MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 5379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013504	TA	3	6	1403113	1403118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_013504	CCA	2	6	1403224	1403229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_013504	AC	3	6	1403278	1403283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_013504	TGA	2	6	1403637	1403642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_013504	TAG	2	6	1403644	1403649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_013504	TTG	2	6	1403660	1403665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_013504	AAAAT	2	10	1403689	1403698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_013504	GAA	2	6	1403712	1403717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_013504	TTAT	2	8	1403723	1403730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_013504	T	6	6	1403780	1403785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_013504	TTC	2	6	1403790	1403795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_013504	CTG	2	6	1403852	1403857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_013504	TAT	2	6	1403858	1403863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_013504	TTC	2	6	1403908	1403913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_013504	CACT	2	8	1405087	1405094	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_013504	T	6	6	1405127	1405132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_013504	GCAG	2	8	1405214	1405221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4018	NC_013504	A	6	6	1407247	1407252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013504	ACT	2	6	1407260	1407265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_013504	A	7	7	1407268	1407274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_013504	TAT	2	6	1407294	1407299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_013504	AAT	2	6	1408082	1408087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_013504	A	7	7	1408088	1408094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_013504	ATT	2	6	1408196	1408201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_013504	CATA	2	8	1408239	1408246	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_013504	GAAA	2	8	1408406	1408413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_013504	A	7	7	1408411	1408417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_013504	ATC	2	6	1408428	1408433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_013504	GCC	2	6	1408441	1408446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_013504	GAG	2	6	1408505	1408510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_013504	CTA	2	6	1408567	1408572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_013504	ACT	2	6	1408645	1408650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_013504	ATAGA	2	10	1408683	1408692	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_013504	TTG	2	6	1408704	1408709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_013504	AAT	2	6	1408723	1408728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_013504	A	6	6	1408731	1408736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_013504	TTA	2	6	1408754	1408759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_013504	TAC	2	6	1408762	1408767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_013504	TAAC	2	8	1408940	1408947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_013504	TCT	2	6	1408964	1408969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_013504	T	6	6	1409051	1409056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_013504	TCT	2	6	1409123	1409128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_013504	T	6	6	1409228	1409233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_013504	AAGT	2	8	1409277	1409284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_013504	TGC	2	6	1409344	1409349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_013504	TGA	2	6	1409401	1409406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_013504	TA	3	6	1409432	1409437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_013504	AGA	2	6	1409549	1409554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_013504	CTT	2	6	1409575	1409580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_013504	A	6	6	1409611	1409616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_013504	AC	3	6	1409764	1409769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_013504	AAC	2	6	1409816	1409821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_013504	TCTT	2	8	1409887	1409894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_013504	GGC	2	6	1409908	1409913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_013504	TCA	2	6	1409915	1409920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_013504	TGA	2	6	1409925	1409930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_013504	TTGA	2	8	1409947	1409954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_013504	A	6	6	1409954	1409959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_013504	T	6	6	1410063	1410068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_013504	TAA	2	6	1410362	1410367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_013504	CAC	2	6	1410520	1410525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_013504	CAA	2	6	1410564	1410569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_013504	A	6	6	1410568	1410573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_013504	TATC	2	8	1410577	1410584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_013504	T	6	6	1410614	1410619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_013504	A	6	6	1412049	1412054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_013504	ATTTTT	2	12	1413456	1413467	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_013504	CTAT	2	8	1413475	1413482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_013504	TTA	2	6	1413513	1413518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_013504	TAA	2	6	1413526	1413531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_013504	T	7	7	1413545	1413551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_013504	AAT	2	6	1413572	1413577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_013504	AGT	2	6	1413587	1413592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_013504	AG	3	6	1413609	1413614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_013504	TGG	2	6	1413616	1413621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_013504	GGT	2	6	1413732	1413737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_013504	T	6	6	1413777	1413782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_013504	GGA	2	6	1413786	1413791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_013504	TTCAT	2	10	1415174	1415183	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4082	NC_013504	T	6	6	1415226	1415231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_013504	ATT	2	6	1415259	1415264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_013504	