MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_013199	CTTAA	2	10	2786446	2786455	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8002	NC_013199	C	7	7	2787310	2787316	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8003	NC_013199	AT	3	6	2787371	2787376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_013199	ATT	2	6	2787399	2787404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_013199	ATA	2	6	2787457	2787462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_013199	TCTGCT	2	12	2787539	2787550	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_013199	TTG	2	6	2793040	2793045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_013199	CTC	2	6	2793049	2793054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_013199	CATT	2	8	2793090	2793097	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8010	NC_013199	ATT	2	6	2793179	2793184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_013199	TAG	2	6	2793265	2793270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_013199	ATT	2	6	2793277	2793282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_013199	ATGA	2	8	2793291	2793298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_013199	GAACT	2	10	2793299	2793308	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8015	NC_013199	TTCA	2	8	2793312	2793319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8016	NC_013199	CAA	2	6	2793333	2793338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_013199	ACC	2	6	2793346	2793351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_013199	TAC	2	6	2793436	2793441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_013199	ATG	2	6	2793458	2793463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_013199	A	6	6	2793474	2793479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_013199	CCG	2	6	2793494	2793499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8022	NC_013199	AT	3	6	2793526	2793531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_013199	GGC	2	6	2793574	2793579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_013199	GCAC	2	8	2793594	2793601	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8025	NC_013199	GA	3	6	2793645	2793650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_013199	GGGTT	2	10	2793656	2793665	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_013199	AAG	2	6	2793742	2793747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_013199	ACC	2	6	2793770	2793775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8029	NC_013199	CTT	2	6	2793832	2793837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_013199	CAAA	2	8	2793866	2793873	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8031	NC_013199	ATCT	2	8	2793874	2793881	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8032	NC_013199	AAG	2	6	2793908	2793913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_013199	TAAG	2	8	2794799	2794806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_013199	AAG	2	6	2795416	2795421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_013199	TTA	2	6	2796877	2796882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_013199	CAT	2	6	2796902	2796907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_013199	T	6	6	2796952	2796957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_013199	TGAA	2	8	2796965	2796972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_013199	ATG	2	6	2798183	2798188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_013199	TCA	2	6	2802475	2802480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_013199	ATTA	2	8	2802535	2802542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_013199	T	6	6	2804017	2804022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_013199	TAA	2	6	2804025	2804030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_013199	TTA	2	6	2804031	2804036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_013199	TAA	2	6	2804046	2804051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_013199	CA	3	6	2804078	2804083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8047	NC_013199	AGCC	2	8	2804955	2804962	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_013199	TGA	2	6	2804984	2804989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_013199	GTC	2	6	2805027	2805032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_013199	CCAA	2	8	2805043	2805050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8051	NC_013199	TG	3	6	2808368	2808373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_013199	TCT	2	6	2808414	2808419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_013199	CCCT	2	8	2810108	2810115	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8054	NC_013199	AGG	2	6	2810210	2810215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_013199	TG	3	6	2810227	2810232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_013199	AG	3	6	2810323	2810328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_013199	A	6	6	2810341	2810346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_013199	GCC	3	9	2811485	2811493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8059	NC_013199	TAT	2	6	2811515	2811520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_013199	AAGT	2	8	2811559	2811566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_013199	TGAA	3	12	2812645	2812656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_013199	GCA	2	6	2812743	2812748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_013199	AAAAG	2	10	2812752	2812761	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_013199	GATT	2	8	2813631	2813638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_013199	AGTG	2	8	2813664	2813671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_013199	TAT	2	6	2814128	2814133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_013199	T	6	6	2814162	2814167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_013199	CAAC	2	8	2814196	2814203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8069	NC_013199	T	6	6	2815001	2815006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_013199	TCGT	2	8	2815015	2815022	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8071	NC_013199	GAA	2	6	2815066	2815071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_013199	ACCTC	2	10	2815110	2815119	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8073	NC_013199	TCC	2	6	2815487	2815492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8074	NC_013199	A	6	6	2815520	2815525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_013199	TAG	2	6	2815609	2815614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_013199	GGT	2	6	2815635	2815640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_013199	TTA	2	6	2815674	2815679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_013199	T	6	6	2815701	2815706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_013199	T	6	6	2816039	2816044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_013199	TCTAA	2	10	2816230	2816239	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8081	NC_013199	GTAA	2	8	2816268	2816275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_013199	ATC	2	6	2817940	2817945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_013199	GTC	2	6	2817996	2818001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_013199	A	6	6	2818002	2818007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_013199	TATC	2	8	2818035	2818042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8086	NC_013199	CAA	2	6	2818109	2818114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_013199	CAG	2	6	2818138	2818143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_013199	AGT	2	6	2818213	2818218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_013199	TTG	2	6	2818224	2818229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_013199	TGT	2	6	2818240	2818245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_013199	CA	3	6	2818251	2818256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8092	NC_013199	AATT	2	8	2818292	2818299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_013199	TCT	2	6	2818307	2818312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_013199	TGATT	2	10	2818351	2818360	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_013199	AATT	2	8	2818385	2818392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_013199	AACTT	2	10	2818398	2818407	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8097	NC_013199	AAAG	2	8	2818473	2818480	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_013199	A	7	7	2818558	2818564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_013199	CGA	2	6	2818632	2818637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_013199	TCA	2	6	2818639	2818644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_013199	TGC	2	6	2819117	2819122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_013199	ACC	2	6	2819418	2819423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_013199	GTT	2	6	2819445	2819450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_013199	CTT	3	9	2819571	2819579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_013199	ATC	2	6	2819590	2819595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_013199	AAT	2	6	2820235	2820240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_013199	TGA	2	6	2820280	2820285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_013199	CG	3	6	2820304	2820309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8109	NC_013199	GGTA	2	8	2820328	2820335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_013199	CAG	2	6	2820393	2820398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_013199	TCC	2	6	2820411	2820416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_013199	ATA	2	6	2822250	2822255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_013199	CA	3	6	2822265	2822270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8114	NC_013199	CTA	2	6	2823513	2823518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_013199	AC	3	6	2823524	2823529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8116	NC_013199	TTC	2	6	2823602	2823607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_013199	CAA	2	6	2823611	2823616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_013199	TGAT	2	8	2823630	2823637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_013199	ATC	2	6	2823644	2823649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_013199	TTC	2	6	2823727	2823732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_013199	AATA	2	8	2823739	2823746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_013199	TCAT	2	8	2824746	2824753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8123	NC_013199	GCG	2	6	2824794	2824799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_013199	T	6	6	2824850	2824855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_013199	GAT	2	6	2825977	2825982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_013199	A	6	6	2826016	2826021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_013199	ATA	2	6	2826038	2826043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_013199	GTTC	2	8	2826191	2826198	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8129	NC_013199	AGG	2	6	2826207	2826212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_013199	ATCAAA	2	12	2827086	2827097	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8131	NC_013199	T	6	6	2827145	2827150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_013199	TGG	3	9	2830218	2830226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_013199	AGG	2	6	2830243	2830248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8264	NC_013199	TGA	2	6	2875533	2875538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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