MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010524	CGCC	2	8	1235775	1235782	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2502	NC_010524	GCGA	2	8	1235792	1235799	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_010524	GCC	2	6	1235804	1235809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_010524	GTT	2	6	1235825	1235830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_010524	CGCC	2	8	1235848	1235855	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2506	NC_010524	GCGA	2	8	1235865	1235872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2507	NC_010524	CGCC	2	8	1235920	1235927	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2508	NC_010524	GCGA	2	8	1235937	1235944	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2509	NC_010524	TGT	2	6	1235968	1235973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_010524	CGCC	2	8	1235992	1235999	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2511	NC_010524	GCGA	2	8	1236009	1236016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2512	NC_010524	GGT	4	12	1236022	1236033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_010524	CGCC	2	8	1236064	1236071	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2514	NC_010524	GCGA	2	8	1236081	1236088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_010524	CGG	2	6	1236093	1236098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_010524	GTG	2	6	1236113	1236118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_010524	CGCC	2	8	1236135	1236142	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2518	NC_010524	GCGA	2	8	1236152	1236159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2519	NC_010524	CGCC	2	8	1236207	1236214	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2520	NC_010524	GCGA	2	8	1236224	1236231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2521	NC_010524	TGC	2	6	1236246	1236251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_010524	CGCC	2	8	1236279	1236286	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2523	NC_010524	GCGA	2	8	1236296	1236303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2524	NC_010524	TGCCGC	2	12	1236315	1236326	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2525	NC_010524	CGCC	2	8	1236351	1236358	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2526	NC_010524	GCGA	2	8	1236368	1236375	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_010524	CGCC	2	8	1236422	1236429	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2528	NC_010524	GCGA	2	8	1236439	1236446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2529	NC_010524	GCTG	3	12	1236472	1236483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2530	NC_010524	CGCC	2	8	1236494	1236501	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2531	NC_010524	GCGA	2	8	1236511	1236518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_010524	CGCC	2	8	1236565	1236572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2533	NC_010524	GCGA	2	8	1236582	1236589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2534	NC_010524	GCC	2	6	1236603	1236608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2535	NC_010524	CGCC	2	8	1236636	1236643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2536	NC_010524	GCGA	2	8	1236653	1236660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2537	NC_010524	GGC	2	6	1236682	1236687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_010524	CGCC	2	8	1236707	1236714	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2539	NC_010524	GCGA	2	8	1236724	1236731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2540	NC_010524	CGCC	2	8	1236779	1236786	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2541	NC_010524	GCGA	2	8	1236796	1236803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2542	NC_010524	CGC	2	6	1236815	1236820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_010524	CGG	2	6	1236831	1236836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_010524	CGCC	2	8	1236850	1236857	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2545	NC_010524	GCGA	2	8	1236867	1236874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2546	NC_010524	GC	3	6	1236920	1236925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2547	NC_010524	CGG	2	6	1236935	1236940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_010524	CG	3	6	1237051	1237056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2549	NC_010524	TCC	2	6	1240574	1240579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_010524	TGA	2	6	1243050	1243055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_010524	CTC	2	6	1245455	1245460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_010524	CAC	2	6	1245502	1245507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2553	NC_010524	CAC	2	6	1245511	1245516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_010524	GCAT	2	8	1245621	1245628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2555	NC_010524	CTG	2	6	1245632	1245637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2557	NC_010524	CCA	2	6	1245681	1245686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2558	NC_010524	ATG	2	6	1245728	1245733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_010524	CTG	2	6	1248038	1248043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_010524	GGC	2	6	1248055	1248060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_010524	GCC	2	6	1249819	1249824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_010524	AG	3	6	1250963	1250968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_010524	GAT	2	6	1250985	1250990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_010524	CGCC	2	8	1252088	1252095	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2565	NC_010524	ACG	2	6	1252114	1252119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_010524	GAG	2	6	1252161	1252166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_010524	A	6	6	1256186	1256191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_010524	TTG	2	6	1257838	1257843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_010524	GC	4	8	1257844	1257851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2570	NC_010524	GCGT	2	8	1257885	1257892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2571	NC_010524	GC	4	8	1257906	1257913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2572	NC_010524	CCCT	2	8	1260483	1260490	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2573	NC_010524	TGG	2	6	1260491	1260496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_010524	CCGG	2	8	1260506	1260513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2575	NC_010524	GGC	2	6	1260523	1260528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_010524	AGG	2	6	1260533	1260538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_010524	GGTC	2	8	1260618	1260625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2578	NC_010524	GCC	2	6	1260642	1260647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_010524	AGCC	2	8	1262460	1262467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2580	NC_010524	CCGG	2	8	1262487	1262494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_010524	GCC	2	6	1262511	1262516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2582	NC_010524	TGCA	2	8	1262566	1262573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2583	NC_010524	GCC	2	6	1262615	1262620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2584	NC_010524	GCGG	2	8	1262654	