MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 8769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011660	A	8	8	2367439	2367446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_011660	A	7	7	2367481	2367487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_011660	T	6	6	2367500	2367505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_011660	A	6	6	2367516	2367521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_011660	TCC	2	6	2367930	2367935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7006	NC_011660	AAT	2	6	2367936	2367941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_011660	T	6	6	2367946	2367951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_011660	TTTG	2	8	2367967	2367974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_011660	CAA	2	6	2368516	2368521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_011660	CAA	2	6	2368561	2368566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_011660	A	7	7	2368565	2368571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_011660	TCC	2	6	2369444	2369449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7013	NC_011660	AC	3	6	2369469	2369474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7014	NC_011660	CCT	2	6	2369911	2369916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_011660	TA	3	6	2369988	2369993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_011660	AAT	2	6	2370531	2370536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_011660	GCA	2	6	2371097	2371102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_011660	GCC	2	6	2371112	2371117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7019	NC_011660	TCC	2	6	2371119	2371124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7020	NC_011660	A	6	6	2371144	2371149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_011660	ATGTA	2	10	2371429	2371438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_011660	TTC	2	6	2371463	2371468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_011660	TTTC	2	8	2371482	2371489	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7024	NC_011660	TCT	2	6	2371554	2371559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_011660	ATGCC	2	10	2371593	2371602	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7026	NC_011660	A	6	6	2371603	2371608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_011660	ATATAA	2	12	2371625	2371636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_011660	TCT	2	6	2372303	2372308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7030	NC_011660	CT	4	8	2376321	2376328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7031	NC_011660	CTT	2	6	2376348	2376353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_011660	CAT	2	6	2376356	2376361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_011660	TAT	2	6	2376385	2376390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_011660	AT	3	6	2376419	2376424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_011660	A	6	6	2376431	2376436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_011660	ATT	2	6	2377950	2377955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_011660	TCC	2	6	2379139	2379144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7038	NC_011660	TATT	2	8	2380349	2380356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_011660	CATA	2	8	2381745	2381752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7040	NC_011660	ATC	2	6	2381771	2381776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_011660	TCA	2	6	2381795	2381800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_011660	T	6	6	2381807	2381812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_011660	TGT	2	6	2384341	2384346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_011660	TCC	2	6	2384348	2384353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7045	NC_011660	TCA	2	6	2385909	2385914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_011660	CCTA	2	8	2386452	2386459	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7047	NC_011660	ATTT	2	8	2386466	2386473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_011660	ACAA	2	8	2386481	2386488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7049	NC_011660	A	7	7	2386487	2386493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_011660	AAT	2	6	2386500	2386505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_011660	T	6	6	2386512	2386517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_011660	GTT	2	6	2386649	2386654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_011660	CT	3	6	2386664	2386669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7054	NC_011660	AGA	2	6	2386679	2386684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_011660	T	6	6	2386713	2386718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_011660	TCGA	2	8	2386729	2386736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7057	NC_011660	ATC	2	6	2386793	2386798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_011660	GAA	2	6	2386819	2386824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_011660	G	6	6	2386844	2386849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_011660	CA	3	6	2386885	2386890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_011660	AAC	2	6	2386917	2386922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_011660	GT	3	6	2386936	2386941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_011660	CTC	2	6	2386971	2386976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7064	NC_011660	ACG	2	6	2387020	2387025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_011660	CGA	2	6	2387100	2387105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_011660	ACC	2	6	2387215	2387220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7067	NC_011660	TCCA	2	8	2387307	2387314	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7069	NC_011660	GTA	2	6	2387439	2387444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7071	NC_011660	CCT	2	6	2387456	2387461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7072	NC_011660	CCTA	2	8	2387491	2387498	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7073	NC_011660	TC	3	6	2387611	2387616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7074	NC_011660	GCC	2	6	2387708	2387713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7075	NC_011660	CTC	2	6	2387756	2387761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7076	NC_011660	CT	3	6	2387866	2387871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7077	NC_011660	TC	3	6	2387946	2387951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7078	NC_011660	TC	3	6	2387966	2387971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7079	NC_011660	TAC	2	6	2388006	2388011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7081	NC_011660	CACT	2	8	2388119	2388126	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7082	NC_011660	TGT	2	6	2388218	2388223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_011660	CGCCTA	2	12	2388228	2388239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7084	NC_011660	CTT	2	6	2388326	2388331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7088	NC_011660	TGG	2	6	2388609	2388614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_011660	GA	3	6	2388789	2388794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_011660	CGTG	2	8	2388860	2388867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7091	NC_011660	AGTA	2	8	2388881	2388888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_011660	TTACC	2	10	2388889	2388898	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7093	NC_011660	CAA	2	6	2389008	2389013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_011660	ACT	2	6	2389072	2389077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7096	NC_011660	CCG	2	6	2389225	2389230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7097	NC_011660	CTTT	2	8	2389320	2389327	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7098	NC_011660	AAG	2	6	2389359	2389364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_011660	CTT	2	6	2389369	2389374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_011660	TCGC	2	8	2389394	2389401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7101	NC_011660	TCC	2	6	2389433	2389438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7102	NC_011660	CCTT	2	8	2389471	2389478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7103	NC_011660	CTT	2	6	2389597	2389602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_011660	GTT	2	6	2389673	2389678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7106	NC_011660	GAT	2	6	2389736	2389741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_011660	AACA	2	8	2389815	2389822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7108	NC_011660	AGA	2	6	2389861	2389866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_011660	TTTCCT	2	12	2389882	2389893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_011660	AGG	2	6	2389899	2389904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_011660	CGG	2	6	2389972	2389977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_011660	GTG	2	6	2390026	2390031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_011660	GT	3	6	2390041	2390046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_011660	GT	3	6	2390210	2390215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_011660	ATG	2	6	2390235	2390240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_011660	TCC	2	6	2390261	2390266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7117	NC_011660	CACGA	2	10	2390359	2390368	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7118	NC_011660	GAC	2	6	2390372	2390377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7122	NC_011660	AG	3	6	2390699	2390704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_011660	TCC	2	6	2390724	2390729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7124	NC_011660	CTC	2	6	2390770	2390775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7125	NC_011660	GC	4	8	2390857	2390864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7126	NC_011660	GCT	2	6	2390914	2390919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_011660	TTC	2	6	2390987	2390992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_011660	AAC	2	6	2390996	2391001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_011660	CTT	2	6	2391023	2391028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7130	NC_011660	GCG	2	6	2391036	2391041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7131	NC_011660	CTG	2	6	2391082	2391087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7133	NC_011660	TCC	2	6	2391370	2391375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7403	NC_011660	A	8	8	2434878	2434885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7404	NC_011660	A	8	8	2434917	2434924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7405	NC_011660	T	7	7	2434928	2434934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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