MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010524	AAAC	2	8	781531	781538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_010524	GGA	2	6	781542	781547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010524	TGCC	2	8	781572	781579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_010524	CGG	2	6	782260	782265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_010524	CGC	2	6	782286	782291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_010524	CTT	2	6	782761	782766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_010524	CAA	2	6	782778	782783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_010524	CAT	2	6	782802	782807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_010524	CGG	2	6	782808	782813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_010524	CGGC	2	8	783586	783593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_010524	CGGG	2	8	785329	785336	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_010524	CCGT	2	8	785359	785366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_010524	CGG	2	6	785852	785857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_010524	GCCG	2	8	787151	787158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_010524	GGCC	2	8	787159	787166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_010524	GCC	2	6	787834	787839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_010524	AGG	2	6	789201	789206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_010524	GTC	2	6	789244	789249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_010524	GCC	2	6	789251	789256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_010524	GCT	2	6	790534	790539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_010524	ACA	2	6	790589	790594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_010524	GCC	2	6	792061	792066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_010524	GT	3	6	792146	792151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010524	CCA	2	6	794957	794962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_010524	CGA	2	6	794968	794973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_010524	CGG	2	6	796216	796221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_010524	AAC	2	6	796244	796249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_010524	CCG	2	6	796253	796258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_010524	CCG	2	6	801131	801136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_010524	CAG	2	6	801194	801199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_010524	ACT	2	6	801206	801211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_010524	CGGCG	2	10	801217	801226	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1533	NC_010524	GCC	2	6	803100	803105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_010524	TGCG	2	8	803107	803114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_010524	CCTGC	2	10	803140	803149	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1536	NC_010524	TG	3	6	808898	808903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_010524	GC	3	6	808929	808934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_010524	GT	3	6	808957	808962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_010524	ACGA	2	8	808979	808986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_010524	CCG	2	6	809006	809011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_010524	CGGG	2	8	809022	809029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_010524	TGA	2	6	809491	809496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010524	CCG	2	6	809628	809633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_010524	GCT	3	9	809640	809648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_010524	GCA	2	6	809658	809663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_010524	CGG	2	6	809675	809680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_010524	TCGGG	2	10	810782	810791	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1548	NC_010524	A	6	6	810851	810856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_010524	GAC	2	6	810975	810980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_010524	CCCG	2	8	811704	811711	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1551	NC_010524	TCG	2	6	811743	811748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_010524	ACCC	2	8	814203	814210	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1553	NC_010524	AGC	2	6	816408	816413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_010524	CGG	2	6	816455	816460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_010524	AGCAG	2	10	819355	819364	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1556	NC_010524	CGAG	2	8	820094	820101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_010524	CGC	2	6	820107	820112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_010524	A	6	6	820131	820136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_010524	CTCG	2	8	823139	823146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_010524	TGC	2	6	824956	824961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_010524	CCCGG	2	10	824971	824980	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1562	NC_010524	CCCACC	2	12	825040	825051	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1563	NC_010524	C	6	6	825091	825096	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1564	NC_010524	GCA	2	6	825100	825105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_010524	GCC	2	6	825114	825119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_010524	CCA	2	6	825121	825126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_010524	GCA	2	6	825154	825159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_010524	CG	3	6	825166	825171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_010524	TAG	2	6	827525	827530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_010524	CT	3	6	827704	827709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_010524	CG	3	6	827782	827787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_010524	CCGA	2	8	827820	827827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_010524	CGGT	2	8	827855	827862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_010524	CGG	2	6	827880	827885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_010524	GCC	2	6	827963	827968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_010524	CTC	2	6	827990	827995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_010524	GAC	2	6	828004	828009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_010524	GACCC	2	10	828016	828025	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1579	NC_010524	CGA	2	6	828086	828091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_010524	CGC	3	9	831429	831437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_010524	GTC	2	6	831581	831586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_010524	ACG	2	6	831591	831596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_010524	GGT	2	6	831658	831663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_010524	CGG	2	6	831686	831691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_010524	CG	3	6	831814	831819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_010524	GACC	2	8	837244	837251	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_010524	ACA	2	6	837272	837277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_010524	GCG	2	6	837319	837324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_010524	CGC	2	6	837488	837493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_010524	TCGG	2	8	837500	837507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_010524	GCC	2	6	837604	837609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_010524	CGG	2	6	837673	837678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_010524	CGAC	2	8	837679	837686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_010524	GCT	2	6	837694	837699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_010524	GCG	2	6	837765	837770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_010524	CGC	2	6	837772	837777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_010524	GCCG	2	8	841114	841121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_010524	GCCC	2	8	841159	841166	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1599	NC_010524	CAG	2	6	842492	842497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_010524	TCC	2	6	842509	842514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_010524	CGCTC	2	10	842529	842538	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1602	NC_010524	TGCGC	2	10	842550	842559	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1603	NC_010524	CGG	2	6	842631	842636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_010524	CGG	2	6	842640	842645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_010524	