MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 8762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013198	CTA	2	6	2431009	2431014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_013198	AGAA	2	8	2431051	2431058	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_013198	TCA	2	6	2432550	2432555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_013198	CATA	2	8	2432570	2432577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7005	NC_013198	A	6	6	2432631	2432636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_013198	T	6	6	2432671	2432676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_013198	ACA	2	6	2432697	2432702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_013198	TCA	2	6	2432718	2432723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_013198	CCT	2	6	2433860	2433865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7010	NC_013198	CTTA	2	8	2433872	2433879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7011	NC_013198	AGTA	2	8	2433912	2433919	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_013198	T	6	6	2433935	2433940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_013198	CCT	2	6	2433973	2433978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7014	NC_013198	CCT	2	6	2434231	2434236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_013198	CTTAA	2	10	2434245	2434254	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7016	NC_013198	TTTTG	2	10	2434311	2434320	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_013198	TAA	2	6	2434336	2434341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_013198	A	7	7	2434350	2434356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_013198	TAC	2	6	2434429	2434434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_013198	GTCG	2	8	2434567	2434574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7021	NC_013198	CAAC	2	8	2434608	2434615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7022	NC_013198	GCCAAG	2	12	2434699	2434710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_013198	GCC	2	6	2434711	2434716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_013198	TCC	2	6	2435190	2435195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7025	NC_013198	TTCT	2	8	2435197	2435204	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7026	NC_013198	GT	3	6	2435304	2435309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_013198	TGAA	2	8	2435331	2435338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_013198	TCT	2	6	2435381	2435386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_013198	TCC	2	6	2435422	2435427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7030	NC_013198	ATC	2	6	2435446	2435451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_013198	TC	3	6	2435450	2435455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7032	NC_013198	TTA	2	6	2435498	2435503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_013198	CGT	2	6	2435505	2435510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_013198	TTTTCA	2	12	2435577	2435588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7035	NC_013198	ATT	2	6	2435675	2435680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_013198	C	6	6	2435697	2435702	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7037	NC_013198	TGT	2	6	2435777	2435782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_013198	T	7	7	2435818	2435824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_013198	ATCA	2	8	2435835	2435842	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7040	NC_013198	CAAAA	2	10	2435931	2435940	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7041	NC_013198	CCT	2	6	2436244	2436249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7042	NC_013198	TCA	2	6	2436297	2436302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_013198	ATT	2	6	2436329	2436334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_013198	TCA	2	6	2436408	2436413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_013198	ACC	2	6	2436644	2436649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_013198	AAG	2	6	2436692	2436697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_013198	A	7	7	2436739	2436745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_013198	CCT	2	6	2437085	2437090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_013198	GTGAGC	2	12	2437097	2437108	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7050	NC_013198	CCTGCT	2	12	2437369	2437380	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7051	NC_013198	TCGT	2	8	2437483	2437490	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7052	NC_013198	CAT	2	6	2437583	2437588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_013198	AAGA	2	8	2437592	2437599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_013198	AAG	2	6	2437609	2437614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_013198	CAAGG	2	10	2437626	2437635	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7056	NC_013198	TGA	2	6	2437636	2437641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_013198	A	6	6	2438883	2438888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_013198	TTG	2	6	2438940	2438945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_013198	TCC	2	6	2440214	2440219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7060	NC_013198	TTA	2	6	2440248	2440253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_013198	GTTC	2	8	2440260	2440267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7062	NC_013198	CCG	2	6	2441137	2441142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_013198	A	6	6	2441157	2441162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_013198	T	6	6	2441227	2441232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_013198	CTA	2	6	2441320	2441325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_013198	TGA	2	6	2441331	2441336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_013198	TCA	2	6	2441430	2441435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_013198	CAT	2	6	2441464	2441469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_013198	CAA	2	6	2441470	2441475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_013198	CT	3	6	2441489	2441494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7071	NC_013198	GTT	2	6	2441746	2441751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_013198	CTT	2	6	2441766	2441771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_013198	TTG	2	6	2441786	2441791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_013198	AAG	2	6	2441851	2441856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_013198	ATG	2	6	2441862	2441867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_013198	ACC	2	6	2441909	2441914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7077	NC_013198	AAC	2	6	2441915	2441920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_013198	AGC	2	6	2441953	2441958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_013198	ATC	3	9	2441965	2441973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_013198	A	6	6	2442012	2442017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_013198	TTG	2	6	2442085	2442090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_013198	TCAT	2	8	2442198	2442205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7083	NC_013198	AAAC	2	8	2442208	2442215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7084	NC_013198	T	6	6	2442253	2442258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_013198	AT	3	6	2442268	2442273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_013198	GCT	2	6	2442296	2442301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7087	NC_013198	CAA	2	6	2442321	2442326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_013198	TTA	2	6	2442959	2442964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_013198	GTT	2	6	2442980	2442985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_013198	ATAC	2	8	2443005	2443012	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7091	NC_013198	A	6	6	2443029	2443034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_013198	CCG	2	6	2443037	2443042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7093	NC_013198	CCT	2	6	2449795	2449800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7094	NC_013198	TTG	2	6	2449820	2449825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_013198	TAA	2	6	2449867	2449872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_013198	TAAA	2	8	2449884	2449891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_013198	TTC	2	6	2449895	2449900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_013198	CTT	2	6	2449910	2449915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_013198	AGC	2	6	2449927	2449932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_013198	AT	3	6	2449935	2449940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_013198	A	6	6	2449984	2449989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_013198	AAC	2	6	2450030	2450035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_013198	TTA	2	6	2450041	2450046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_013198	ACC	2	6	2450647	2450652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7105	NC_013198	TAA	2	6	2450691	2450696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_013198	TTCA	2	8	2450745	2450752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7107	NC_013198	TC	3	6	2450772	2450777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_013198	TCA	2	6	2452010	2452015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_013198	TTAG	2	8	2452051	2452058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_013198	AAC	2	6	2452067	2452072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_013198	A	7	7	2452088	2452094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_013198	T	6	6	2453342	2453347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_013198	ACT	2	6	2453350	2453355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_013198	A	6	6	2453477	2453482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_013198	GGT	2	6	2453522	2453527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_013198	T	6	6	2454189	2454194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_013198	T	6	6	2454230	2454235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_013198	GCT	2	6	2454267	2454272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_013198	AGG	2	6	2454302	2454307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_013198	GCT	2	6	2456263	2456268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_013198	CTA	2	6	2456589	2456594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_013198	TA	3	6	2456600	2456605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_013198	ATT	2	6	2456618	2456623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_013198	TAAC	2	8	2456638	2456645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7125	NC_013198	TGTGC	2	10	2456675	2456684	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7126	NC_013198	CTT	2	6	2459450	2459455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_013198	A	7	7	2459474	2459480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_013198	GCAC	2	8	2459576	2459583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7129	NC_013198	T	6	6	2460009	2460014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_013198	CTA	2	6	2460052	2460057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7132	NC_013198	A	6	6	2463724	2463729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7396	NC_013198	T	6	6	2533885	2533890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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