MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 10967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_012984	TGA	2	6	2288093	2288098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_012984	TATAA	2	10	2288103	2288112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_012984	CAA	2	6	2288141	2288146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_012984	CAC	2	6	2288526	2288531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7505	NC_012984	TTAATA	2	12	2288539	2288550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_012984	AAG	2	6	2288611	2288616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_012984	TAA	2	6	2290138	2290143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_012984	AAC	2	6	2290170	2290175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_012984	TGC	2	6	2290223	2290228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_012984	AAT	2	6	2290296	2290301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_012984	ACC	2	6	2290309	2290314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7512	NC_012984	CA	3	6	2291698	2291703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7513	NC_012984	TTG	2	6	2291750	2291755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_012984	TAT	2	6	2291758	2291763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_012984	GTA	2	6	2293855	2293860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_012984	AAT	2	6	2293890	2293895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_012984	GTG	2	6	2293903	2293908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_012984	ATG	2	6	2293912	2293917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_012984	A	6	6	2294066	2294071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_012984	T	6	6	2294098	2294103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_012984	TCA	3	9	2294107	2294115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7522	NC_012984	CGTAA	2	10	2294223	2294232	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7523	NC_012984	TC	3	6	2295079	2295084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7524	NC_012984	TAA	2	6	2295137	2295142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_012984	ATA	2	6	2295149	2295154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_012984	A	6	6	2296939	2296944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_012984	AGT	2	6	2297010	2297015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_012984	TTAA	2	8	2297594	2297601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_012984	CAA	2	6	2297611	2297616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7530	NC_012984	ATT	2	6	2297629	2297634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_012984	ACC	2	6	2297663	2297668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7532	NC_012984	TCC	2	6	2305033	2305038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7533	NC_012984	CTGAA	2	10	2305040	2305049	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7534	NC_012984	A	7	7	2305097	2305103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_012984	TAT	2	6	2305128	2305133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_012984	TGC	2	6	2305176	2305181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_012984	CTG	2	6	2305210	2305215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_012984	AACG	2	8	2305302	2305309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7539	NC_012984	TCC	2	6	2308815	2308820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7540	NC_012984	CGG	2	6	2308836	2308841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_012984	TA	3	6	2315364	2315369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_012984	A	7	7	2315369	2315375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_012984	CT	3	6	2315453	2315458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7544	NC_012984	A	7	7	2316079	2316085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_012984	CCA	2	6	2316201	2316206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_012984	GAC	2	6	2316249	2316254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_012984	CAT	2	6	2316284	2316289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7548	NC_012984	ATG	2	6	2316362	2316367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_012984	GGA	2	6	2316434	2316439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_012984	CAA	2	6	2316488	2316493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_012984	CAA	3	9	2316540	2316548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7552	NC_012984	TAGC	2	8	2316699	2316706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7553	NC_012984	CAG	2	6	2316795	2316800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_012984	TAC	2	6	2316944	2316949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_012984	TTTTCA	2	12	2318577	2318588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7556	NC_012984	A	7	7	2318595	2318601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_012984	TA	3	6	2318696	2318701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_012984	T	7	7	2318789	2318795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_012984	GA	3	6	2318816	2318821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_012984	AGC	2	6	2320188	2320193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_012984	T	8	8	2320227	2320234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_012984	ATTG	2	8	2320265	2320272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_012984	T	6	6	2320286	2320291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_012984	CGT	2	6	2320305	2320310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_012984	T	7	7	2320323	2320329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_012984	CTTT	2	8	2320337	2320344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7567	NC_012984	TGC	2	6	2320368	2320373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_012984	TTG	2	6	2320478	2320483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_012984	T	6	6	2320493	2320498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_012984	ATG	2	6	2321847	2321852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_012984	T	6	6	2321892	2321897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_012984	TGG	2	6	2322914	2322919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_012984	ATT	2	6	2322996	2323001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_012984	TTG	2	6	2323024	2323029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_012984	ACG	2	6	2323081	2323086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7576	NC_012984	AAT	2	6	2325835	2325840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_012984	TGA	2	6	2325841	2325846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_012984	CCAA	2	8	2325879	2325886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7579	NC_012984	AATT	2	8	2326689	2326696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_012984	ACCA	2	8	2326777	2326784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7581	NC_012984	GCAC	2	8	2328093	2328100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7582	NC_012984	ATTA	2	8	2338236	2338243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_012984	ATA	2	6	2338375	2338380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_012984	TTA	2	6	2338381	2338386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_012984	TCA	2	6	2338411	2338416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7587	NC_012984	CAA	2	6	2338502	2338507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7588	NC_012984	ACTG	2	8	2338590	2338597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7589	NC_012984	CAA	2	6	2338618	2338623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7590	NC_012984	A	7	7	2338678	2338684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_012984	AAC	2	6	2340649	2340654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7592	NC_012984	TA	3	6	2340682	2340687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_012984	AAAG	2	8	2340726	2340733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_012984	AAC	2	6	2340770	2340775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_012984	T	6	6	2340862	2340867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_012984	TTCTA	2	10	2342721	2342730	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7597	NC_012984	TAAA	2	8	2342942	2342949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_012984	A	6	6	2342947	2342952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_012984	AAT	2	6	2342962	2342967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_012984	GGA	2	6	2342973	2342978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_012984	CTTTAG	2	12	2344457	2344468	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7602	NC_012984	A	6	6	2344474	2344479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_012984	ATG	2	6	2344497	2344502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_012984	T	7	7	2344517	2344523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_012984	TGAT	2	8	2344525	2344532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_012984	ACT	2	6	2344544	2344549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7607	NC_012984	CAA	2	6	2344565	2344570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7608	NC_012984	CTC	3	9	2345611	2345619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7609	NC_012984	ATT	2	6	2345655	2345660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_012984	TTC	2	6	2345701	2345706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_012984	A	7	7	2345747	2345753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_012984	TTA	2	6	2345805	2345810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_012984	TCG	2	6	2345868	2345873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7614	NC_012984	GTTA	2	8	2345874	2345881	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_012984	TTA	2	6	2345917	2345922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_012984	ACT	2	6	2345953	2345958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7617	NC_012984	AAT	2	6	2346012	2346017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_012984	TAGT	2	8	2346045	2346052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_012984	AACT	2	8	2346082	2346089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7620	NC_012984	AG	3	6	2346092	2346097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_012984	GGA	2	6	2348684	2348689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_012984	A	6	6	2351060	2351065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_012984	T	6	6	2351107	2351112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_012984	GTTG	2	8	2351684	2351691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_012984	ACTA	2	8	2351709	2351716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7626	NC_012984	CAG	2	6	2351728	2351733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7627	NC_012984	ATA	2	6	2351761	2351766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_012984	ACA	2	6	2351770	2351775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7629	NC_012984	TAA	2	6	2352122	2352127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_012984	CGT	2	6	2352598	2352603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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