MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 5379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013504	ACG	2	6	1658778	1658783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_013504	ACG	2	6	1658804	1658809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_013504	CGA	2	6	1658884	1658889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_013504	ACC	2	6	1658999	1659004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_013504	AGG	2	6	1659135	1659140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_013504	TCC	2	6	1659175	1659180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_013504	GTA	2	6	1659223	1659228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013504	CCTA	2	8	1659275	1659282	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_013504	TAT	2	6	1659377	1659382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_013504	TC	3	6	1659395	1659400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_013504	GCC	2	6	1659492	1659497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_013504	TTCAA	2	10	1659510	1659519	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5013	NC_013504	CTC	2	6	1659540	1659545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_013504	GTT	2	6	1659626	1659631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_013504	TC	3	6	1659721	1659726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_013504	CAT	2	6	1659817	1659822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_013504	T	6	6	1659890	1659895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_013504	CCT	2	6	1659938	1659943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_013504	CCT	2	6	1659949	1659954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_013504	TGT	2	6	1659994	1659999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_013504	CCTTA	2	10	1660020	1660029	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5022	NC_013504	CGG	2	6	1660082	1660087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_013504	CGC	2	6	1660168	1660173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_013504	ATATA	2	10	1660198	1660207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013504	TGG	2	6	1660296	1660301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_013504	GA	3	6	1660559	1660564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_013504	TCC	2	6	1660645	1660650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_013504	GCTCCG	2	12	1660747	1660758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_013504	ACT	2	6	1660843	1660848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_013504	TAGT	2	8	1660937	1660944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013504	TC	3	6	1661021	1661026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_013504	CT	3	6	1661054	1661059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_013504	TCGC	2	8	1661157	1661164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_013504	TTTC	2	8	1661185	1661192	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5035	NC_013504	CTTC	2	8	1661231	1661238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_013504	ATA	2	6	1661259	1661264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_013504	CTTA	2	8	1661310	1661317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_013504	TC	4	8	1661422	1661429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_013504	T	7	7	1661452	1661458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_013504	T	6	6	1661471	1661476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_013504	CCT	2	6	1661559	1661564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_013504	CAT	2	6	1661604	1661609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_013504	T	7	7	1661626	1661632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013504	GCTTG	2	10	1661721	1661730	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5045	NC_013504	GTT	2	6	1661739	1661744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_013504	CAT	2	6	1661834	1661839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_013504	CCTT	2	8	1661846	1661853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_013504	AGG	2	6	1661858	1661863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_013504	ATC	2	6	1661914	1661919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_013504	GT	3	6	1662001	1662006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_013504	GT	3	6	1662170	1662175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_013504	ATG	2	6	1662195	1662200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_013504	TCC	2	6	1662221	1662226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_013504	ATG	2	6	1662265	1662270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_013504	CACGA	2	10	1662320	1662329	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5056	NC_013504	GAC	2	6	1662333	1662338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_013504	CAC	2	6	1662346	1662351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_013504	TTC	2	6	1662421	1662426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_013504	GCA	2	6	1662540	1662545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_013504	AG	3	6	1662660	1662665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_013504	TTC	2	6	1662684	1662689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_013504	AT	3	6	1662691	1662696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_013504	CTC	2	6	1662731	1662736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_013504	GCT	2	6	1662875	1662880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_013504	TAC	2	6	1662934	1662939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_013504	TCTT	2	8	1662945	1662952	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_013504	CTT	2	6	1662984	1662989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_013504	CTG	2	6	1663043	1663048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_013504	TC	3	6	1663098	1663103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_013504	CAT	2	6	1663116	1663121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_013504	TTACC	2	10	1663137	1663146	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5072	NC_013504	TCCA	2	8	1663168	1663175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_013504	GTT	2	6	1663222	1663227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_013504	CCG	2	6	1663301	1663306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_013504	ATC	2	6	1663345	1663350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_013504	GCTC	2	8	1663358	1663365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_013504	CGC	2	6	1663385	1663390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_013504	CTTT	2	8	1663466	1663473	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_013504	TTGC	2	8	1663491	1663498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_013504	TTTG	2	8	1663513	1663520	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_013504	TAC	2	6	1663572	1663577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_013504	TATAT	2	10	1663598	1663607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_013504	T	6	6	1663634	1663639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_013504	TC	4	8	1663650	1663657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_013504	ATC	2	6	1663679	1663684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_013504	T	7	7	1663705	1663711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_013504	T	6	6	1663716	1663721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_013504	T	7	7	1663801	1663807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_013504	A	8	8	1663816	1663823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_013504	ATTT	2	8	1665260	1665267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_013504	ATT	2	6	1665271	1665276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_013504	AATTAA	2	12	1665308	1665319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_013504	A	7	7	1665322	1665328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_013504	T	6	6	1665352	1665357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_013504	AC	3	6	1667492	1667497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_013504	ACT	2	6	1667544	1667549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_013504	T	6	6	1667554	1667559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_013504	ATT	2	6	1667591	1667596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_013504	AATAA	2	10	1667629	1667638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_013504	TAA	2	6	1667651	1667656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_013504	TTAT	2	8	1667709	1667716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_013504	TTA	2	6	1667719	1667724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_013504	AAT	2	6	1667732	1667737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_013504	TAA	2	6	1669976	1669981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_013504	TAAAT	2	10	1669996	1670005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_013504	T	6	6	1670024	1670029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_013504	CTT	2	6	1670057	1670062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_013504	ATG	2	6	1670094	1670099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_013504	TTAA	2	8	1670456	1670463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_013504	AGG	2	6	1670465	1670470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_013504	T	6	6	1671681	1671686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_013504	A	7	7	1671703	1671709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_013504	CCA	2	6	1671718	1671723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_013504	CA	3	6	1671740	1671745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_013504	CAG	2	6	1671839	1671844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_013504	A	7	7	1671884	1671890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_013504	ATT	2	6	1671903	1671908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_013504	TTA	2	6	1672731	1672736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_013504	TAA	2	6	1672744	1672749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013504	A	7	7	1672748	1672754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_013504	TAT	2	6	1672768	1672773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_013504	T	6	6	1672778	1672783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013504	TAT	2	6	1672825	1672830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_013504	ATA	2	6	1674425	1674430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_013504	T	6	6	1677358	1677363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_013504	ACA	2	6	1677373	1677378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_013504	TAA	2	6	1678934	1678939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_013504	TTTC	2	8	1679016	1679023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_013504	AT	3	6	1679038	1679043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_013504	GTA	2	6	1679049	1679054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_013504	CTC	2	6	1679116	1679121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_013504	AAT	2	6	1679133	1679138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_013504	TATC	2	8	1679162	1679169	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5134	NC_013504	TCTTT	2	10	1679202	1679211	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5135	NC_013504	ATT	2	6	1679628	1679633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_013504	TAT	2	6	1713311	1713316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_013504	AATG	2	8	1720702	1720709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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