MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013199	AAG	2	6	1826564	1826569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_013199	TGATT	2	10	1827023	1827032	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_013199	A	7	7	1827049	1827055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_013199	GTAA	2	8	1828264	1828271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_013199	CGG	2	6	1828278	1828283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_013199	GGCTG	2	10	1828353	1828362	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5007	NC_013199	GTG	2	6	1828367	1828372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013199	CAC	2	6	1828460	1828465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_013199	A	6	6	1828570	1828575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_013199	CCT	2	6	1828641	1828646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_013199	CAG	2	6	1828653	1828658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_013199	CT	3	6	1829489	1829494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_013199	GTTAT	2	10	1829508	1829517	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_013199	AT	3	6	1829529	1829534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_013199	TCC	2	6	1831460	1831465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_013199	TA	3	6	1832928	1832933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_013199	ATC	2	6	1832966	1832971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_013199	ATC	2	6	1832983	1832988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_013199	A	6	6	1833491	1833496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_013199	AATT	2	8	1833539	1833546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_013199	ATT	2	6	1835318	1835323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_013199	CA	3	6	1835758	1835763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_013199	A	6	6	1835763	1835768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_013199	CCGA	2	8	1835832	1835839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_013199	AAT	2	6	1835841	1835846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_013199	A	6	6	1835855	1835860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_013199	TTA	2	6	1835868	1835873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_013199	TGA	2	6	1839618	1839623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_013199	GTGAGC	2	12	1839689	1839700	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5030	NC_013199	TGA	2	6	1839740	1839745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013199	GCC	2	6	1839821	1839826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_013199	GAA	2	6	1839866	1839871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_013199	AAAAC	2	10	1839952	1839961	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5034	NC_013199	CCT	2	6	1841278	1841283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_013199	GTGAGC	2	12	1841887	1841898	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5036	NC_013199	TGA	2	6	1841938	1841943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_013199	GC	3	6	1842020	1842025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_013199	GCC	2	6	1842180	1842185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_013199	AC	3	6	1842189	1842194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_013199	GCT	2	6	1843204	1843209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_013199	CAT	2	6	1844415	1844420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_013199	CCA	2	6	1844438	1844443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_013199	ATT	2	6	1844484	1844489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013199	CCT	2	6	1845135	1845140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_013199	ACGTTT	2	12	1845173	1845184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5046	NC_013199	CTG	2	6	1845201	1845206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_013199	TCAA	2	8	1845215	1845222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_013199	TTGC	2	8	1845283	1845290	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_013199	GC	3	6	1845548	1845553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_013199	TCT	2	6	1845702	1845707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_013199	CAT	2	6	1845714	1845719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_013199	CAA	2	6	1845733	1845738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_013199	T	6	6	1845760	1845765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_013199	TCA	2	6	1846859	1846864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_013199	T	6	6	1846908	1846913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_013199	CCTTT	2	10	1849726	1849735	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5057	NC_013199	T	6	6	1849733	1849738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_013199	A	7	7	1849783	1849789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_013199	ACCT	2	8	1849880	1849887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_013199	TCC	2	6	1849938	1849943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_013199	TGA	2	6	1849957	1849962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_013199	CT	3	6	1850462	1850467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_013199	CAA	2	6	1850886	1850891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_013199	CCT	2	6	1853180	1853185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_013199	TCTT	2	8	1853186	1853193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_013199	CAG	2	6	1853228	1853233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_013199	ACA	2	6	1853260	1853265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_013199	TTG	2	6	1853278	1853283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_013199	TCC	2	6	1854855	1854860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_013199	TCA	2	6	1854871	1854876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_013199	A	7	7	1854897	1854903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_013199	T	6	6	1854950	1854955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_013199	ATTTA	2	10	1858513	1858522	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_013199	ATA	2	6	1858523	1858528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_013199	TA	3	6	1858540	1858545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_013199	AAT	2	6	1858556	1858561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_013199	AC	3	6	1858810	1858815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_013199	AGCA	2	8	1858842	1858849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_013199	TTC	2	6	1858855	1858860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5081	NC_013199	TTA	2	6	1858923	