MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

< Previous12...6789101112131415161718Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_010524	CGG	2	6	4818920	4818925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_010524	GGC	2	6	4818938	4818943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_010524	CG	4	8	4818945	4818952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8504	NC_010524	GCCG	2	8	4818963	4818970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8505	NC_010524	GGC	2	6	4819929	4819934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_010524	CGT	2	6	4819939	4819944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_010524	A	7	7	4819959	4819965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_010524	CGA	2	6	4819996	4820001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_010524	CTCG	2	8	4820004	4820011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8510	NC_010524	GAG	2	6	4820021	4820026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_010524	TGC	2	6	4820639	4820644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_010524	GCA	2	6	4820648	4820653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_010524	CGA	2	6	4820674	4820679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_010524	TGCAG	2	10	4820700	4820709	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8515	NC_010524	CGCGG	2	10	4820771	4820780	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8516	NC_010524	CCA	2	6	4820794	4820799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8517	NC_010524	CTCC	2	8	4820815	4820822	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8518	NC_010524	GCCG	2	8	4820897	4820904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8519	NC_010524	TGCA	2	8	4822956	4822963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8520	NC_010524	GGA	2	6	4823001	4823006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_010524	CCT	2	6	4824759	4824764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8522	NC_010524	GTGG	2	8	4824774	4824781	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_010524	GCCG	2	8	4824842	4824849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8524	NC_010524	CGT	2	6	4824909	4824914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_010524	GCG	2	6	4826000	4826005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_010524	GC	3	6	4826957	4826962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8527	NC_010524	GCC	2	6	4828212	4828217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8528	NC_010524	CG	3	6	4828232	4828237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8529	NC_010524	TGGCC	2	10	4828243	4828252	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8530	NC_010524	CTG	2	6	4828264	4828269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_010524	GCC	2	6	4828309	4828314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8532	NC_010524	CGC	2	6	4828377	4828382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8533	NC_010524	CCCGA	2	10	4829169	4829178	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8534	NC_010524	C	6	6	4829183	4829188	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8535	NC_010524	GAG	2	6	4829189	4829194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_010524	CGC	2	6	4833173	4833178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8537	NC_010524	GCT	2	6	4833241	4833246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_010524	CGA	2	6	4834723	4834728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_010524	ACA	2	6	4834737	4834742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_010524	GGC	2	6	4835994	4835999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_010524	TCA	2	6	4839034	4839039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_010524	AGC	2	6	4839049	4839054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_010524	GC	3	6	4840114	4840119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8544	NC_010524	GCCG	2	8	4840125	4840132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8545	NC_010524	TCG	2	6	4840147	4840152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_010524	AC	3	6	4843123	4843128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8547	NC_010524	GCCG	2	8	4846831	4846838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8548	NC_010524	CTG	2	6	4846847	4846852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_010524	CG	3	6	4848464	4848469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8550	NC_010524	TCC	2	6	4848547	4848552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8551	NC_010524	CGT	2	6	4849776	4849781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_010524	TCT	2	6	4849795	4849800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_010524	CGT	2	6	4852088	4852093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_010524	TGCA	2	8	4852102	4852109	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8555	NC_010524	TCGAT	2	10	4852129	4852138	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8556	NC_010524	GTC	2	6	4852154	4852159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_010524	GCGG	2	8	4856757	4856764	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8558	NC_010524	GCC	2	6	4856800	4856805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8559	NC_010524	CGG	2	6	4856808	4856813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_010524	GTCGG	2	10	4858195	4858204	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8561	NC_010524	CG	3	6	4858234	4858239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8562	NC_010524	CCGG	2	8	4858348	4858355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8563	NC_010524	CGT	2	6	4858370	4858375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_010524	GCCCG	2	10	4858422	4858431	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8565	NC_010524	C	6	6	4858436	4858441	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8566	NC_010524	GCCA	2	8	4858521	4858528	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8567	NC_010524	CGA	3	9	4858543	4858551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_010524	TCC	2	6	4858554	4858559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8569	NC_010524	CGG	2	6	4858572	4858577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_010524	GCC	2	6	4860608	4860613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8571	NC_010524	CCG	2	6	4860616	4860621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8572	NC_010524	TCGG	2	8	4860634	4860641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8573	NC_010524	TTC	2	6	4860671	4860676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8574	NC_010524	GATG	2	8	4860688	4860695	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_010524	CGC	2	6	4860748	4860753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8576	NC_010524	GGA	2	6	4860759	4860764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_010524	CG	4	8	4861431	4861438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8578	NC_010524	GA	4	8	4862369	4862376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_010524	CG	3	6	4862390	4862395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8580	NC_010524	GT	3	6	4864546	4864551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_010524	GCTGC	2	10	4864943	4864952	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8582	NC_010524	CAA	2	6	4864973	4864978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_010524	GCTTC	2	10	4865021	4865030	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8584	NC_010524	CCCG	2	8	4865072	4865079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8585	NC_010524	CCT	2	6	4865110	4865115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8586	NC_010524	T	6	6	4865178	4865183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_010524	TCCG	2	8	4866059	4866066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8588	NC_010524	CAG	2	6	4866081	