MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013199	GCG	2	6	327772	327777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_013199	GCC	2	6	327833	327838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_013199	TGGT	2	8	327897	327904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013199	GAG	2	6	327918	327923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013199	ATT	2	6	328648	328653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_013199	TG	3	6	331113	331118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_013199	AGG	2	6	331200	331205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013199	GCTCAC	2	12	333032	333043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_013199	GCTCAC	2	12	333154	333165	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_013199	AGG	2	6	333175	333180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013199	TCA	2	6	335491	335496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_013199	T	6	6	335973	335978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013199	ATC	2	6	336064	336069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_013199	GCT	2	6	336070	336075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_013199	TTGA	2	8	336105	336112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013199	T	6	6	336142	336147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_013199	GGCG	2	8	339464	339471	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_013199	AATC	2	8	340761	340768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_013199	A	7	7	340800	340806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013199	GT	3	6	340827	340832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013199	T	6	6	340852	340857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013199	T	6	6	343228	343233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013199	CTC	2	6	344593	344598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_013199	AT	3	6	344972	344977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013199	TTA	2	6	344978	344983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013199	CTT	2	6	345353	345358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_013199	GTGG	2	8	345370	345377	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_013199	T	6	6	345387	345392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013199	GTG	2	6	345412	345417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_013199	GAC	2	6	348470	348475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_013199	A	6	6	348540	348545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_013199	AG	3	6	348591	348596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013199	GCA	2	6	348613	348618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_013199	CCA	2	6	348627	348632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_013199	TGA	2	6	349913	349918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_013199	AATATT	2	12	349923	349934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_013199	ATT	2	6	349990	349995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013199	A	7	7	351655	351661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013199	CATT	2	8	351715	351722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_013199	ACT	2	6	352408	352413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_013199	T	6	6	352430	352435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013199	A	6	6	352454	352459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013199	CGT	2	6	352949	352954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013199	CGG	2	6	352964	352969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_013199	TGCT	2	8	352975	352982	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_013199	GAC	2	6	353020	353025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013199	A	6	6	353027	353032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013199	TTCC	2	8	353120	353127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_013199	CGG	2	6	353136	353141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_013199	CGT	2	6	353207	353212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_013199	TTGC	2	8	353232	353239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_013199	GAT	2	6	353299	353304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_013199	TTCA	2	8	353353	353360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_013199	GAA	2	6	353543	353548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_013199	TCT	2	6	355195	355200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_013199	GAT	2	6	355221	355226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_013199	GAT	2	6	355381	355386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013199	TAT	2	6	355478	355483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013199	ATT	2	6	355500	355505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_013199	AAT	2	6	355522	355527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013199	ATG	2	6	355653	355658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013199	CTTT	2	8	355660	355667	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_013199	ACGG	2	8	356458	356465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_013199	ACAA	2	8	356472	356479	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_013199	ATA	2	6	357328	357333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013199	CA	3	6	357507	357512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_013199	GTCT	2	8	357552	357559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_013199	GAA	2	6	357567	357572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_013199	CCGC	2	8	360215	360222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1078	NC_013199	TGATT	2	10	365960	365969	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_013199	GTTG	2	8	370178	370185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013199	AGG	2	6	370234	370239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013199	ATGCT	2	10	371214	371223	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_013199	CG	3	6	371237	371242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_013199	A	6	6	371254	371259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_013199	TTTG	2	8	373612	373619	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_013199	AGTA	2	8	373992	373999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013199	TA	4	8	374023	374030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013199	A	6	6	374044	374049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013199	AC	3	6	374110	374115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_013199	CCA	2	6	374181	374186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_013199	TTG	2	6	374208	374213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1109	NC_013199	CAA	2	6	374832	374837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_013199	ATT	2	6	374922	374927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013199	AG	3	6	374952	374957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013199	ATT	2	6	375019	375024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013199	A	6	6	375066	375071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1115	NC_013199	TAT	2	6	375120	375125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_013199	TTAT	2	8	375143	375150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013199	A	7	7	375170	375176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013199	GGC	2	6	375199	375204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_013199	TGT	2	6	375210	375215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_013199	TTTAAA	2	12	375272	375283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013199	ATT	2	6	375315	375320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013199	TGA	3	9	375350	375358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013199	TTG	2	6	375368	375373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_013199	A	6	6	375378	375383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013199	TGT	2	6	375409	375414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_013199	TGC	2	6	375593	375598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_013199	TTA	2	6	375676	375681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_013199	GGGT	2	8	376749	376756	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013199	A	6	6	376786	376791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_013199	A	6	6	376814	376819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_013199	GAA	2	6	378934	378939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1133	NC_013199	GAT	2	6	382456	382461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_013199	T	6	6	382698	382703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_013199	T	6	6	382795	382800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_013199	T	7	7	382824	382830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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