AG	3	6	842699	842704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_010524	GCC	2	6	842718	842723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_010524	GGCC	2	8	842726	842733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_010524	CGGT	2	8	842749	842756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_010524	CG	3	6	842819	842824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_010524	CCG	2	6	842866	842871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_010524	TGG	2	6	842897	842902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_010524	CGT	2	6	842923	842928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_010524	GGCG	2	8	842938	842945	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_010524	CCG	2	6	842949	842954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_010524	GCC	2	6	842973	842978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_010524	TGG	2	6	842985	842990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_010524	C	6	6	843021	843026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1618	NC_010524	G	6	6	843061	843066	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_010524	GCT	2	6	843107	843112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_010524	C	6	6	843126	843131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1621	NC_010524	GCCC	2	8	843132	843139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1622	NC_010524	CG	3	6	844730	844735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_010524	GC	3	6	844756	844761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_010524	TCG	2	6	844764	844769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_010524	GCAGG	2	10	844779	844788	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1626	NC_010524	GCCG	2	8	844804	844811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_010524	CG	3	6	844810	844815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_010524	CGGC	2	8	844817	844824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_010524	GCC	2	6	844858	844863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_010524	CGACT	2	10	844887	844896	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1631	NC_010524	CTG	2	6	844930	844935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_010524	GT	3	6	846823	846828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_010524	ACG	2	6	846846	846851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_010524	ACG	2	6	848622	848627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_010524	GTC	2	6	848652	848657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_010524	ACC	2	6	848748	848753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1637	NC_010524	TCG	2	6	848754	848759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_010524	GCG	2	6	848820	848825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1639	NC_010524	GAC	2	6	849163	849168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1641	NC_010524	CGA	2	6	849262	849267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1644	NC_010524	GCA	2	6	849415	849420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1645	NC_010524	GCC	2	6	849425	849430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1653	NC_010524	CA	3	6	849636	849641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1654	NC_010524	CGA	2	6	849679	849684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1667	NC_010524	CGA	2	6	850074	850079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1668	NC_010524	GGC	2	6	850135	850140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1669	NC_010524	ATCG	2	8	850186	850193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1670	NC_010524	CATC	2	8	850213	850220	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1671	NC_010524	CGA	2	6	851623	851628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1673	NC_010524	GATC	2	8	859128	859135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1679	NC_010524	CGC	2	6	863690	863695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1722	NC_010524	TGG	2	6	896491	896496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1725	NC_010524	GCCGC	2	10	896554	896563	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1726	NC_010524	CATA	2	8	896621	896628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1734	NC_010524	CTG	2	6	914244	914249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1736	NC_010524	TTC	2	6	914310	914315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1738	NC_010524	CTG	2	6	915468	915473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1742	NC_010524	CCA	2	6	916266	916271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1744	NC_010524	TCGCCA	2	12	918491	918502	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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1749	NC_010524	GAC	2	6	924035	924040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1751	NC_010524	GGT	2	6	925919	925924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1752	NC_010524	CGG	2	6	933153	933158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1753	NC_010524	GCC	2	6	933170	933175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1754	NC_010524	TGG	2	6	938923	938928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1755	NC_010524	GC	3	6	939772	939777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1756	NC_010524	TCGC	2	8	940255	940262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1757	NC_010524	TCG	2	6	940274	940279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1758	NC_010524	CGT	2	6	940475	940480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1760	NC_010524	GTC	2	6	940986	940991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1761	NC_010524	TGG	2	6	941058	941063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1762	NC_010524	CG	3	6	941152	941157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1763	NC_010524	ACG	2	6	941207	941212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1764	NC_010524	GCT	2	6	941232	941237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1765	NC_010524	CG	3	6	943504	943509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1766	NC_010524	CGA	2	6	943514	943519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1767	NC_010524	GGT	2	6	944415	944420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1769	NC_010524	GCA	2	6	944512	944517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1770	NC_010524	GCG	2	6	944526	944531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1771	NC_010524	TCA	2	6	944635	944640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1773	NC_010524	TGC	3	9	944663	944671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1774	NC_010524	CGA	2	6	944697	944702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1777	NC_010524	GCTGA	2	10	945144	945153	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1790	NC_010524	GTAC	2	8	950438	950445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1791	NC_010524	TCG	2	6	950448	950453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1903	NC_010524	C	6	6	1002376	1002381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1904	NC_010524	T	8	8	1002417	1002424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1905	NC_010524	TTC	2	6	1004013	1004018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1906	NC_010524	CGCAC	2	10	1004038	1004047	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1907	NC_010524	CGG	2	6	1004048	1004053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1910	NC_010524	T	9	9	1004122	1004130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1931	NC_010524	CATC	2	8	1012291	1012298	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1932	NC_010524	T	8	8	1012318	1012325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_010524	GTT	2	6	1012331	1012336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1934	NC_010524	ATTGA	2	10	1012338	1012347	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_010524	CG	3	6	1012359	1012364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1957	NC_010524	TAT	2	6	1016563	1016568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_010524	AAT	3	9	1016586	1016594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1959	NC_010524	TC	3	6	1016605	1016610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1997	NC_010524	CCT	2	6	1028410	1028415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1998	NC_010524	GCG	2	6	1030535	1030540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1999	NC_010524	GTC	2	6	1030626	1030631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2000	NC_010524	GCCC	2	8	1030633	1030640	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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