MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 10967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012984	CTTGG	2	10	2419616	2419625	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8002	NC_012984	T	6	6	2419756	2419761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_012984	A	6	6	2419793	2419798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_012984	TC	3	6	2419828	2419833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8005	NC_012984	CCA	2	6	2419857	2419862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8006	NC_012984	TGG	2	6	2419899	2419904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_012984	ATCA	2	8	2419915	2419922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8008	NC_012984	TAAT	2	8	2420687	2420694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_012984	TCC	2	6	2421556	2421561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_012984	A	7	7	2421624	2421630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_012984	AATT	2	8	2421644	2421651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_012984	ATCA	2	8	2421675	2421682	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8013	NC_012984	ATC	2	6	2421689	2421694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_012984	ATT	2	6	2421703	2421708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_012984	AACT	2	8	2421716	2421723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8016	NC_012984	CA	3	6	2423105	2423110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8017	NC_012984	AATTA	2	10	2423147	2423156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_012984	A	6	6	2423156	2423161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_012984	CAA	2	6	2423353	2423358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_012984	ACA	2	6	2423380	2423385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_012984	TCA	2	6	2423388	2423393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_012984	GTC	2	6	2423395	2423400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_012984	TAA	2	6	2423927	2423932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_012984	CT	3	6	2423941	2423946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8025	NC_012984	AAT	2	6	2423988	2423993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_012984	TAAA	2	8	2424007	2424014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_012984	A	6	6	2424012	2424017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_012984	GGA	2	6	2424087	2424092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_012984	TCA	2	6	2425958	2425963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_012984	TAC	2	6	2425966	2425971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_012984	CAGC	2	8	2426005	2426012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8032	NC_012984	T	6	6	2427648	2427653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_012984	TGA	2	6	2427708	2427713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_012984	ACC	2	6	2427754	2427759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8035	NC_012984	CAC	2	6	2427816	2427821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8036	NC_012984	CTCATT	2	12	2427846	2427857	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_012984	CAT	2	6	2427868	2427873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_012984	GCA	2	6	2427879	2427884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_012984	AGT	2	6	2427910	2427915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_012984	ATT	2	6	2427939	2427944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_012984	ACT	2	6	2428011	2428016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_012984	A	6	6	2428590	2428595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_012984	CCT	2	6	2429816	2429821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8044	NC_012984	A	6	6	2429822	2429827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_012984	ACCCA	2	10	2429848	2429857	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8046	NC_012984	TAA	2	6	2429966	2429971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_012984	T	6	6	2430040	2430045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_012984	ATT	2	6	2430056	2430061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_012984	CTG	2	6	2430069	2430074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_012984	CCA	2	6	2430093	2430098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_012984	ACC	2	6	2430167	2430172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8052	NC_012984	TTA	2	6	2430173	2430178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_012984	AAT	2	6	2430714	2430719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_012984	GC	3	6	2431826	2431831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8055	NC_012984	TCT	2	6	2433374	2433379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_012984	TCA	3	9	2433487	2433495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_012984	ATTA	2	8	2433507	2433514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_012984	TTA	2	6	2433553	2433558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_012984	TAA	2	6	2433585	2433590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_012984	GTTC	2	8	2433594	2433601	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8061	NC_012984	AGA	2	6	2433653	2433658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_012984	AGA	3	9	2433671	2433679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_012984	GAA	2	6	2433697	2433702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_012984	TCC	2	6	2433723	2433728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8065	NC_012984	CAAG	2	8	2433737	2433744	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8066	NC_012984	GTTA	2	8	2433817	2433824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_012984	TAA	2	6	2433847	2433852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_012984	TTA	2	6	2433854	2433859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8070	NC_012984	T	6	6	2433936	2433941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_012984	CCAAG	2	10	2434111	2434120	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8072	NC_012984	AAT	2	6	2434246	2434251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_012984	ATCA	2	8	2434255	2434262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8074	NC_012984	TCAA	2	8	2434304	2434311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8075	NC_012984	TAA	2	6	2434317	2434322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_012984	CGTTT	2	10	2434359	2434368	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8077	NC_012984	CAA	2	6	2434391	2434396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_012984	TAAGT	2	10	2434407	2434416	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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8082	NC_012984	TTTCC	2	10	2435892	2435901	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8083	NC_012984	TGA	2	6	2435951	2435956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8086	NC_012984	TATTT	2	10	2436750	2436759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_012984	TAGGAC	2	12	2436805	2436816	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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8092	NC_012984	TAA	2	6	2438867	2438872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_012984	CT	3	6	2439490	2439495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8095	NC_012984	TAT	2	6	2440647	2440652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_012984	ATA	2	6	2440673	2440678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_012984	GTT	2	6	2441534	2441539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_012984	ATA	2	6	2441646	2441651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_012984	A	7	7	2441658	2441664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_012984	ACG	2	6	2446444	2446449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_012984	TAA	2	6	2446490	2446495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_012984	T	6	6	2446521	2446526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_012984	TGA	2	6	2446556	2446561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8107	NC_012984	TTAT	2	8	2446643	2446650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_012984	CGGT	2	8	2446665	2446672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8109	NC_012984	AAC	2	6	2446698	2446703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8112	NC_012984	C	6	6	2447952	2447957	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8113	NC_012984	AC	3	6	2447996	2448001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8114	NC_012984	ATTGC	2	10	2448013	2448022	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8115	NC_012984	ATG	2	6	2448132	2448137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8117	NC_012984	T	6	6	2449322	2449327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_012984	GTC	2	6	2449364	2449369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8123	NC_012984	GTA	2	6	2450213	2450218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8126	NC_012984	C	6	6	2450499	2450504	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8127	NC_012984	GGA	2	6	2450629	2450634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_012984	ATT	2	6	2452767	2452772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_012984	AAC	2	6	2452783	2452788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_012984	AGCA	2	8	2452789	2452796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8132	NC_012984	AAC	2	6	2452881	2452886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8397	NC_012984	GAC	2	6	2520942	2520947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8398	NC_012984	ATTG	2	8	2523742	2523749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8399	NC_012984	TA	4	8	2523786	2523793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8400	NC_012984	T	6	6	2523907	2523912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8401	NC_012984	T	6	6	2523919	2523924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8402	NC_012984	AATC	2	8	2523944	2523951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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