MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 9401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010999	TTA	2	6	2005712	2005717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_010999	TTC	2	6	2005727	2005732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_010999	GT	3	6	2005758	2005763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_010999	T	7	7	2006474	2006480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_010999	TTG	2	6	2006523	2006528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_010999	CGAA	2	8	2007446	2007453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6007	NC_010999	AGG	2	6	2007523	2007528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_010999	AAC	2	6	2008354	2008359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_010999	A	6	6	2008440	2008445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_010999	GTC	2	6	2009109	2009114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_010999	T	6	6	2009124	2009129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_010999	TTA	2	6	2009131	2009136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_010999	TGC	2	6	2009151	2009156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_010999	TAA	2	6	2009198	2009203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_010999	GGT	2	6	2009247	2009252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_010999	ATC	2	6	2009300	2009305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_010999	TAT	2	6	2011242	2011247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_010999	A	6	6	2011251	2011256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_010999	AAC	2	6	2011301	2011306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_010999	CA	3	6	2011328	2011333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6021	NC_010999	ACG	2	6	2011334	2011339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_010999	TCC	2	6	2012762	2012767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_010999	TG	3	6	2012798	2012803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_010999	GGCT	2	8	2017375	2017382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_010999	CTC	2	6	2018522	2018527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_010999	CCT	2	6	2019267	2019272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_010999	TTG	2	6	2019285	2019290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_010999	TA	3	6	2019297	2019302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_010999	ATC	2	6	2020910	2020915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_010999	AT	3	6	2020947	2020952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_010999	TAC	2	6	2020958	2020963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_010999	CCT	2	6	2021257	2021262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_010999	T	6	6	2021262	2021267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_010999	A	7	7	2021289	2021295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_010999	GA	3	6	2021927	2021932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_010999	TTA	2	6	2023084	2023089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_010999	T	7	7	2023135	2023141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_010999	TAC	2	6	2023285	2023290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_010999	TAG	2	6	2023291	2023296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_010999	CTT	2	6	2024502	2024507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_010999	TTA	2	6	2024516	2024521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_010999	TCAA	2	8	2024539	2024546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_010999	T	6	6	2025432	2025437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_010999	CAA	2	6	2025443	2025448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_010999	GTC	2	6	2025474	2025479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_010999	ATC	2	6	2025491	2025496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_010999	ATT	2	6	2025505	2025510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_010999	CAA	2	6	2025522	2025527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_010999	AGG	2	6	2025620	2025625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_010999	A	7	7	2028807	2028813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_010999	CTGAT	2	10	2028823	2028832	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6052	NC_010999	T	6	6	2028846	2028851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_010999	AAC	2	6	2030333	2030338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_010999	AGC	2	6	2030377	2030382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_010999	TCCA	2	8	2030398	2030405	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_010999	CGATA	2	10	2030412	2030421	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6057	NC_010999	GGA	2	6	2030437	2030442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_010999	AACT	2	8	2031196	2031203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_010999	AAGG	2	8	2031288	2031295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_010999	CAT	2	6	2032350	2032355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_010999	TAC	2	6	2033360	2033365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_010999	AGG	2	6	2033447	2033452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_010999	A	7	7	2035297	2035303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_010999	CTTC	2	8	2037888	2037895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_010999	A	6	6	2038247	2038252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_010999	CCT	2	6	2038253	2038258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_010999	TTC	2	6	2038260	2038265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_010999	GTC	2	6	2038311	2038316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_010999	CCT	2	6	2039340	2039345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_010999	T	6	6	2039481	2039486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6072	NC_010999	ACCA	2	8	2040621	2040628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_010999	A	6	6	2042327	2042332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_010999	CAAAA	2	10	2042342	2042351	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6075	NC_010999	TA	3	6	2042378	2042383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_010999	TCAAG	2	10	2042406	2042415	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6077	NC_010999	CAAAC	2	10	2042429	2042438	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6078	NC_010999	CTG	2	6	2042458	2042463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_010999	TG	3	6	2042462	2042467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_010999	CAG	3	9	2042473	2042481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_010999	GACATG	2	12	2042488	2042499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6082	NC_010999	TCA	2	6	2042516	2042521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_010999	GAA	2	6	2042536	2042541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_010999	A	7	7	2042562	2042568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_010999	A	6	6	2042591	2042596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_010999	CAT	2	6	2042614	2042619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_010999	TCA	2	6	2042622	2042627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_010999	CAA	2	6	2042633	2042638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_010999	A	6	6	2042683	2042688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_010999	TTC	2	6	2043699	2043704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6092	NC_010999	TGT	2	6	2043744	2043749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_010999	TTCC	2	8	2043799	2043806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_010999	CAA	2	6	2043837	2043842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_010999	A	6	6	2043841	2043846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_010999	GT	3	6	2044222	2044227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_010999	TGG	2	6	2047569	2047574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_010999	CAT	2	6	2047592	2047597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_010999	AC	3	6	2047620	2047625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_010999	CA	3	6	2047637	2047642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_010999	GCC	2	6	2047659	2047664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_010999	TTA	2	6	2047827	2047832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_010999	GAC	2	6	2047847	2047852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_010999	AATT	2	8	2047865	2047872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_010999	TCA	2	6	2047877	2047882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_010999	CATTT	2	10	2047902	2047911	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6107	NC_010999	ATC	2	6	2047927	2047932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_010999	TTAC	2	8	2048366	2048373	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_010999	CATT	2	8	2048427	2048434	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6110	NC_010999	T	6	6	2048750	2048755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_010999	ACC	2	6	2048803	2048808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_010999	GCA	2	6	2048842	2048847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_010999	CTC	2	6	2052488	2052493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_010999	TAT	2	6	2052521	2052526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_010999	TTA	2	6	2052533	2052538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_010999	TATT	2	8	2052549	2052556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_010999	T	6	6	2052589	2052594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_010999	TAACCT	2	12	2052691	2052702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_010999	TTTA	2	8	2053603	2053610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_010999	T	6	6	2053637	2053642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_010999	A	6	6	2053701	2053706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_010999	CAT	2	6	2054715	2054720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_010999	TAT	2	6	2054794	2054799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_010999	CAC	2	6	2055637	2055642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_010999	CTTTCA	2	12	2055753	2055764	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_010999	A	6	6	2055764	2055769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_010999	A	6	6	2055772	2055777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_010999	GA	4	8	2057508	2057515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_010999	TTA	2	6	2057531	2057536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_010999	AAC	2	6	2057551	2057556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6132	NC_010999	T	6	6	2057599	2057604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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