MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 5379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013504	GCTC	2	8	1495558	1495565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_013504	CGC	2	6	1495585	1495590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_013504	CTTT	2	8	1495666	1495673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_013504	TTGC	2	8	1495691	1495698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_013504	TTTG	2	8	1495713	1495720	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_013504	TAC	2	6	1495772	1495777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_013504	TATAT	2	10	1495798	1495807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_013504	T	6	6	1495834	1495839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_013504	TC	4	8	1495850	1495857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_013504	ATC	2	6	1495879	1495884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_013504	T	7	7	1495905	1495911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_013504	T	6	6	1495916	1495921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_013504	T	6	6	1495990	1495995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_013504	A	6	6	1495998	1496003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_013504	T	6	6	1496013	1496018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_013504	A	6	6	1496061	1496066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_013504	TTA	2	6	1496110	1496115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_013504	TCC	2	6	1497434	1497439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_013504	A	7	7	1497453	1497459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_013504	ACC	2	6	1497508	1497513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4521	NC_013504	A	6	6	1497525	1497530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_013504	TACC	2	8	1497573	1497580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_013504	T	6	6	1497604	1497609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_013504	ACCA	2	8	1497620	1497627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_013504	CT	3	6	1497632	1497637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_013504	CCT	2	6	1498810	1498815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_013504	GT	3	6	1498936	1498941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_013504	CTT	2	6	1500612	1500617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_013504	TA	3	6	1500648	1500653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_013504	AT	3	6	1500677	1500682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_013504	A	7	7	1502092	1502098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_013504	TTA	2	6	1503166	1503171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_013504	A	8	8	1503193	1503200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_013504	ATA	3	9	1503929	1503937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_013504	T	6	6	1503938	1503943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_013504	TAT	3	9	1503969	1503977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_013504	TAT	2	6	1504001	1504006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_013504	AGG	2	6	1504033	1504038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_013504	T	7	7	1504896	1504902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_013504	CTTTC	2	10	1508524	1508533	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4541	NC_013504	CTT	2	6	1509110	1509115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_013504	T	6	6	1509114	1509119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_013504	A	6	6	1509194	1509199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_013504	T	6	6	1510195	1510200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_013504	A	6	6	1510221	1510226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_013504	ATT	2	6	1510243	1510248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_013504	T	6	6	1510252	1510257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_013504	TCTTT	2	10	1510265	1510274	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4549	NC_013504	T	7	7	1510310	1510316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_013504	AAT	2	6	1510322	1510327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_013504	ATT	3	9	1510354	1510362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_013504	A	8	8	1511303	1511310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_013504	T	8	8	1511326	1511333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_013504	TTTG	2	8	1512781	1512788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_013504	TTA	2	6	1512801	1512806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_013504	TTG	2	6	1512807	1512812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_013504	AAT	3	9	1512820	1512828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_013504	ATT	2	6	1512836	1512841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_013504	ATCT	2	8	1512876	1512883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4560	NC_013504	G	7	7	1512898	1512904	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_013504	A	7	7	1513291	1513297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_013504	T	6	6	1513325	1513330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_013504	TCC	2	6	1514656	1514661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_013504	ACAA	2	8	1514670	1514677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4565	NC_013504	AAAAT	2	10	1514679	1514688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_013504	ACT	2	6	1518771	1518776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_013504	CAA	2	6	1518823	1518828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_013504	T	6	6	1518840	1518845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_013504	AATA	2	8	1518846	1518853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_013504	T	6	6	1518870	1518875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_013504	T	6	6	1518880	1518885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_013504	ATA	3	9	1518901	1518909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_013504	TA	3	6	1518929	1518934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_013504	AAAATA	2	12	1518935	1518946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_013504	T	6	6	1518969	1518974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_013504	A	7	7	1519031	1519037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_013504	A	6	6	1519063	1519068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_013504	TAAAT	2	10	1520513	1520522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_013504	ATT	2	6	1521400	1521405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_013504	ACGT	2	8	1521427	1521434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_013504	TGCAA	2	10	1521436	1521445	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4582	NC_013504	TAA	2	6	1521447	1521452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_013504	TAA	2	6	1521485	1521490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_013504	AGAA	2	8	1521504	1521511	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_013504	GTAG	2	8	1522348	1522355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_013504	TTC	2	6	1525293	1525298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_013504	A	6	6	1527716	1527721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_013504	A	6	6	1528295	1528300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_013504	ATT	2	6	1528339	1528344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_013504	CTC	2	6	1529124	1529129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_013504	CA	3	6	1529146	1529151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_013504	AT	3	6	1529152	1529157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_013504	A	6	6	1529181	1529186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_013504	TAGTA	2	10	1529198	1529207	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_013504	TAA	2	6	1529210	1529215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_013504	TTC	2	6	1529285	1529290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_013504	TGA	2	6	1529295	1529300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_013504	AACT	2	8	1529309	1529316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4599	NC_013504	TA	3	6	1529320	1529325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_013504	T	7	7	1529326	1529332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_013504	T	6	6	1529359	1529364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_013504	T	6	6	1529390	1529395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_013504	AAAAGA	2	12	1529443	1529454	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_013504	AAC	2	6	1529477	1529482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_013504	CT	3	6	1529522	1529527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_013504	TTA	2	6	1529536	1529541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_013504	A	6	6	1529558	1529563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_013504	TAAT	2	8	1529567	1529574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_013504	A	6	6	1529581	1529586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_013504	T	6	6	1529607	1529612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_013504	TAAT	2	8	1529661	1529668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_013504	T	7	7	1529674	1529680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_013504	AAT	3	9	1530071	1530079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_013504	TA	3	6	1530085	1530090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_013504	CAAAA	2	10	1530112	1530121	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4616	NC_013504	ACT	2	6	1530142	1530147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_013504	TA	4	8	1531008	1531015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_013504	ATA	2	6	1531024	1531029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_013504	TA	3	6	1531028	1531033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_013504	ATT	2	6	1531048	1531053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_013504	AAGT	2	8	1531076	1531083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_013504	ATA	2	6	1531090	1531095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_013504	TTG	3	9	1531156	1531164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_013504	A	6	6	1531173	1531178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_013504	ATT	2	6	1531186	1531191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_013504	TTCA	2	8	1531209	1531216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4627	NC_013504	TTAG	2	8	1531226	1531233	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_013504	T	6	6	1531300	1531305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_013504	ATT	2	6	1532744	1532749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_013504	T	7	7	1532748	1532754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_013504	ACA	2	6	1532772	1532777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_013504	AG	3	6	1532827	1532832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_013504	TAAG	2	8	1532907	1532914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_013504	CGTT	2	8	1532929	1532936	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4635	NC_013504	AATT	2	8	1532978	1532985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4637	NC_013504	TTA	2	6	1533085	1533090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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