MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013199	TTG	2	6	513471	513476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013199	CAA	2	6	513564	513569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_013199	TATTG	2	10	513608	513617	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013199	ACA	2	6	513705	513710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_013199	TTG	2	6	513726	513731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013199	TGT	2	6	513799	513804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_013199	TAAG	2	8	513828	513835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013199	AT	3	6	513838	513843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013199	GA	3	6	513863	513868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013199	TTG	2	6	513903	513908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013199	TTG	2	6	514260	514265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013199	CA	3	6	514302	514307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_013199	ATT	2	6	514365	514370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013199	C	6	6	514406	514411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1515	NC_013199	TGT	2	6	514441	514446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013199	T	6	6	514762	514767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013199	CAT	2	6	516028	516033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_013199	GTT	2	6	516065	516070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013199	ATA	2	6	516831	516836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013199	AGG	2	6	517473	517478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_013199	ATG	2	6	518705	518710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013199	ATT	2	6	518712	518717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_013199	AAATG	2	10	518749	518758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013199	TCAA	2	8	518766	518773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_013199	AT	3	6	518782	518787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013199	TTC	2	6	518815	518820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_013199	TA	3	6	518828	518833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_013199	ACA	2	6	518854	518859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_013199	GCA	2	6	519150	519155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_013199	GA	3	6	519180	519185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013199	A	6	6	519242	519247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013199	TCC	2	6	520137	520142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_013199	TGT	2	6	520165	520170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_013199	AAAAG	2	10	520188	520197	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013199	ATG	2	6	520207	520212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013199	GAAA	2	8	520241	520248	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013199	A	6	6	520307	520312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013199	ATTG	2	8	520317	520324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_013199	CAA	2	6	520372	520377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_013199	CTTT	2	8	520516	520523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_013199	A	6	6	520549	520554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013199	AAGGTA	2	12	520645	520656	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013199	GTT	2	6	520679	520684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013199	CAA	2	6	522466	522471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_013199	TTTG	2	8	522521	522528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013199	CGC	2	6	522626	522631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_013199	TCC	2	6	522958	522963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_013199	ATGCA	2	10	523011	523020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1549	NC_013199	ATTT	2	8	523060	523067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013199	TAAT	2	8	523095	523102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013199	ATT	2	6	523138	523143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013199	CTT	2	6	524203	524208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_013199	CCT	2	6	525282	525287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_013199	GCAG	2	8	526212	526219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_013199	TGAAAA	2	12	526262	526273	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013199	AAG	2	6	526275	526280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_013199	CAT	2	6	527075	527080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_013199	GGC	2	6	527120	527125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_013199	TA	3	6	528636	528641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_013199	AT	3	6	528648	528653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_013199	GTA	2	6	528659	528664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013199	TA	4	8	528663	528670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_013199	TTTCA	2	10	528815	528824	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1564	NC_013199	AAT	2	6	528827	528832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013199	GTT	2	6	528871	528876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_013199	ATG	2	6	528890	528895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013199	TCA	2	6	530392	530397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_013199	CTTT	2	8	530447	530454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_013199	GAG	2	6	530455	530460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013199	AAAC	2	8	531635	531642	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_013199	A	6	6	531660	531665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013199	GCC	2	6	531744	531749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_013199	A	6	6	533021	533026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013199	CAT	2	6	533034	533039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_013199	T	7	7	533053	533059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013199	TGA	2	6	533553	533558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_013199	A	6	6	533572	533577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_013199	A	6	6	533639	533644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013199	ATTG	2	8	534591	534598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013199	CAA	2	6	534608	534613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_013199	A	6	6	534612	534617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_013199	TCGC	2	8	534631	534638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_013199	GTAA	2	8	535858	535865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_013199	A	6	6	535869	535874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013199	TA	3	6	537088	537093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013199	AAT	2	6	537191	537196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_013199	ATA	2	6	537219	537224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_013199	GAG	2	6	537272	537277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_013199	T	6	6	538456	538461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_013199	A	6	6	538515	538520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_013199	AAG	2	6	538534	538539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_013199	CAG	2	6	540939	540944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_013199	T	6	6	540955	540960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_013199	CAG	2	6	540970	540975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_013199	TTG	2	6	540981	540986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013199	ATG	2	6	542960	542965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013199	A	6	6	542995	543000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_013199	T	7	7	543074	543080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_013199	TGC	2	6	545718	545723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_013199	GGC	2	6	545729	545734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_013199	TAA	2	6	545780	545785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_013199	ATC	2	6	545800	545805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_013199	TCA	2	6	545849	545854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_013199	CA	4	8	545972	545979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_013199	AGG	2	6	545980	545985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_013199	GTC	2	6	548537	548542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_013199	GCC	2	6	548574	548579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_013199	AG	3	6	548713	548718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013199	A	6	6	550243	550248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013199	CAA	2	6	550253	550258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_013199	TGG	2	6	550461	550466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013199	GAT	2	6	551871	551876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_013199	ATG	2	6	551930	551935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013199	A	6	6	552466	552471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013199	CCT	2	6	552472	552477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_013199	ACT	2	6	552492	552497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1619	NC_013199	TAA	2	6	552550	552555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_013199	TA	3	6	552587	552592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013199	ACTT	2	8	552624	552631	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_013199	ATT	2	6	552675	552680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_013199	AGA	2	6	552686	552691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_013199	AATAA	2	10	552696	552705	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_013199	TAGT	2	8	552734	552741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_013199	AGGG	2	8	552756	552763	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_013199	TCC	2	6	552828	552833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_013199	GCAA	2	8	552885	552892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_013199	TAAG	2	8	554735	554742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013199	GCG	2	6	554755	554760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_013199	TCG	2	6	554779	554784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_013199	TGCG	2	8	554820	554827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_013199	ATT	2	6	554936	554941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_013199	TTA	2	6	554948	554953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_013199	AACG	2	8	555961	555968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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