MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013199	TTTG	2	8	2304600	2304607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_013199	TCC	2	6	2304998	2305003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_013199	T	6	6	2305005	2305010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_013199	A	7	7	2305578	2305584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_013199	ACC	2	6	2305627	2305632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_013199	GAT	2	6	2305640	2305645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_013199	AT	3	6	2305740	2305745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_013199	CAA	2	6	2305767	2305772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_013199	TTAG	2	8	2305820	2305827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_013199	TCA	2	6	2307107	2307112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_013199	ATT	2	6	2308541	2308546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_013199	TGT	2	6	2308567	2308572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_013199	TCC	2	6	2308611	2308616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6514	NC_013199	ATT	2	6	2308628	2308633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_013199	CTT	2	6	2308673	2308678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_013199	T	7	7	2308725	2308731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_013199	TAAT	2	8	2308770	2308777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_013199	TCA	2	6	2310094	2310099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_013199	TAA	2	6	2310124	2310129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_013199	ATAA	2	8	2310132	2310139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_013199	T	8	8	2310182	2310189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_013199	CA	3	6	2310246	2310251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6523	NC_013199	A	7	7	2310260	2310266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_013199	A	6	6	2310277	2310282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_013199	GTG	2	6	2310283	2310288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_013199	AAT	2	6	2310295	2310300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_013199	GCA	2	6	2313690	2313695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_013199	TGC	2	6	2313749	2313754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_013199	CCA	2	6	2316979	2316984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6530	NC_013199	AATA	2	8	2317028	2317035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_013199	T	6	6	2317053	2317058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_013199	GTG	2	6	2317104	2317109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_013199	ATC	2	6	2317112	2317117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_013199	GCAA	2	8	2317135	2317142	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6535	NC_013199	GTTA	2	8	2320256	2320263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_013199	ATTA	2	8	2320281	2320288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_013199	TATC	2	8	2320309	2320316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6538	NC_013199	ACT	2	6	2320394	2320399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_013199	A	6	6	2320417	2320422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_013199	AT	3	6	2320430	2320435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_013199	T	7	7	2320535	2320541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_013199	ATT	2	6	2320547	2320552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_013199	ATC	2	6	2320566	2320571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_013199	A	6	6	2320575	2320580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_013199	CCA	2	6	2320586	2320591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_013199	T	6	6	2320615	2320620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_013199	A	6	6	2320661	2320666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_013199	CAA	2	6	2320688	2320693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_013199	CTTA	2	8	2322156	2322163	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6550	NC_013199	CGA	2	6	2322226	2322231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_013199	CAA	2	6	2322257	2322262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_013199	AAT	2	6	2322269	2322274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_013199	CAA	2	6	2322282	2322287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_013199	GTC	2	6	2322288	2322293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_013199	AAAAGA	2	12	2322891	2322902	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_013199	AATG	2	8	2322934	2322941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_013199	TCC	2	6	2323643	2323648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_013199	CCT	2	6	2324164	2324169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_013199	ATG	2	6	2324188	2324193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_013199	AAG	2	6	2324268	2324273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_013199	A	6	6	2324306	2324311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_013199	TA	3	6	2326955	2326960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_013199	TCC	2	6	2327008	2327013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6564	NC_013199	GTC	2	6	2327035	2327040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_013199	AGCA	2	8	2327044	2327051	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6566	NC_013199	TCA	2	6	2327073	2327078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_013199	TTA	2	6	2327109	2327114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_013199	TCA	2	6	2327120	2327125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_013199	GTTT	2	8	2327143	2327150	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_013199	TAT	2	6	2327212	2327217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_013199	TCA	2	6	2327236	2327241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_013199	A	6	6	2327267	2327272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_013199	CTG	2	6	2327351	2327356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_013199	TTG	2	6	2327376	2327381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_013199	AGCC	2	8	2329151	2329158	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_013199	CCT	2	6	2329835	2329840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6577	NC_013199	TCC	2	6	2330786	2330791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6578	NC_013199	TCCC	2	8	2333051	2333058	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6579	NC_013199	A	6	6	2333169	2333174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_013199	A	6	6	2333189	2333194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_013199	ATC	2	6	2333229	2333234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_013199	TCC	2	6	2333791	2333796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6583	NC_013199	AGCA	2	8	2333798	2333805	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6584	NC_013199	CAT	2	6	2333882	2333887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_013199	AAT	2	6	2333914	2333919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_013199	TCT	2	6	2333947	2333952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_013199	A	6	6	2335403	2335408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_013199	AGCA	2	8	2335861	2335868	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6589	NC_013199	GTG	2	6	2335980	2335985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_013199	TA	3	6	2339402	2339407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_013199	GAA	2	6	2339415	2339420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_013199	TA	3	6	2339447	2339452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_013199	TTGA	2	8	2339462	2339469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_013199	CATTT	2	10	2339477	2339486	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6595	NC_013199	TCA	2	6	2339524	2339529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6597	NC_013199	GAT	2	6	2340906	2340911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_013199	TG	3	6	2340926	2340931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_013199	ACGC	2	8	2340975	2340982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_013199	TCG	2	6	2340986	2340991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_013199	TCA	2	6	2341005	2341010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_013199	TAA	2	6	2341047	2341052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_013199	GGT	2	6	2341062	2341067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_013199	GTTGCA	2	12	2341105	2341116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6605	NC_013199	AC	3	6	2341529	2341534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6606	NC_013199	AAGAA	2	10	2341603	2341612	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_013199	ATT	2	6	2341626	2341631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_013199	TAA	2	6	2341663	2341668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_013199	CTT	2	6	2341679	2341684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_013199	TTTAG	2	10	2342663	2342672	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_013199	TCAAA	2	10	2342677	2342686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6612	NC_013199	A	7	7	2342684	2342690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_013199	TAT	2	6	2342706	2342711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_013199	T	6	6	2342725	2342730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_013199	AG	3	6	2342793	2342798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_013199	ATAC	2	8	2342845	2342852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6617	NC_013199	T	6	6	2344835	2344840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_013199	GCT	2	6	2344853	2344858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_013199	CAT	2	6	2344905	2344910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6621	NC_013199	GTT	2	6	2346990	2346995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_013199	T	7	7	2346994	2347000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_013199	ACA	2	6	2347015	2347020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_013199	T	6	6	2347193	2347198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_013199	CTG	2	6	2347955	2347960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_013199	GTT	2	6	2347961	2347966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_013199	T	7	7	2347965	2347971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_013199	GTGA	2	8	2348030	2348037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_013199	GAGG	2	8	2348833	2348840	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_013199	TTAG	2	8	2348876	2348883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_013199	A	6	6	2348894	2348899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6633	NC_013199	GAT	2	6	2349014	2349019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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