MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 10967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012984	A	8	8	2027625	2027632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_012984	TCA	2	6	2027640	2027645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_012984	CTTTAA	2	12	2028095	2028106	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6504	NC_012984	TCC	2	6	2029284	2029289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6505	NC_012984	AAT	2	6	2029313	2029318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_012984	AGTC	2	8	2029381	2029388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6507	NC_012984	CTT	2	6	2029440	2029445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_012984	TAT	2	6	2029467	2029472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_012984	A	6	6	2032281	2032286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_012984	TAAA	2	8	2032293	2032300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_012984	TGCT	2	8	2032310	2032317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6512	NC_012984	GCC	2	6	2032429	2032434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6513	NC_012984	ATGCT	2	10	2032446	2032455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6514	NC_012984	CTT	2	6	2033074	2033079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_012984	AAG	2	6	2033100	2033105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_012984	TAA	2	6	2036317	2036322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_012984	CAA	2	6	2036347	2036352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_012984	CGC	2	6	2036823	2036828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_012984	GTT	2	6	2036844	2036849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_012984	T	6	6	2036848	2036853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_012984	T	6	6	2036891	2036896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_012984	ACT	2	6	2036906	2036911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_012984	ATT	2	6	2036952	2036957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_012984	CTTG	2	8	2037046	2037053	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6525	NC_012984	GT	3	6	2037054	2037059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_012984	GTG	2	6	2037104	2037109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_012984	CAC	2	6	2037192	2037197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6528	NC_012984	TGA	2	6	2037267	2037272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_012984	TCAA	2	8	2037306	2037313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6530	NC_012984	ATA	2	6	2037328	2037333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_012984	TAG	2	6	2037364	2037369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_012984	GGT	2	6	2037461	2037466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_012984	TCA	2	6	2037470	2037475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_012984	ATT	2	6	2037532	2037537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_012984	AAC	2	6	2037686	2037691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_012984	CGC	2	6	2037782	2037787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6537	NC_012984	AAT	2	6	2037789	2037794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_012984	AAT	2	6	2039858	2039863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_012984	ACCT	2	8	2039926	2039933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6540	NC_012984	TCA	2	6	2039956	2039961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_012984	ATG	2	6	2039984	2039989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_012984	ATT	2	6	2043558	2043563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_012984	ATT	2	6	2043569	2043574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_012984	CTG	2	6	2043599	2043604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_012984	A	7	7	2043611	2043617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_012984	CAC	2	6	2045225	2045230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6547	NC_012984	ATT	2	6	2045283	2045288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_012984	AC	3	6	2045290	2045295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6549	NC_012984	CT	3	6	2045351	2045356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6550	NC_012984	A	6	6	2045396	2045401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_012984	AAAT	2	8	2045408	2045415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_012984	ATT	2	6	2046585	2046590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_012984	TCC	2	6	2046591	2046596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6554	NC_012984	GCAA	2	8	2046648	2046655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6555	NC_012984	AT	3	6	2047942	2047947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_012984	GAT	2	6	2047988	2047993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_012984	TA	3	6	2048011	2048016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_012984	ATTA	2	8	2048127	2048134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_012984	CCT	2	6	2048799	2048804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6560	NC_012984	AGC	2	6	2049756	2049761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_012984	TCC	2	6	2052356	2052361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6562	NC_012984	TAA	2	6	2052371	2052376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_012984	ATA	2	6	2052377	2052382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_012984	T	8	8	2052421	2052428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_012984	ATT	2	6	2052455	2052460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_012984	ATTAA	2	10	2052467	2052476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_012984	ATT	2	6	2052533	2052538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_012984	T	6	6	2053947	2053952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_012984	TCA	2	6	2053966	2053971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_012984	TTG	3	9	2053973	2053981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_012984	TCGT	2	8	2054010	2054017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6572	NC_012984	CAT	2	6	2054107	2054112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_012984	AAT	2	6	2054163	2054168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_012984	AGCA	2	8	2054289	2054296	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6575	NC_012984	CG	4	8	2054313	2054320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_012984	ATT	2	6	2054441	2054446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_012984	TCTG	2	8	2054489	2054496	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6578	NC_012984	GAC	2	6	2054749	2054754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_012984	CAAG	2	8	2054761	2054768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6580	NC_012984	GTT	2	6	2054809	2054814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_012984	CAA	2	6	2054838	2054843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_012984	CGTC	2	8	2054917	2054924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6583	NC_012984	ATG	2	6	2056492	2056497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_012984	TCCC	2	8	2057152	2057159	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6585	NC_012984	A	6	6	2057215	2057220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6587	NC_012984	TAA	2	6	2057277	2057282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_012984	TTA	2	6	2057291	2057296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_012984	ATA	2	6	2057314	2057319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_012984	A	7	7	2057319	2057325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_012984	CA	3	6	2057394	2057399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6592	NC_012984	CCG	2	6	2057429	2057434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6593	NC_012984	CAT	2	6	2057518	2057523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_012984	CTCG	2	8	2057530	2057537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6595	NC_012984	ACT	2	6	2057552	2057557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6597	NC_012984	AATA	2	8	2060532	2060539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6599	NC_012984	T	6	6	2061605	2061610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_012984	ATA	2	6	2061619	2061624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_012984	TAT	2	6	2061630	2061635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_012984	A	6	6	2061655	2061660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_012984	A	7	7	2061736	2061742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_012984	ACC	2	6	2062438	2062443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6605	NC_012984	TAG	2	6	2062453	2062458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6609	NC_012984	TAT	2	6	2062561	2062566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_012984	TCT	2	6	2062581	2062586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_012984	CTTC	2	8	2063946	2063953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6612	NC_012984	CG	3	6	2063962	2063967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6613	NC_012984	TAA	3	9	2064030	2064038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_012984	AC	3	6	2064083	2064088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6615	NC_012984	TAT	2	6	2064101	2064106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_012984	CTTT	2	8	2066794	2066801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6617	NC_012984	A	6	6	2066809	2066814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_012984	ACC	2	6	2066857	2066862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6619	NC_012984	GTT	2	6	2066908	2066913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6621	NC_012984	CTA	2	6	2066943	2066948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_012984	AGC	2	6	2066963	2066968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_012984	CT	4	8	2067019	2067026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6624	NC_012984	GTT	2	6	2067033	2067038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_012984	CT	3	6	2067047	2067052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6626	NC_012984	GTA	2	6	2067644	2067649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6628	NC_012984	TTA	2	6	2067763	2067768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_012984	TG	3	6	2067815	2067820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_012984	TAT	2	6	2069149	2069154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6795	NC_012984	ATA	2	6	2118192	2118197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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