MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013199	AGG	2	6	2444678	2444683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_013199	TCGC	2	8	2446944	2446951	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7003	NC_013199	GTG	2	6	2446979	2446984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_013199	TGC	2	6	2448396	2448401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_013199	A	7	7	2448463	2448469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_013199	TGA	2	6	2449311	2449316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_013199	A	6	6	2451576	2451581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_013199	AATT	2	8	2451677	2451684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_013199	TCA	2	6	2451811	2451816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_013199	T	6	6	2451842	2451847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_013199	ATTG	2	8	2451873	2451880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_013199	A	6	6	2451919	2451924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_013199	TCTTT	2	10	2454692	2454701	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7014	NC_013199	TAAG	2	8	2454725	2454732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_013199	TCA	2	6	2454781	2454786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_013199	CCA	2	6	2454788	2454793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_013199	ATT	2	6	2454858	2454863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_013199	AGA	2	6	2454939	2454944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_013199	CCT	2	6	2455336	2455341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7020	NC_013199	TGC	2	6	2455355	2455360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_013199	AGC	2	6	2455398	2455403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_013199	GCA	2	6	2455410	2455415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_013199	CGC	2	6	2455419	2455424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_013199	GAA	2	6	2455431	2455436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_013199	GGC	2	6	2455443	2455448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_013199	TATT	2	8	2455499	2455506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_013199	ATG	2	6	2455515	2455520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_013199	AAT	2	6	2455521	2455526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_013199	TTC	2	6	2455559	2455564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_013199	A	6	6	2455590	2455595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_013199	TTG	2	6	2455604	2455609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_013199	CAT	2	6	2457011	2457016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_013199	C	6	6	2458579	2458584	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7034	NC_013199	AAG	2	6	2458662	2458667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_013199	GGA	2	6	2458668	2458673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_013199	TTTAT	2	10	2458912	2458921	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_013199	AAAT	2	8	2458960	2458967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_013199	GCA	2	6	2458978	2458983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_013199	TGAA	2	8	2459663	2459670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_013199	TCA	2	6	2459719	2459724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_013199	A	7	7	2460091	2460097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_013199	AGA	2	6	2462796	2462801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_013199	GA	3	6	2462800	2462805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_013199	CCA	2	6	2462858	2462863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7045	NC_013199	ATTA	2	8	2462979	2462986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_013199	GTT	2	6	2463054	2463059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_013199	T	6	6	2463061	2463066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_013199	CGTA	2	8	2463070	2463077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7049	NC_013199	AACC	2	8	2463388	2463395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7050	NC_013199	CCGACA	2	12	2463402	2463413	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7051	NC_013199	TGC	2	6	2463445	2463450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_013199	T	6	6	2463542	2463547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_013199	CTT	2	6	2463652	2463657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_013199	A	7	7	2463669	2463675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_013199	T	7	7	2463691	2463697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_013199	GGAA	2	8	2463731	2463738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_013199	TCAC	2	8	2464717	2464724	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7058	NC_013199	A	6	6	2464734	2464739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_013199	TGA	2	6	2464759	2464764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_013199	CAA	2	6	2464767	2464772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_013199	T	7	7	2464835	2464841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_013199	CCA	2	6	2465605	2465610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_013199	A	7	7	2465612	2465618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_013199	T	7	7	2465678	2465684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_013199	TTC	2	6	2466258	2466263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_013199	TTCA	2	8	2466270	2466277	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7067	NC_013199	CAT	2	6	2466399	2466404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_013199	AT	3	6	2466437	2466442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_013199	TCA	2	6	2466472	2466477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_013199	TACGC	2	10	2466513	2466522	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7071	NC_013199	TCA	2	6	2466532	2466537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_013199	GAG	2	6	2466550	2466555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_013199	CTT	2	6	2467468	2467473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_013199	GGC	2	6	2467852	2467857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_013199	ATC	2	6	2467902	2467907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_013199	TCT	2	6	2467942	2467947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_013199	CAT	2	6	2467973	2467978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_013199	A	6	6	2467997	2468002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_013199	TAA	2	6	2468015	2468020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_013199	ACT	2	6	2468033	2468038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_013199	T	6	6	2468070	2468075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_013199	T	6	6	2468142	2468147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_013199	ATA	2	6	2468276	2468281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_013199	TGC	2	6	2468301	2468306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_013199	T	6	6	2468391	2468396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_013199	CAT	2	6	2468397	2468402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7087	NC_013199	ATC	2	6	2468420	2468425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_013199	GCA	2	6	2468642	2468647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_013199	GAG	2	6	2468657	2468662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_013199	CAA	2	6	2469107	2469112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_013199	TCT	2	6	2469140	2469145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_013199	GAC	2	6	2469153	2469158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_013199	TA	3	6	2469176	2469181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_013199	CTC	2	6	2469192	2469197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7095	NC_013199	TTA	2	6	2469240	2469245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_013199	TAT	2	6	2469263	2469268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_013199	CTT	2	6	2469286	2469291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_013199	TTC	2	6	2470103	2470108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_013199	CG	3	6	2470112	2470117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7100	NC_013199	A	6	6	2470135	2470140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_013199	AGGT	2	8	2470163	2470170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_013199	TCA	2	6	2470172	2470177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_013199	AAT	2	6	2470229	2470234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_013199	TGAT	2	8	2470260	2470267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_013199	CAA	2	6	2470361	2470366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_013199	AGC	2	6	2470536	2470541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_013199	ATT	2	6	2470542	2470547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_013199	TGT	2	6	2470551	2470556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_013199	CAA	2	6	2472133	2472138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_013199	CAGAAT	2	12	2472277	2472288	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7111	NC_013199	TCG	2	6	2472320	2472325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_013199	TGT	2	6	2472387	2472392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_013199	ATA	2	6	2472424	2472429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_013199	AGT	2	6	2472505	2472510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_013199	TTA	2	6	2472526	2472531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_013199	A	8	8	2472706	2472713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_013199	TGA	2	6	2480894	2480899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_013199	TAG	2	6	2480909	2480914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_013199	A	6	6	2480971	2480976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_013199	AAG	2	6	2481081	2481086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_013199	GCTG	2	8	2481809	2481816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7122	NC_013199	T	6	6	2481818	2481823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_013199	GGGA	2	8	2481828	2481835	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_013199	GGTT	2	8	2481848	2481855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_013199	TC	3	6	2481960	2481965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7126	NC_013199	AATCT	2	10	2482033	2482042	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7127	NC_013199	TTG	2	6	2482149	2482154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_013199	CTT	2	6	2482193	2482198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_013199	TGT	2	6	2482210	2482215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_013199	CCT	2	6	2483369	2483374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7131	NC_013199	AACAC	2	10	2483409	2483418	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7132	NC_013199	CCGA	2	8	2483960	2483967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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