1262661	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2585	NC_010524	TCG	2	6	1262663	1262668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_010524	TCGA	2	8	1262677	1262684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2587	NC_010524	CGTTC	2	10	1262697	1262706	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2588	NC_010524	GCTG	2	8	1262717	1262724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2589	NC_010524	CG	3	6	1262748	1262753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2590	NC_010524	CCGG	2	8	1262759	1262766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2591	NC_010524	CGGA	2	8	1264059	1264066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2592	NC_010524	ACA	2	6	1267602	1267607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_010524	GTTC	2	8	1267614	1267621	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2594	NC_010524	GCT	2	6	1267664	1267669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_010524	TGT	2	6	1267675	1267680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_010524	CGC	2	6	1267703	1267708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2597	NC_010524	GGCG	2	8	1267777	1267784	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2598	NC_010524	CAG	2	6	1267801	1267806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_010524	GGC	2	6	1268186	1268191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_010524	GC	3	6	1268211	1268216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2601	NC_010524	CGA	2	6	1268231	1268236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_010524	GCC	2	6	1268255	1268260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2603	NC_010524	GCT	2	6	1270099	1270104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_010524	AGA	2	6	1270142	1270147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_010524	AAG	2	6	1270162	1270167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_010524	CTT	2	6	1271044	1271049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_010524	CTC	2	6	1271050	1271055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2608	NC_010524	AG	3	6	1271066	1271071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_010524	ACA	2	6	1274742	1274747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_010524	CTT	2	6	1275763	1275768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_010524	GACGA	2	10	1275789	1275798	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2612	NC_010524	CCG	2	6	1279487	1279492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2613	NC_010524	CGC	2	6	1279501	1279506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_010524	ACC	2	6	1279515	1279520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_010524	C	6	6	1279519	1279524	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2616	NC_010524	ACC	2	6	1279547	1279552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2617	NC_010524	GAG	2	6	1280740	1280745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_010524	GCC	2	6	1285931	1285936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2619	NC_010524	CGGCTG	2	12	1285941	1285952	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_010524	GCT	2	6	1286933	1286938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_010524	GA	3	6	1287010	1287015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_010524	CCG	2	6	1287017	1287022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2623	NC_010524	GAG	2	6	1290772	1290777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_010524	T	7	7	1294089	1294095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_010524	ACA	2	6	1294114	1294119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_010524	C	6	6	1295352	1295357	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2627	NC_010524	TGA	2	6	1295365	1295370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_010524	TTC	2	6	1296019	1296024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_010524	CGAT	2	8	1296052	1296059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2630	NC_010524	GAC	2	6	1296060	1296065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_010524	TTC	2	6	1296395	1296400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_010524	GGA	2	6	1300859	1300864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_010524	GCC	2	6	1302054	1302059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2634	NC_010524	ACCG	2	8	1302095	1302102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2638	NC_010524	GCG	2	6	1308135	1308140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2643	NC_010524	T	7	7	1311019	1311025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2760	NC_010524	CCG	2	6	1402235	1402240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2766	NC_010524	CGC	2	6	1402384	1402389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2767	NC_010524	CTG	2	6	1402402	1402407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2768	NC_010524	CG	3	6	1402441	1402446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2769	NC_010524	TGC	3	9	1402506	1402514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2770	NC_010524	CGT	2	6	1402537	1402542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2771	NC_010524	GCT	2	6	1402561	1402566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2772	NC_010524	CGC	2	6	1402649	1402654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2775	NC_010524	GGT	2	6	1402810	1402815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2776	NC_010524	TGC	2	6	1402839	1402844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2778	NC_010524	GTC	2	6	1402940	1402945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2780	NC_010524	CGG	2	6	1403073	1403078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2797	NC_010524	TGG	2	6	1419490	1419495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2799	NC_010524	ATG	2	6	1421621	1421626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2880	NC_010524	CA	3	6	1491169	1491174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2881	NC_010524	TCA	2	6	1491212	1491217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2882	NC_010524	GACC	2	8	1497282	1497289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2883	NC_010524	CG	3	6	1500259	1500264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2884	NC_010524	GCC	2	6	1501896	1501901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2886	NC_010524	CGCGG	2	10	1503468	1503477	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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2891	NC_010524	GCC	2	6	1504530	1504535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2892	NC_010524	GCG	2	6	1506405	1506410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2895	NC_010524	CGTC	2	8	1506493	1506500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2897	NC_010524	GTC	2	6	1507769	1507774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2898	NC_010524	TCGA	2	8	1508107	1508114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2899	NC_010524	G	7	7	1508121	1508127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2900	NC_010524	GCG	2	6	1508140	1508145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2901	NC_010524	TCTT	2	8	1509148	1509155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2905	NC_010524	TC	3	6	1509507	1509512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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