MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_013199	TCC	2	6	2954994	2954999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8502	NC_013199	GATTT	2	10	2955018	2955027	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_013199	CAT	2	6	2955088	2955093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_013199	TGC	2	6	2955540	2955545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_013199	AT	3	6	2955576	2955581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_013199	AAT	2	6	2955586	2955591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_013199	AAT	2	6	2955595	2955600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_013199	GTT	2	6	2955608	2955613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_013199	AAT	2	6	2955616	2955621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_013199	GCA	2	6	2955751	2955756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_013199	T	6	6	2955771	2955776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_013199	AGC	2	6	2955798	2955803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_013199	T	6	6	2955867	2955872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_013199	T	6	6	2958379	2958384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_013199	GCAA	2	8	2958395	2958402	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8516	NC_013199	T	6	6	2958412	2958417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_013199	TGCC	2	8	2958483	2958490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8518	NC_013199	CGG	2	6	2958858	2958863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_013199	CA	3	6	2958864	2958869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8520	NC_013199	ACGA	2	8	2959127	2959134	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8521	NC_013199	GGT	2	6	2959152	2959157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_013199	ATA	2	6	2959179	2959184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_013199	ATTT	2	8	2959188	2959195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_013199	A	7	7	2959269	2959275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_013199	CTTC	2	8	2959332	2959339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8526	NC_013199	A	7	7	2961070	2961076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_013199	T	7	7	2961098	2961104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_013199	TCC	2	6	2963049	2963054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8529	NC_013199	TGA	2	6	2964488	2964493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_013199	GTTG	2	8	2964509	2964516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_013199	TCC	2	6	2965719	2965724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8532	NC_013199	CT	3	6	2966576	2966581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8533	NC_013199	AACGAC	2	12	2967072	2967083	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_013199	CAA	2	6	2967084	2967089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8535	NC_013199	CT	3	6	2967268	2967273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8536	NC_013199	GCTCT	2	10	2967675	2967684	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8537	NC_013199	A	8	8	2967685	2967692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_013199	GAC	2	6	2967855	2967860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_013199	CCT	2	6	2967862	2967867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8540	NC_013199	TTA	2	6	2967886	2967891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_013199	CAT	2	6	2967912	2967917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_013199	AAGC	2	8	2967934	2967941	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8543	NC_013199	GCA	2	6	2968001	2968006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_013199	TG	3	6	2968026	2968031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_013199	ATC	2	6	2968221	2968226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_013199	T	6	6	2968271	2968276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_013199	CTAA	2	8	2968373	2968380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8548	NC_013199	AAT	2	6	2968394	2968399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_013199	TTG	2	6	2968413	2968418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_013199	TTA	2	6	2968579	2968584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_013199	GAG	2	6	2968585	2968590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.