MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 10967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012984	A	6	6	1376	1381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012984	CTA	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012984	TAC	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012984	TAT	2	6	1493	1498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012984	AT	4	8	1501	1508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012984	AATA	2	8	2693	2700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012984	TAAA	2	8	2709	2716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012984	ATG	2	6	2799	2804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012984	ATATT	2	10	2830	2839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012984	GCT	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012984	CTA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012984	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012984	CGCT	2	8	2934	2941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012984	AATG	2	8	2949	2956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012984	A	6	6	2982	2987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012984	TTA	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012984	TCA	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012984	A	6	6	3120	3125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012984	TATAA	2	10	3130	3139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012984	GT	4	8	3150	3157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012984	ACG	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012984	AGG	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012984	T	7	7	9282	9288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012984	ATT	2	6	9302	9307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012984	GT	3	6	9321	9326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012984	AGAA	2	8	9381	9388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012984	GAA	2	6	9398	9403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012984	CTG	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012984	TCA	2	6	9423	9428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012984	ACA	2	6	9482	9487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012984	CAG	2	6	9547	9552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012984	TG	3	6	9592	9597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012984	GGA	2	6	9622	9627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012984	A	6	6	9634	9639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012984	ATTG	2	8	9686	9693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012984	CAA	2	6	9744	9749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012984	AAG	2	6	9822	9827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012984	AGG	2	6	9843	9848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012984	AG	3	6	10177	10182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012984	GAG	2	6	10820	10825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012984	CTTGA	2	10	11124	11133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012984	GTG	2	6	11143	11148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012984	GGT	2	6	11199	11204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012984	GAGT	2	8	13266	13273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012984	T	7	7	16903	16909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012984	TAT	2	6	16916	16921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012984	T	6	6	16997	17002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012984	TTGG	2	8	17039	17046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012984	ATA	2	6	17070	17075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012984	TAAA	2	8	17108	17115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012984	ATG	2	6	17123	17128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012984	TAA	2	6	17144	17149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012984	TGG	2	6	17150	17155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012984	TTA	2	6	20476	20481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012984	T	7	7	20505	20511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012984	G	6	6	20522	20527	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012984	T	6	6	20543	20548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012984	CTT	2	6	20551	20556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012984	ATA	2	6	20653	20658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012984	ATCTT	2	10	20719	20728	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012984	GGA	2	6	20749	20754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012984	ATG	3	9	20758	20766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012984	TGT	3	9	20851	20859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012984	CAT	2	6	20894	20899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012984	TCA	2	6	20914	20919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012984	TCAG	2	8	22540	22547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012984	ATT	2	6	22554	22559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012984	A	6	6	22599	22604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012984	T	6	6	22609	22614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012984	T	7	7	22620	22626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012984	ATA	2	6	22722	22727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012984	TAAG	2	8	22766	22773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012984	CTT	2	6	22809	22814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012984	ATA	2	6	22815	22820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012984	AAGG	2	8	30923	30930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012984	TGA	2	6	32770	32775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012984	GTATA	2	10	32795	32804	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012984	GTT	2	6	32945	32950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012984	TAA	2	6	32966	32971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012984	TCA	2	6	33015	33020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012984	TGG	2	6	33039	33044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012984	ATTA	2	8	33068	33075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012984	AAACA	2	10	33927	33936	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012984	GTTT	2	8	33975	33982	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012984	TGA	2	6	33985	33990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012984	CCT	2	6	34687	34692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_012984	GTT	2	6	37564	37569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012984	TGAA	2	8	37578	37585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012984	TGA	2	6	37606	37611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012984	TAA	2	6	37658	37663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012984	GTT	2	6	37701	37706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012984	G	6	6	38293	38298	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012984	TGAT	2	8	38383	38390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012984	TGT	2	6	38412	38417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012984	CAGT	2	8	38423	38430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012984	T	6	6	39070	39075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012984	A	7	7	39084	39090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012984	ATG	2	6	39142	39147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012984	TCC	2	6	39284	39289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_012984	AAC	2	6	39359	39364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012984	TCC	2	6	40606	40611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_012984	ACA	2	6	41349	41354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012984	A	8	8	41378	41385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012984	AAT	2	6	41668	41673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012984	AGG	2	6	41678	41683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012984	A	6	6	41823	41828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012984	CTTTG	2	10	41835	41844	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_012984	GTA	2	6	41849	41854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012984	TGA	2	6	42151	42156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012984	GTT	2	6	44417	44422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012984	AAAC	2	8	44463	44470	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012984	AGG	2	6	44482	44487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012984	GTTA	2	8	45126	45133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012984	GCG	2	6	45879	45884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012984	TA	3	6	45918	45923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012984	GCC	2	6	46015	46020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_012984	AGTTA	2	10	46061	46070	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012984	AGT	2	6	46157	46162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012984	AACC	2	8	46227	46234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012984	GGC	2	6	46309	46314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012984	G	6	6	46373	46378	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012984	T	6	6	46446	46451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012984	CTA	2	6	46480	46485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012984	AT	3	6	46532	46537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012984	TTA	2	6	46543	46548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012984	ATA	2	6	46574	46579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012984	TAA	2	6	46586	46591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012984	AT	3	6	46603	46608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012984	GAT	2	6	47680	47685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012984	TGT	2	6	47686	47691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012984	T	6	6	47728	47733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012984	T	7	7	47735	47741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012984	TTG	2	6	47747	47752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012984	TCG	2	6	47769	47774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012984	TTG	2	6	49997	50002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012984	TTGGTT	2	12	50028	50039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012984	CTG	2	6	50090	50095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012984	TAAT	2	8	50103	50110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012984	CAA	2	6	52799	52804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012984	ATG	2	6	52813	52818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012984	GAA	2	6	52876	52881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012984	TAT	2	6	52906	52911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012984	GTAT	2	8	52918	52925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012984	CGC	2	6	52927	52932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_012984	TAT	2	6	52964	52969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012984	TAA	2	6	52982	52987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012984	ATT	2	6	53087	53092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012984	ACTT	2	8	53494	53501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012984	AG	3	6	53534	53539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_012984	AT	3	6	53562	53567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012984	CTAT	2	8	54012	54019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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157	NC_012984	T	6	6	54658	54663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_012984	AT	3	6	55137	55142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_012984	AT	3	6	63004	63009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012984	ATT	2	6	63012	63017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_012984	CATA	2	8	137273	137280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
428	NC_012984	TGG	2	6	137295	137300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
429	NC_012984	A	6	6	137315	137320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_012984	TCA	2	6	137362	137367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_012984	A	6	6	137434	137439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_012984	GTTCA	2	10	137440	137449	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
433	NC_012984	TGA	2	6	139256	139261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_012984	T	6	6	143397	143402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_012984	TAA	2	6	146567	146572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_012984	TAA	2	6	146577	146582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_012984	TGG	2	6	146960	146965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_012984	ATT	2	6	147900	147905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_012984	AAT	2	6	149983	149988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_012984	TGA	2	6	150059	150064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_012984	GGA	2	6	150955	150960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_012984	T	7	7	151858	151864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_012984	TTGAC	2	10	151866	151875	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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491	NC_012984	T	6	6	157059	157064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_012984	ACC	2	6	157084	157089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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494	NC_012984	TAAT	2	8	157112	157119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
495	NC_012984	ACC	2	6	157121	157126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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