MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 5379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013504	TAA	2	6	1370	1375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013504	TTA	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013504	GT	3	6	1423	1428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013504	CTA	3	9	1472	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013504	AT	3	6	1496	1501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013504	TAAA	2	8	1505	1512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013504	AGG	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013504	T	8	8	2705	2712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013504	A	6	6	2801	2806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013504	A	7	7	2840	2846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013504	TAA	2	6	2852	2857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013504	A	6	6	2892	2897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013504	AT	3	6	2915	2920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013504	AGA	2	6	2942	2947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013504	TCT	2	6	2958	2963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013504	GGT	2	6	2964	2969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013504	GAAA	2	8	3034	3041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013504	ATTT	2	8	3086	3093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013504	A	6	6	8703	8708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013504	T	6	6	8717	8722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013504	TAA	3	9	8726	8734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013504	TAA	2	6	8740	8745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013504	A	6	6	8762	8767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013504	T	6	6	8778	8783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013504	TG	3	6	8787	8792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013504	ATT	2	6	8817	8822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013504	AGG	2	6	8868	8873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013504	ATT	2	6	8878	8883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013504	TAA	2	6	10008	10013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013504	T	6	6	10046	10051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013504	TAT	2	6	10056	10061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013504	AAG	2	6	10064	10069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013504	TGCT	2	8	11005	11012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013504	GAT	2	6	11020	11025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013504	AAGC	2	8	11026	11033	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013504	T	6	6	11035	11040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013504	TATAA	2	10	11045	11054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013504	ATG	2	6	11056	11061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013504	TAT	2	6	11067	11072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013504	TGA	2	6	11076	11081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013504	AGGA	2	8	11098	11105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013504	ATTA	2	8	14995	15002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013504	CTATA	2	10	15004	15013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013504	AT	3	6	15957	15962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013504	T	6	6	15993	15998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013504	TAT	2	6	17188	17193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013504	TTTTA	2	10	17194	17203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013504	AGA	2	6	17230	17235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013504	A	6	6	17247	17252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013504	CTT	2	6	17267	17272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013504	TTA	2	6	19352	19357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013504	ATT	2	6	19383	19388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013504	ATA	2	6	19403	19408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013504	AAAAT	2	10	19411	19420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013504	TAAA	2	8	19431	19438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013504	A	6	6	19436	19441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013504	A	6	6	19444	19449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013504	TAA	2	6	19461	19466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013504	AT	3	6	19468	19473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013504	ATAA	2	8	19495	19502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013504	ATG	2	6	19540	19545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013504	A	6	6	19586	19591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013504	T	7	7	19613	19619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013504	AC	3	6	20571	20576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013504	GCT	2	6	20797	20802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013504	TAA	2	6	20807	20812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013504	CAC	2	6	20813	20818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013504	GAA	2	6	20864	20869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013504	AAG	2	6	20935	20940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013504	TGT	2	6	20965	20970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013504	A	7	7	20997	21003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013504	T	6	6	21057	21062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013504	CA	3	6	21076	21081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013504	GAG	2	6	21114	21119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013504	AAG	2	6	21121	21126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013504	ATT	2	6	21199	21204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013504	ATA	2	6	21214	21219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013504	TAAT	2	8	21238	21245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013504	A	6	6	21254	21259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013504	ATC	2	6	21277	21282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013504	ATG	2	6	21348	21353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013504	TTTC	2	8	22211	22218	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013504	ATCA	2	8	22241	22248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013504	GGAA	2	8	22254	22261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013504	A	8	8	22279	22286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013504	TCAT	2	8	22300	22307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013504	AT	3	6	22632	22637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013504	TAA	2	6	22695	22700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013504	CTA	2	6	22738	22743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013504	AAG	2	6	22744	22749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013504	TCA	2	6	22794	22799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013504	AT	3	6	22824	22829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013504	TAAT	2	8	22849	22856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013504	T	6	6	22895	22900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013504	A	6	6	22911	22916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013504	ATT	2	6	22954	22959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013504	T	6	6	22958	22963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013504	T	7	7	22978	22984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013504	GTAGT	2	10	23040	23049	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013504	A	6	6	23060	23065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013504	TTA	2	6	23101	23106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013504	GT	3	6	23112	23117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013504	ATT	2	6	23127	23132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013504	TTA	2	6	23170	23175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013504	T	6	6	27477	27482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013504	TG	3	6	27578	27583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013504	A	6	6	27693	27698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013504	CTTT	2	8	27766	27773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013504	TGA	2	6	27824	27829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013504	ATA	2	6	28218	28223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013504	GATT	2	8	28235	28242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013504	TAC	2	6	28281	28286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013504	TAG	2	6	28291	28296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013504	ATC	2	6	28321	28326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013504	ACT	2	6	28332	28337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013504	AAT	2	6	28364	28369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013504	T	6	6	28393	28398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013504	AAAAG	2	10	28402	28411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013504	C	6	6	28574	28579	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_013504	GATTTA	2	12	28588	28599	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013504	TAG	2	6	28654	28659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013504	GGT	2	6	28682	28687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013504	T	6	6	28694	28699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013504	TAT	2	6	28739	28744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013504	A	7	7	28763	28769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013504	CTTG	2	8	29298	29305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013504	AAT	2	6	29335	29340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013504	CATT	2	8	29346	29353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013504	ATA	3	9	29362	29370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013504	TATTT	2	10	29985	29994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013504	ATT	2	6	30008	30013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013504	GCTAA	2	10	30032	30041	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013504	AGG	2	6	30063	30068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013504	AAT	2	6	31480	31485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013504	AT	3	6	31484	31489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013504	TTATC	2	10	31506	31515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013504	TAAAAT	2	12	31530	31541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013504	GAA	2	6	31581	31586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013504	AT	3	6	33195	33200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013504	TTTC	2	8	33209	33216	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013504	A	6	6	33265	33270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013504	AGC	2	6	33272	33277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013504	CTT	2	6	33490	33495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013504	TTA	2	6	33561	33566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013504	ATG	2	6	33649	33654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013504	GAA	2	6	33663	33668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013504	AGAT	2	8	35285	35292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013504	T	6	6	36130	36135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013504	AAT	3	9	36136	36144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013504	TTTA	2	8	36145	36152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013504	ATA	2	6	36180	36185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013504	TAA	2	6	36199	36204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013504	TAA	2	6	36209	36214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013504	TAC	2	6	36234	36239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_013504	AAT	2	6	38214	38219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013504	TAA	2	6	38224	38229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013504	ATT	2	6	38239	38244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013504	TAG	2	6	38282	38287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_013504	T	6	6	38318	38323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013504	CGA	2	6	38331	38336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_013504	TAA	2	6	38414	38419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013504	GTAA	2	8	38424	38431	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_013504	TAA	2	6	39882	39887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_013504	AATC	2	8	41328	41335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_013504	T	6	6	41896	41901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013504	GGC	2	6	41907	41912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_013504	T	6	6	42845	42850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_013504	ATA	2	6	45751	45756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_013504	ATT	2	6	45757	45762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_013504	GGA	2	6	45787	45792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
195	NC_013504	AGA	2	6	46700	46705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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