1858928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5083	NC_013199	ATT	2	6	1860817	1860822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_013199	CTT	2	6	1863698	1863703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_013199	TCAA	2	8	1863741	1863748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5088	NC_013199	TCAT	2	8	1863894	1863901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_013199	CTT	2	6	1863910	1863915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_013199	TTA	2	6	1870733	1870738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_013199	ATT	2	6	1870798	1870803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_013199	TAA	2	6	1870825	1870830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_013199	ACA	2	6	1870836	1870841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_013199	TC	3	6	1870849	1870854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_013199	CAA	2	6	1870873	1870878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_013199	TAAA	2	8	1870903	1870910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_013199	CAA	2	6	1870964	1870969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_013199	ACT	2	6	1870970	1870975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5101	NC_013199	CTC	2	6	1872671	1872676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_013199	GGT	2	6	1872743	1872748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_013199	T	6	6	1872771	1872776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_013199	CAC	2	6	1873613	1873618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_013199	GC	3	6	1873639	1873644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_013199	TCC	2	6	1875156	1875161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_013199	GCT	2	6	1875164	1875169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_013199	TCT	2	6	1875324	1875329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_013199	T	6	6	1875377	1875382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_013199	ACA	2	6	1877749	1877754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_013199	GAAAT	2	10	1877769	1877778	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_013199	A	7	7	1877872	1877878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_013199	ATC	2	6	1877885	1877890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_013199	GTC	2	6	1878315	1878320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_013199	CCT	2	6	1878796	1878801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_013199	TCA	2	6	1878814	1878819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_013199	TA	3	6	1878895	1878900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_013199	ATT	3	9	1878916	1878924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_013199	T	6	6	1879100	1879105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013199	CAA	2	6	1879137	1879142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5122	NC_013199	GGA	2	6	1879350	1879355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013199	GTTA	2	8	1880796	1880803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_013199	GCTCAC	2	12	1880943	1880954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5125	NC_013199	TCCAA	2	10	1882151	1882160	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5126	NC_013199	TCA	2	6	1882187	1882192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_013199	CAA	2	6	1882196	1882201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_013199	A	6	6	1882200	1882205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_013199	T	6	6	1882249	1882254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_013199	ATT	2	6	1882262	1882267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_013199	CAG	2	6	1882280	1882285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_013199	TCC	2	6	1882640	1882645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_013199	CTA	2	6	1882699	1882704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_013199	TCA	2	6	1882737	1882742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_013199	AACC	2	8	1882770	1882777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5136	NC_013199	CGTT	2	8	1882823	1882830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5137	NC_013199	AAC	2	6	1884632	1884637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5139	NC_013199	CTC	2	6	1884907	1884912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5140	NC_013199	ACC	2	6	1887545	1887550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5141	NC_013199	TGAG	2	8	1887559	1887566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_013199	GCC	2	6	1887603	1887608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5143	NC_013199	TGCG	2	8	1887618	1887625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5144	NC_013199	CAA	2	6	1887691	1887696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5145	NC_013199	AT	3	6	1888550	1888555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_013199	A	6	6	1888586	1888591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5149	NC_013199	T	6	6	1888733	1888738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_013199	CTG	2	6	1889270	1889275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5157	NC_013199	CAT	2	6	1889691	1889696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5161	NC_013199	TGT	2	6	1889966	1889971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_013199	CAA	2	6	1891143	1891148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5163	NC_013199	ATG	2	6	1891770	1891775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5164	NC_013199	CA	3	6	1891782	1891787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5165	NC_013199	TAG	2	6	1891811	1891816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5226	NC_013199	CAGAC	2	10	1896486	1896495	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5243	NC_013199	T	6	6	1897446	1897451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_013199	TGA	2	6	1897467	1897472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5249	NC_013199	CA	3	6	1899064	1899069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5250	NC_013199	ACC	2	6	1899114	1899119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5251	NC_013199	TCA	2	6	1899177	1899182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5254	NC_013199	CT	3	6	1899238	1899243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5255	NC_013199	GTT	2	6	1899282	1899287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_013199	TAC	2	6	1901061	1901066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_013199	CTT	2	6	1901148	1901153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_013199	ACTT	2	8	1901209	1901216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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