MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 8762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013198	C	6	6	2075562	2075567	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6002	NC_013198	CAT	2	6	2077649	2077654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_013198	TTCC	2	8	2077691	2077698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_013198	T	7	7	2077755	2077761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_013198	TGC	2	6	2077777	2077782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_013198	TCC	2	6	2077797	2077802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_013198	T	7	7	2077851	2077857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_013198	AAT	2	6	2077876	2077881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_013198	TAT	2	6	2077897	2077902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_013198	ACC	2	6	2077970	2077975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_013198	TTAT	2	8	2080213	2080220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_013198	ATA	2	6	2080228	2080233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_013198	TGA	2	6	2080236	2080241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_013198	T	6	6	2080255	2080260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_013198	GC	3	6	2080341	2080346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_013198	CAA	2	6	2080362	2080367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_013198	A	6	6	2080366	2080371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_013198	ATG	2	6	2080408	2080413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_013198	AGC	2	6	2080444	2080449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_013198	TTA	2	6	2081317	2081322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_013198	TAA	2	6	2081326	2081331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_013198	TGCT	2	8	2081347	2081354	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_013198	ACAA	2	8	2081356	2081363	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_013198	TCC	2	6	2084857	2084862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_013198	TTA	2	6	2084931	2084936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_013198	TAT	2	6	2084960	2084965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_013198	A	7	7	2085121	2085127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_013198	CCA	2	6	2085129	2085134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_013198	ATG	2	6	2085157	2085162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_013198	TGGT	2	8	2085184	2085191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_013198	ACA	2	6	2085618	2085623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_013198	ACC	2	6	2085651	2085656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_013198	AAC	2	6	2085672	2085677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_013198	T	6	6	2085711	2085716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_013198	AATA	2	8	2085758	2085765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_013198	CAC	2	6	2085780	2085785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_013198	TCA	2	6	2085798	2085803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_013198	TGA	2	6	2085835	2085840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_013198	TTA	2	6	2085845	2085850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_013198	AATA	2	8	2085872	2085879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_013198	GGTT	2	8	2085960	2085967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_013198	AATT	2	8	2086019	2086026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_013198	TAA	2	6	2086096	2086101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_013198	ATTT	2	8	2086151	2086158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_013198	TAT	2	6	2086166	2086171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_013198	ACT	2	6	2086172	2086177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_013198	A	7	7	2086188	2086194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_013198	GCC	2	6	2086198	2086203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_013198	TCC	2	6	2088398	2088403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_013198	TTG	2	6	2088404	2088409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_013198	GGT	2	6	2088430	2088435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_013198	TTA	2	6	2088446	2088451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_013198	TGC	2	6	2088467	2088472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_013198	A	6	6	2088600	2088605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_013198	TCGTG	2	10	2088633	2088642	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6056	NC_013198	TTG	2	6	2088652	2088657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_013198	TAT	2	6	2088697	2088702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_013198	T	6	6	2088739	2088744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_013198	TCAA	2	8	2088756	2088763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_013198	T	7	7	2089602	2089608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_013198	GGA	2	6	2089681	2089686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_013198	ATA	2	6	2090603	2090608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_013198	ACC	2	6	2090615	2090620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_013198	TGG	2	6	2090650	2090655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_013198	AAGTT	2	10	2090679	2090688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_013198	ATC	2	6	2092880	2092885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_013198	TCC	2	6	2094391	2094396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_013198	TTA	2	6	2094465	2094470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_013198	TAT	2	6	2094494	2094499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_013198	TTA	2	6	2094892	2094897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_013198	AAC	2	6	2094917	2094922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_013198	CTT	2	6	2095013	2095018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_013198	ATT	2	6	2095067	2095072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_013198	TAC	2	6	2095130	2095135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_013198	T	7	7	2095191	2095197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_013198	AGC	2	6	2095238	2095243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_013198	A	6	6	2095247	2095252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_013198	GAT	2	6	2095350	2095355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_013198	TCC	2	6	2096047	2096052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_013198	ATTT	2	8	2096075	2096082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_013198	T	6	6	2096095	2096100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_013198	CTT	2	6	2096401	2096406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_013198	TTAA	2	8	2096419	2096426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_013198	AT	3	6	2096446	2096451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_013198	ATTT	2	8	2096466	2096473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_013198	ATA	2	6	2096478	2096483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_013198	GCA	2	6	2096484	2096489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_013198	TCAA	2	8	2096507	2096514	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_013198	T	6	6	2097763	2097768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_013198	ATC	2	6	2097778	2097783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_013198	TGA	2	6	2097818	2097823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_013198	GTT	2	6	2097855	2097860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_013198	GAT	2	6	2097876	2097881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_013198	A	6	6	2098932	2098937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_013198	CT	3	6	2098948	2098953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_013198	AAC	2	6	2098957	2098962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_013198	CT	3	6	2101875	2101880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_013198	A	6	6	2101886	2101891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_013198	ATG	2	6	2105819	2105824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_013198	A	6	6	2107559	2107564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_013198	ATA	2	6	2107624	2107629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_013198	TTA	2	6	2107754	2107759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_013198	AT	3	6	2108631	2108636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_013198	TCT	2	6	2108650	2108655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_013198	A	7	7	2108663	2108669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_013198	TTTA	2	8	2108711	2108718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_013198	TCG	2	6	2109678	2109683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_013198	TAA	2	6	2110033	2110038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_013198	TTA	2	6	2110114	2110119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_013198	TCAAG	2	10	2110145	2110154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6111	NC_013198	A	6	6	2110225	2110230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_013198	GAG	2	6	2110247	2110252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_013198	AACTT	2	10	2110292	2110301	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6114	NC_013198	TAA	2	6	2110835	2110840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_013198	CGA	2	6	2110841	2110846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_013198	TCG	2	6	2110863	2110868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_013198	GC	3	6	2110874	2110879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_013198	TCC	2	6	2111868	2111873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_013198	CTGC	2	8	2111967	2111974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_013198	CCG	2	6	2112113	2112118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_013198	GCG	2	6	2112472	2112477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_013198	ATT	2	6	2112528	2112533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_013198	TAA	2	6	2112534	2112539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_013198	CA	3	6	2112559	2112564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_013198	TAAC	2	8	2112587	2112594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6126	NC_013198	T	7	7	2112660	2112666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_013198	A	6	6	2112670	2112675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_013198	GGGT	2	8	2112683	2112690	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_013198	CA	3	6	2113342	2113347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_013198	AGA	2	6	2113369	2113374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_013198	TGT	2	6	2113522	2113527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_013198	T	6	6	2117564	2117569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_013198	TAA	2	6	2117582	2117587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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