MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 10967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_012984	TAA	2	6	2161182	2161187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_012984	AGG	2	6	2161194	2161199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_012984	TCAAA	2	10	2161788	2161797	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7004	NC_012984	ATC	3	9	2162368	2162376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_012984	TGA	2	6	2162419	2162424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_012984	ATT	2	6	2162432	2162437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_012984	CTG	2	6	2162443	2162448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_012984	ATTA	2	8	2162489	2162496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_012984	CAA	2	6	2162501	2162506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_012984	GC	3	6	2163807	2163812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_012984	AAT	2	6	2163822	2163827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_012984	CAG	2	6	2163839	2163844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_012984	AAT	2	6	2163874	2163879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_012984	CTT	2	6	2166210	2166215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_012984	AGCA	2	8	2166242	2166249	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7016	NC_012984	GTT	3	9	2166284	2166292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_012984	T	6	6	2166291	2166296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_012984	ATT	3	9	2166371	2166379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_012984	AGC	2	6	2166423	2166428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_012984	TTAG	2	8	2166473	2166480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_012984	CCAAG	2	10	2166583	2166592	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7022	NC_012984	TAA	2	6	2166789	2166794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_012984	CGTTT	2	10	2166831	2166840	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7024	NC_012984	TGCT	2	8	2166948	2166955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7025	NC_012984	ATT	2	6	2167076	2167081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_012984	CAC	2	6	2167713	2167718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7027	NC_012984	AAC	2	6	2167767	2167772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_012984	T	6	6	2167784	2167789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_012984	C	6	6	2168144	2168149	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7030	NC_012984	A	7	7	2168259	2168265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_012984	A	7	7	2170468	2170474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_012984	TAA	2	6	2170503	2170508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_012984	CGCT	2	8	2171532	2171539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7034	NC_012984	CTA	2	6	2171577	2171582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_012984	AAC	2	6	2171603	2171608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_012984	GAT	2	6	2171620	2171625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_012984	ACT	2	6	2171653	2171658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_012984	A	6	6	2171670	2171675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_012984	AAT	2	6	2171713	2171718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_012984	CG	3	6	2171745	2171750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7041	NC_012984	ACC	2	6	2171753	2171758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7042	NC_012984	CAA	2	6	2171801	2171806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_012984	AAT	2	6	2171821	2171826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_012984	TCA	2	6	2171885	2171890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_012984	TCA	2	6	2171957	2171962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_012984	ATA	2	6	2171981	2171986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_012984	T	6	6	2172022	2172027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_012984	CTGT	2	8	2172037	2172044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7049	NC_012984	ATC	2	6	2172055	2172060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_012984	CTC	2	6	2172995	2173000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_012984	GTCA	2	8	2173006	2173013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7052	NC_012984	A	7	7	2173092	2173098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_012984	ATC	2	6	2174448	2174453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_012984	A	8	8	2176664	2176671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_012984	CCAT	2	8	2176676	2176683	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7056	NC_012984	ACC	2	6	2176729	2176734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7057	NC_012984	GTT	2	6	2176735	2176740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_012984	CGA	2	6	2176766	2176771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_012984	AT	3	6	2176801	2176806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_012984	CAT	2	6	2176841	2176846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_012984	TC	3	6	2176883	2176888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7062	NC_012984	CT	3	6	2176901	2176906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7063	NC_012984	CTCTT	2	10	2176927	2176936	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7064	NC_012984	TTTAA	2	10	2176954	2176963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_012984	ACC	2	6	2176976	2176981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7066	NC_012984	AGC	2	6	2177068	2177073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_012984	TGA	2	6	2177223	2177228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_012984	TCG	2	6	2177231	2177236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_012984	TCAA	2	8	2177262	2177269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7070	NC_012984	GTA	2	6	2177319	2177324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_012984	TC	3	6	2177333	2177338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7072	NC_012984	GGT	2	6	2177418	2177423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_012984	TCA	2	6	2177427	2177432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_012984	TGCT	2	8	2177480	2177487	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7075	NC_012984	CCCCG	2	10	2177628	2177637	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7076	NC_012984	GAAC	2	8	2177650	2177657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7077	NC_012984	CGA	2	6	2177664	2177669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_012984	T	6	6	2177992	2177997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_012984	T	6	6	2178029	2178034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_012984	TCA	2	6	2180764	2180769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_012984	T	6	6	2180771	2180776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_012984	GAT	2	6	2180777	2180782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_012984	T	7	7	2180789	2180795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_012984	ATTT	2	8	2180828	2180835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_012984	CTAAA	2	10	2180863	2180872	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7086	NC_012984	AAT	2	6	2180913	2180918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_012984	CTAAA	2	10	2180975	2180984	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7088	NC_012984	TTAA	2	8	2182372	2182379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_012984	CA	3	6	2182409	2182414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7090	NC_012984	GAA	2	6	2182420	2182425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7092	NC_012984	TCA	2	6	2182454	2182459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_012984	TTA	2	6	2182529	2182534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7096	NC_012984	TTC	2	6	2182665	2182670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7097	NC_012984	CTAG	2	8	2182831	2182838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7098	NC_012984	TCAA	2	8	2182994	2183001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7099	NC_012984	CAGA	2	8	2183006	2183013	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7100	NC_012984	TAA	2	6	2183055	2183060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_012984	A	6	6	2183118	2183123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_012984	ATT	2	6	2183223	2183228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_012984	TTC	2	6	2183246	2183251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_012984	TAA	2	6	2183446	2183451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_012984	TAT	2	6	2183502	2183507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_012984	ATG	2	6	2183520	2183525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_012984	TCA	2	6	2183538	2183543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_012984	AAT	2	6	2185241	2185246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_012984	TCG	2	6	2185291	2185296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_012984	TCA	2	6	2185307	2185312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_012984	CCT	2	6	2185925	2185930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7112	NC_012984	CAG	2	6	2186047	2186052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_012984	CAA	2	6	2186059	2186064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_012984	A	7	7	2186063	2186069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_012984	TCT	2	6	2187520	2187525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7116	NC_012984	TCA	2	6	2187535	2187540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_012984	CCAA	2	8	2187594	2187601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7118	NC_012984	TCA	2	6	2187636	2187641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_012984	TCC	2	6	2190640	2190645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7120	NC_012984	ACT	2	6	2190690	2190695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_012984	CCT	2	6	2193800	2193805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7122	NC_012984	A	6	6	2193940	2193945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_012984	GGCTAA	2	12	2194062	2194073	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7124	NC_012984	TG	3	6	2194104	2194109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_012984	CTGT	2	8	2194120	2194127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7126	NC_012984	CT	3	6	2194148	2194153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7127	NC_012984	TTA	2	6	2194194	2194199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_012984	TCA	2	6	2195096	2195101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_012984	T	8	8	2195133	2195140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_012984	TTAT	3	12	2195215	2195226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7132	NC_012984	G	6	6	2195299	2195304	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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7268	NC_012984	ATT	2	6	2229330	2229335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7398	NC_012984	ATT	2	6	2262777	2262782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7399	NC_012984	TTA	2	6	2262783	2262788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7401	NC_012984	ATT	2	6	2262821	2262826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7430	NC_012984	TCT	2	6	2267621	2267626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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