MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013199	A	6	6	2598201	2598206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_013199	A	6	6	2598225	2598230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_013199	A	6	6	2598241	2598246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_013199	AGCC	2	8	2599498	2599505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7505	NC_013199	TAT	3	9	2599822	2599830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_013199	AAG	2	6	2599833	2599838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_013199	GATC	2	8	2602125	2602132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7508	NC_013199	TCA	2	6	2602187	2602192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_013199	A	6	6	2602198	2602203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_013199	GAT	2	6	2602233	2602238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_013199	ACTA	2	8	2603668	2603675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7512	NC_013199	A	6	6	2604080	2604085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_013199	GCA	2	6	2604117	2604122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_013199	CAT	2	6	2604154	2604159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_013199	CTG	2	6	2604178	2604183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_013199	AAC	2	6	2604188	2604193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_013199	CA	3	6	2604671	2604676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7518	NC_013199	TCA	2	6	2605094	2605099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_013199	A	6	6	2605134	2605139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_013199	TCC	2	6	2606153	2606158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7521	NC_013199	AAT	2	6	2606179	2606184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_013199	A	7	7	2606214	2606220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_013199	CGC	2	6	2606491	2606496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7524	NC_013199	ATA	2	6	2607667	2607672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_013199	CAGC	2	8	2607676	2607683	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7526	NC_013199	ACA	2	6	2607692	2607697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7527	NC_013199	AC	3	6	2607887	2607892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7528	NC_013199	ACCCT	2	10	2607896	2607905	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7529	NC_013199	CAAAA	2	10	2607921	2607930	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7530	NC_013199	A	6	6	2607927	2607932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_013199	GTC	2	6	2610174	2610179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_013199	TATT	2	8	2610192	2610199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_013199	ATC	2	6	2610235	2610240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_013199	TCC	2	6	2611658	2611663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7535	NC_013199	TGC	2	6	2611677	2611682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_013199	GCA	2	6	2611705	2611710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_013199	ATC	2	6	2612624	2612629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_013199	CTC	2	6	2612632	2612637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7539	NC_013199	CAT	2	6	2612650	2612655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_013199	ACC	2	6	2613558	2613563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7541	NC_013199	ATGC	2	8	2613616	2613623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7542	NC_013199	TTA	2	6	2613637	2613642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_013199	AAG	2	6	2613721	2613726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_013199	TCG	2	6	2613784	2613789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7545	NC_013199	AT	3	6	2614073	2614078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_013199	TGA	2	6	2614502	2614507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_013199	GCCAA	2	10	2617382	2617391	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7548	NC_013199	GGT	2	6	2617402	2617407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_013199	TAT	2	6	2617425	2617430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_013199	TGAC	2	8	2617431	2617438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7551	NC_013199	TAT	2	6	2617478	2617483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_013199	AGG	2	6	2617533	2617538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_013199	TAAT	2	8	2618558	2618565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_013199	GCA	2	6	2618771	2618776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_013199	AGG	2	6	2618823	2618828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_013199	GCC	2	6	2619733	2619738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7557	NC_013199	T	6	6	2619758	2619763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_013199	T	6	6	2621476	2621481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_013199	GAA	2	6	2625274	2625279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_013199	TAT	2	6	2625300	2625305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_013199	ATG	2	6	2625363	2625368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_013199	ATCA	2	8	2625627	2625634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7563	NC_013199	TGTT	2	8	2625636	2625643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_013199	AGG	2	6	2625650	2625655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_013199	TAT	2	6	2626154	2626159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_013199	A	7	7	2629839	2629845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7570	NC_013199	TAT	2	6	2633611	2633616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7573	NC_013199	ATT	2	6	2633729	2633734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_013199	TA	3	6	2633736	2633741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_013199	AAT	2	6	2634844	2634849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7581	NC_013199	ACCTC	2	10	2635865	2635874	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7582	NC_013199	GTT	2	6	2636915	2636920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_013199	TAT	2	6	2636926	2636931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_013199	TGC	2	6	2636940	2636945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7590	NC_013199	TAT	2	6	2641681	2641686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_013199	CAGTTT	2	12	2641736	2641747	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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7593	NC_013199	AAT	2	6	2641775	2641780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_013199	ATTT	2	8	2641788	2641795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_013199	GC	3	6	2641832	2641837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7596	NC_013199	TCA	2	6	2641849	2641854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7598	NC_013199	ATC	2	6	2641937	2641942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_013199	AGG	2	6	2643830	2643835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7601	NC_013199	CTA	2	6	2644365	2644370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_013199	A	7	7	2644383	2644389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_013199	TTC	2	6	2644394	2644399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7604	NC_013199	GAA	2	6	2644419	2644424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7607	NC_013199	GTTGG	2	10	2645883	2645892	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_013199	CAT	2	6	2645893	2645898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7609	NC_013199	T	6	6	2645955	2645960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_013199	ACG	2	6	2646048	2646053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7612	NC_013199	AT	3	6	2646357	2646362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_013199	TAA	2	6	2647873	2647878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_013199	TCG	2	6	2647888	2647893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7615	NC_013199	TTA	2	6	2647909	2647914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_013199	GTTG	2	8	2647958	2647965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_013199	TCC	2	6	2649020	2649025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7618	NC_013199	A	6	6	2649033	2649038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_013199	ACA	2	6	2649054	2649059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7620	NC_013199	GC	3	6	2649070	2649075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7621	NC_013199	ACC	2	6	2649079	2649084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7622	NC_013199	CACC	2	8	2649124	2649131	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7623	NC_013199	CT	3	6	2649193	2649198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7624	NC_013199	TG	3	6	2649229	2649234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_013199	CAA	2	6	2649289	2649294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7626	NC_013199	TCC	2	6	2649401	2649406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7627	NC_013199	ATA	2	6	2649460	2649465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_013199	AG	3	6	2649511	2649516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_013199	TAGCAT	2	12	2649529	2649540	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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