A	7	7	1415272	1415278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_013504	AGG	2	6	1415287	1415292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_013504	TAC	2	6	1419299	1419304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_013504	TAA	2	6	1419325	1419330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_013504	AG	4	8	1419333	1419340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_013504	CTA	2	6	1420081	1420086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_013504	TAG	2	6	1420111	1420116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_013504	T	6	6	1420118	1420123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_013504	ATT	2	6	1420131	1420136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_013504	ATATT	2	10	1420944	1420953	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_013504	TTAT	2	8	1421009	1421016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_013504	GTA	2	6	1421029	1421034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_013504	A	6	6	1421034	1421039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_013504	TAT	2	6	1421047	1421052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_013504	ATAAA	2	10	1421053	1421062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_013504	A	7	7	1421101	1421107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_013504	ATT	2	6	1421153	1421158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_013504	TCT	2	6	1422221	1422226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_013504	CAA	2	6	1422228	1422233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_013504	TAA	2	6	1422244	1422249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_013504	ATT	2	6	1422250	1422255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_013504	CTT	2	6	1427539	1427544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_013504	CT	3	6	1429568	1429573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_013504	CTT	2	6	1431844	1431849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_013504	TAT	2	6	1431887	1431892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_013504	A	6	6	1431896	1431901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_013504	TTA	2	6	1433198	1433203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_013504	A	7	7	1433219	1433225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_013504	GTG	2	6	1433256	1433261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_013504	ATA	2	6	1433355	1433360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_013504	AT	3	6	1437186	1437191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_013504	ATT	2	6	1437196	1437201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_013504	ATT	2	6	1437210	1437215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_013504	TAT	2	6	1437216	1437221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_013504	CTA	2	6	1437225	1437230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_013504	A	7	7	1437238	1437244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_013504	T	7	7	1437263	1437269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_013504	ATT	2	6	1437271	1437276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_013504	GTT	2	6	1440056	1440061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_013504	CT	3	6	1440088	1440093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_013504	ATC	2	6	1440154	1440159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_013504	TAG	2	6	1440165	1440170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_013504	TCC	2	6	1442175	1442180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_013504	TCA	2	6	1444513	1444518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_013504	ATAA	2	8	1444524	1444531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_013504	T	7	7	1444532	1444538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_013504	TAT	2	6	1444548	1444553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_013504	TATT	2	8	1448490	1448497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4133	NC_013504	T	6	6	1448545	1448550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4263	NC_013504	CATA	2	8	1476649	1476656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4264	NC_013504	CTC	2	6	1476735	1476740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4267	NC_013504	CGA	2	6	1476864	1476869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4268	NC_013504	ACC	2	6	1476979	1476984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4269	NC_013504	AGG	2	6	1477115	1477120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4271	NC_013504	GTA	2	6	1477203	1477208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4273	NC_013504	TAT	2	6	1477357	1477362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4280	NC_013504	CAT	2	6	1477797	1477802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4289	NC_013504	TGG	2	6	1478276	1478281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4291	NC_013504	TCC	2	6	1478625	1478630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4296	NC_013504	CT	3	6	1479034	1479039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4297	NC_013504	TCGC	2	8	1479137	1479144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4299	NC_013504	CTTC	2	8	1479211	1479218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4302	NC_013504	TC	4	8	1479402	1479409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4304	NC_013504	T	7	7	1479451	1479457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4382	NC_013504	T	7	7	1488319	1488325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4387	NC_013504	TTTAT	2	10	1488842	1488851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4395	NC_013504	TCAA	2	8	1489090	1489097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4396	NC_013504	GAA	2	6	1489110	1489115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4399	NC_013504	A	7	7	1489316	1489322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4400	NC_013504	GT	3	6	1489342	1489347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4401	NC_013504	GA	3	6	1489367	1489372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4402	NC_013504	CCTTT	2	10	1489524	1489533	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4403	NC_013504	CTT	2	6	1489609	1489614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4404	NC_013504	CCG	2	6	1489644	1489649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4432	NC_013504	ACG	2	6	1491234	1491239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4462	NC_013504	CT	3	6	1493484	1493489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4463	NC_013504	TCGC	2	8	1493587	1493594	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4472	NC_013504	CCTT	2	8	1494046	1494053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4498	NC_013504	GTT	2	6	1495422	1495427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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