MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 10967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012984	TGAC	2	8	1197223	1197230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_012984	TTG	2	6	1197233	1197238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_012984	T	6	6	1197252	1197257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_012984	ACT	2	6	1197259	1197264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_012984	GATT	2	8	1197289	1197296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_012984	TGG	2	6	1197363	1197368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_012984	CTTAA	2	10	1197393	1197402	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4008	NC_012984	GGC	2	6	1197445	1197450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_012984	CTG	2	6	1197454	1197459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_012984	T	6	6	1197512	1197517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_012984	CGG	2	6	1197542	1197547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_012984	GAATT	2	10	1197622	1197631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_012984	TTGT	2	8	1197637	1197644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_012984	TAAAT	2	10	1200141	1200150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_012984	AACT	2	8	1200162	1200169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_012984	T	6	6	1200197	1200202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_012984	TTAC	2	8	1201141	1201148	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4018	NC_012984	ATT	2	6	1201150	1201155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_012984	GAC	2	6	1201161	1201166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_012984	GGA	2	6	1201198	1201203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_012984	GT	3	6	1203172	1203177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_012984	ATC	2	6	1203251	1203256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_012984	ATA	2	6	1203366	1203371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_012984	A	7	7	1203378	1203384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_012984	TAA	2	6	1205212	1205217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_012984	GAA	2	6	1209493	1209498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_012984	AAG	2	6	1210280	1210285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_012984	A	6	6	1211033	1211038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_012984	AT	3	6	1211046	1211051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_012984	A	7	7	1211060	1211066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_012984	TTA	2	6	1211517	1211522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_012984	TCAA	2	8	1211561	1211568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_012984	CTAA	2	8	1211601	1211608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_012984	GGT	2	6	1211630	1211635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_012984	TTTG	2	8	1211648	1211655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_012984	TGT	2	6	1211669	1211674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_012984	TTG	2	6	1211684	1211689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_012984	TAGT	2	8	1211718	1211725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_012984	TGAC	2	8	1211734	1211741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_012984	GT	3	6	1211759	1211764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_012984	TAG	2	6	1211828	1211833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_012984	TAA	2	6	1211850	1211855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_012984	GTA	2	6	1211860	1211865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_012984	GTC	2	6	1211916	1211921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_012984	TTAG	2	8	1211925	1211932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_012984	CT	4	8	1211946	1211953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_012984	GT	3	6	1214997	1215002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_012984	CAC	2	6	1215035	1215040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_012984	ATC	2	6	1215041	1215046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_012984	TCA	2	6	1215157	1215162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_012984	GTTA	2	8	1215179	1215186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_012984	TCA	2	6	1215196	1215201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_012984	TACA	2	8	1215216	1215223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_012984	AAG	2	6	1215297	1215302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_012984	CCT	2	6	1215529	1215534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_012984	ATTTG	2	10	1217154	1217163	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_012984	TCG	2	6	1217205	1217210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_012984	ATT	2	6	1217260	1217265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_012984	GTT	2	6	1218281	1218286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_012984	TGAG	2	8	1218296	1218303	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_012984	CAAA	2	8	1218329	1218336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4062	NC_012984	ATG	2	6	1218434	1218439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_012984	CGGC	2	8	1218471	1218478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_012984	T	6	6	1218504	1218509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_012984	TCA	2	6	1218806	1218811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_012984	TGAT	2	8	1219687	1219694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_012984	ATTT	2	8	1219735	1219742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_012984	TTG	2	6	1219752	1219757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_012984	GAT	2	6	1219787	1219792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_012984	GGC	2	6	1219852	1219857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_012984	TAT	2	6	1219858	1219863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_012984	TAT	2	6	1219870	1219875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_012984	A	6	6	1219948	1219953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_012984	GGA	2	6	1219954	1219959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_012984	CAAT	2	8	1221963	1221970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4076	NC_012984	AAC	2	6	1221992	1221997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_012984	GAA	2	6	1222003	1222008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_012984	T	6	6	1222069	1222074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_012984	GTAT	2	8	1222229	1222236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_012984	TTTA	2	8	1223194	1223201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_012984	GTA	2	6	1223266	1223271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_012984	AAAT	2	8	1223274	1223281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_012984	T	7	7	1223965	1223971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_012984	TG	3	6	1223985	1223990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_012984	GTCA	2	8	1224051	1224058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4086	NC_012984	TAT	2	6	1226317	1226322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_012984	T	6	6	1226335	1226340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_012984	T	6	6	1226782	1226787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_012984	ACT	2	6	1226833	1226838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_012984	ATTT	2	8	1226842	1226849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_012984	