MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 8369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013766	TG	3	6	13	18	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013766	A	7	7	157	163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013766	AAAT	2	8	167	174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013766	TC	3	6	677	682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013766	ATATG	2	10	690	699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013766	A	6	6	745	750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013766	T	10	10	983	992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013766	AAG	2	6	1033	1038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013766	T	7	7	2964	2970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013766	AGG	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013766	GGTTC	2	10	3000	3009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013766	AGG	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013766	TGA	2	6	11285	11290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013766	AAAG	2	8	11292	11299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013766	T	7	7	11351	11357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013766	T	7	7	11936	11942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013766	TTGT	2	8	11993	12000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013766	T	6	6	14083	14088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013766	CCA	2	6	14125	14130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_013766	ATC	2	6	15263	15268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013766	TTC	2	6	15401	15406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013766	AGG	2	6	15427	15432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013766	GAGT	2	8	18441	18448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013766	T	6	6	18458	18463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013766	AGG	2	6	18493	18498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013766	ATA	2	6	21300	21305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013766	CGGA	2	8	22126	22133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013766	A	6	6	27167	27172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013766	AT	3	6	27188	27193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013766	T	6	6	27616	27621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013766	TTAC	2	8	28267	28274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013766	TATT	2	8	28289	28296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013766	T	6	6	28367	28372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013766	AGC	2	6	28787	28792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013766	GTAT	2	8	28831	28838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013766	GTT	2	6	28843	28848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013766	ATT	2	6	28855	28860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013766	AGA	2	6	30499	30504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013766	T	6	6	30541	30546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013766	ATTT	2	8	30571	30578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013766	TG	3	6	30682	30687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013766	T	8	8	30704	30711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013766	AGAAC	2	10	30720	30729	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013766	TAT	2	6	30783	30788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013766	TGA	2	6	30822	30827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013766	GA	3	6	30831	30836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013766	ATT	2	6	33116	33121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013766	AAT	2	6	33130	33135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013766	GTT	2	6	33155	33160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013766	AGG	2	6	33191	33196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013766	T	6	6	34814	34819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013766	TAT	2	6	37412	37417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013766	TTTA	2	8	37425	37432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013766	TGA	2	6	37492	37497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013766	A	6	6	37511	37516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013766	ATA	2	6	37544	37549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013766	T	7	7	39957	39963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013766	AGA	2	6	40011	40016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013766	A	6	6	40039	40044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013766	CTT	2	6	40050	40055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013766	GTTT	2	8	40059	40066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013766	T	9	9	40064	40072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013766	ATA	2	6	40073	40078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013766	CAG	2	6	40110	40115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013766	AGA	2	6	44002	44007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013766	AGG	2	6	45223	45228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013766	TCC	2	6	45249	45254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013766	T	6	6	45255	45260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013766	AGTT	2	8	46019	46026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013766	T	6	6	46029	46034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013766	T	6	6	46099	46104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013766	TAA	2	6	46116	46121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013766	AG	3	6	46689	46694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013766	CTC	2	6	48868	48873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013766	TTA	2	6	49031	49036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013766	TAA	2	6	49058	49063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013766	GTT	2	6	49124	49129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013766	T	6	6	50594	50599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013766	TAA	2	6	52523	52528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013766	AAT	2	6	52588	52593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013766	T	6	6	52598	52603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013766	TTAA	2	8	52611	52618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013766	AGA	3	9	52637	52645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013766	A	7	7	53846	53852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013766	A	6	6	53856	53861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013766	A	6	6	53868	53873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013766	TA	3	6	53878	53883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013766	AAG	2	6	53905	53910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013766	ACA	2	6	53915	53920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013766	A	8	8	54359	54366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013766	ACA	2	6	54420	54425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013766	ATACTT	2	12	56767	56778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013766	AAT	2	6	56782	56787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013766	A	6	6	56881	56886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013766	TTTTTA	2	12	57634	57645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013766	T	6	6	57658	57663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013766	ATTGAT	2	12	57717	57728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013766	AGG	2	6	57793	57798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013766	CA	3	6	59531	59536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013766	CTT	2	6	60977	60982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013766	AGG	2	6	61013	61018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013766	GAA	2	6	62159	62164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013766	ATAG	2	8	63865	63872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013766	AGC	2	6	63887	63892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013766	TCTA	2	8	63893	63900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013766	T	6	6	63901	63906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013766	ATA	2	6	63985	63990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013766	AGGA	2	8	64019	64026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013766	T	6	6	65224	65229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013766	A	6	6	65236	65241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013766	AAC	2	6	65246	65251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013766	GATTT	2	10	65264	65273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013766	A	6	6	65315	65320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013766	AGG	2	6	65348	65353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013766	GGTT	2	8	66137	66144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013766	T	7	7	66147	66153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013766	ATTT	2	8	66237	66244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013766	TAGAA	2	10	66279	66288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013766	T	6	6	68193	68198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013766	TAA	2	6	68212	68217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013766	T	7	7	68247	68253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013766	AGG	2	6	69196	69201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013766	T	6	6	69228	69233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013766	TC	3	6	72186	72191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013766	TC	3	6	72232	72237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013766	CTT	2	6	72239	72244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013766	TAA	2	6	72266	72271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013766	TTA	2	6	72272	72277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013766	TAAA	2	8	72278	72285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013766	TA	3	6	72310	72315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013766	T	6	6	73818	73823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013766	CTA	2	6	73904	73909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013766	AATT	2	8	73968	73975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013766	GAG	2	6	73981	73986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013766	T	6	6	75931	75936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013766	AG	3	6	75937	75942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013766	T	7	7	75958	75964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013766	ATTT	2	8	76003	76010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013766	AAAG	2	8	76016	76023	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013766	AGG	2	6	76047	76052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013766	A	6	6	76056	76061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013766	AGG	2	6	77690	77695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013766	AGAA	2	8	77696	77703	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013766	T	6	6	80328	80333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013766	GGTG	2	8	80334	80341	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013766	TTTG	2	8	80346	80353	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013766	A	6	6	80380	80385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013766	TA	4	8	80433	80440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013766	GT	3	6	81576	81581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013766	T	8	8	81592	81599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013766	AT	4	8	81704	81711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013766	TAAT	2	8	81737	81744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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