263888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_013766	GGC	2	6	263915	263920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013766	CGAA	2	8	263940	263947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_013766	GGA	2	6	263949	263954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013766	CCTG	2	8	264007	264014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
627	NC_013766	GCA	2	6	264236	264241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013766	CGC	2	6	264283	264288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_013766	GAA	2	6	264295	264300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013766	TGT	2	6	264322	264327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013766	AGA	2	6	264331	264336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013766	CAG	2	6	264404	264409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_013766	GC	4	8	264460	264467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_013766	AGA	2	6	264545	264550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013766	GGA	2	6	264595	264600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_013766	CT	3	6	264620	264625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_013766	TGC	2	6	264740	264745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_013766	GAA	2	6	264859	264864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_013766	GGT	2	6	264933	264938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_013766	TCGTG	2	10	264956	264965	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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