GTT	2	6	1226851	1226856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_012984	A	6	6	1226877	1226882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_012984	ACT	2	6	1227519	1227524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_012984	TTG	2	6	1227573	1227578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_012984	CAA	2	6	1227620	1227625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_012984	A	7	7	1227634	1227640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_012984	GCC	2	6	1227756	1227761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_012984	GAT	2	6	1228156	1228161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_012984	ATA	2	6	1228187	1228192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_012984	AAT	2	6	1228201	1228206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_012984	A	6	6	1228234	1228239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_012984	TTC	2	6	1228266	1228271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_012984	TA	3	6	1228287	1228292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_012984	TGGA	2	8	1228338	1228345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_012984	CTA	2	6	1228400	1228405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_012984	T	7	7	1228419	1228425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_012984	A	6	6	1228463	1228468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_012984	ATAC	2	8	1228479	1228486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_012984	ATT	2	6	1228491	1228496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_012984	ATTT	2	8	1228541	1228548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_012984	T	6	6	1228546	1228551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_012984	ATT	2	6	1228582	1228587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_012984	GCTA	2	8	1228596	1228603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_012984	CAA	2	6	1228683	1228688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_012984	A	6	6	1228687	1228692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_012984	CCT	2	6	1229217	1229222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_012984	CTAT	2	8	1229226	1229233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_012984	AATT	2	8	1229251	1229258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_012984	ATTT	2	8	1229303	1229310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_012984	AAT	2	6	1229886	1229891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_012984	CGT	2	6	1229911	1229916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_012984	T	6	6	1230267	1230272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_012984	TAAA	2	8	1232587	1232594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_012984	T	6	6	1232617	1232622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_012984	CAA	2	6	1232828	1232833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_012984	GT	3	6	1232903	1232908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_012984	AGGTG	2	10	1232918	1232927	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_012984	ATT	2	6	1232953	1232958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_012984	GAA	2	6	1232976	1232981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_012984	ACT	2	6	1233006	1233011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_012984	CAGG	2	8	1233094	1233101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_012984	AAC	2	6	1233182	1233187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_012984	A	7	7	1233213	1233219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_012984	TAATTG	2	12	1233252	1233263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_012984	TAC	2	6	1233335	1233340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_012984	CAG	2	6	1233373	1233378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_012984	CCT	2	6	1233854	1233859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4138	NC_012984	GAT	2	6	1233904	1233909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_012984	TCA	2	6	1233927	1233932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_012984	T	6	6	1233970	1233975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_012984	AGA	2	6	1235162	1235167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_012984	GCAA	2	8	1235662	1235669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4143	NC_012984	GTC	2	6	1235670	1235675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4144	NC_012984	GAC	2	6	1235684	1235689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4145	NC_012984	T	8	8	1235693	1235700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_012984	GGC	2	6	1236173	1236178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4148	NC_012984	A	6	6	1240403	1240408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_012984	ACC	2	6	1240453	1240458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4150	NC_012984	TTA	2	6	1240515	1240520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_012984	TCA	2	6	1240535	1240540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4152	NC_012984	GTG	2	6	1240556	1240561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_012984	TCA	2	6	1240580	1240585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4154	NC_012984	GGTTT	2	10	1240596	1240605	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4157	NC_012984	ACC	2	6	1240690	1240695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4158	NC_012984	ATT	2	6	1240714	1240719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_012984	T	6	6	1240718	1240723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_012984	GGTTG	2	10	1240883	1240892	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4164	NC_012984	T	7	7	1241139	1241145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_012984	AAAT	2	8	1241221	1241228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_012984	AAT	3	9	1241226	1241234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_012984	GAT	2	6	1241241	1241246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_012984	TAA	2	6	1245618	1245623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4169	NC_012984	ATTG	2	8	1245787	1245794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4170	NC_012984	A	6	6	1245802	1245807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4172	NC_012984	CGTC	2	8	1247724	1247731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4173	NC_012984	ATC	2	6	1247845	1247850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4246	NC_012984	TTGG	2	8	1270117	1270124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4253	NC_012984	T	7	7	1272844	1272850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4255	NC_012984	CAA	2	6	1272920	1272925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_012984	TTG	2	6	1272967	1272972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4258	NC_012984	AGCT	2	8	1275225	1275232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4259	NC_012984	GAC	2	6	1275282	1275287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_012984	GAG	2	6	1275297	1275302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_012984	T	6	6	1275707	1275712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_012984	TGA	2	6	1280478	1280483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_012984	GGGT	2	8	1280496	1280503	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_012984	ATAAA	2	10	1280544	1280553	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4396	NC_012984	AAT	2	6	1324770	1324775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4397	NC_012984	TCA	2	6	1324776	1324781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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