4866086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8589	NC_010524	CGCA	2	8	4867573	4867580	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8590	NC_010524	AGA	2	6	4867582	4867587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_010524	CCG	2	6	4869107	4869112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8592	NC_010524	CGG	2	6	4869126	4869131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8593	NC_010524	CAGG	2	8	4869335	4869342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8594	NC_010524	CGC	2	6	4872557	4872562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8595	NC_010524	CGG	2	6	4873217	4873222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8596	NC_010524	GGC	2	6	4874209	4874214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8597	NC_010524	CAT	2	6	4874250	4874255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_010524	GC	3	6	4874269	4874274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8599	NC_010524	CA	3	6	4874367	4874372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8600	NC_010524	CTG	2	6	4874384	4874389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8601	NC_010524	CGT	2	6	4874397	4874402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8602	NC_010524	GC	4	8	4879123	4879130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8603	NC_010524	CG	3	6	4879135	4879140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8604	NC_010524	CGAC	2	8	4879158	4879165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8605	NC_010524	GTC	2	6	4880365	4880370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_010524	CGT	2	6	4880371	4880376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8607	NC_010524	GC	3	6	4880385	4880390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8608	NC_010524	GCC	2	6	4880400	4880405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8609	NC_010524	TCCA	2	8	4880853	4880860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8610	NC_010524	TGC	2	6	4882964	4882969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8611	NC_010524	ATCG	2	8	4882999	4883006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8612	NC_010524	GCCC	2	8	4883097	4883104	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8613	NC_010524	GCC	2	6	4889126	4889131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8614	NC_010524	GAA	2	6	4891047	4891052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_010524	GCC	2	6	4891103	4891108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8616	NC_010524	GTC	2	6	4891142	4891147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8617	NC_010524	CGC	2	6	4891156	4891161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8618	NC_010524	CTG	2	6	4891163	4891168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_010524	GAC	2	6	4891239	4891244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_010524	GCC	2	6	4893533	4893538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8621	NC_010524	AGGC	2	8	4896257	4896264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8622	NC_010524	GCCG	2	8	4897011	4897018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8623	NC_010524	CGC	2	6	4898098	4898103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8624	NC_010524	GGC	2	6	4898104	4898109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8625	NC_010524	TGC	2	6	4898173	4898178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_010524	CGGG	2	8	4898179	4898186	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8627	NC_010524	AGC	2	6	4898228	4898233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_010524	CACG	2	8	4898263	4898270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8629	NC_010524	TGGT	2	8	4898334	4898341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_010524	TGCG	2	8	4898505	4898512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8631	NC_010524	GTCG	2	8	4898549	4898556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8632	NC_010524	GC	3	6	4899378	4899383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8633	NC_010524	TG	3	6	4899388	4899393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8634	NC_010524	GGTGC	2	10	4899450	4899459	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8635	NC_010524	CGGC	2	8	4899460	4899467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8636	NC_010524	GAC	2	6	4899485	4899490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8637	NC_010524	GCC	2	6	4899500	4899505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8638	NC_010524	TGGA	2	8	4899630	4899637	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8639	NC_010524	CGT	2	6	4899661	4899666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8640	NC_010524	CCA	2	6	4899725	4899730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8641	NC_010524	GCC	2	6	4901052	4901057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8642	NC_010524	GCT	2	6	4901060	4901065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8643	NC_010524	CCT	2	6	4901066	4901071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8644	NC_010524	CGCCGG	2	12	4901098	4901109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8645	NC_010524	GAAG	2	8	4901203	4901210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8646	NC_010524	GCTG	2	8	4903632	4903639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8647	NC_010524	CAG	2	6	4903640	4903645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8648	NC_010524	CG	3	6	4904381	4904386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8649	NC_010524	CG	3	6	4904388	4904393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8650	NC_010524	GTC	2	6	4904396	4904401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8651	NC_010524	CGA	2	6	4905917	4905922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8652	NC_010524	GCC	2	6	4905926	4905931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8653	NC_010524	AGG	2	6	4905932	4905937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8654	NC_010524	CGC	2	6	4905943	4905948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8655	NC_010524	GCG	2	6	4905967	4905972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8656	NC_010524	GC	3	6	4905985	4905990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8657	NC_010524	CGGGC	2	10	4906008	4906017	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8658	NC_010524	G	6	6	4906037	4906042	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8659	NC_010524	CCT	2	6	4906066	4906071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8660	NC_010524	TTGA	2	8	4906097	4906104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8661	NC_010524	CTGC	2	8	4906107	4906114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8662	NC_010524	CGA	2	6	4906117	4906122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8663	NC_010524	GC	3	6	4906151	4906156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8664	NC_010524	GGC	2	6	4906187	4906192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8665	NC_010524	TG	3	6	4906202	4906207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8666	NC_010524	TC	3	6	4906213	4906218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8667	NC_010524	GGC	2	6	4906264	4906269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8668	NC_010524	GCC	2	6	4906276	4906281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8669	NC_010524	CCGAGC	2	12	4908343	4908354	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8670	NC_010524	TCGG	2	8	4908384	4908391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8671	NC_010524	CGG	3	9	4908439	4908447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8672	NC_010524	CGTC	2	8	4908930	4908937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8673	NC_010524	CGC	2	6	4908973	4908978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8674	NC_010524	AGC	2	6	4909147	4909152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8675	NC_010524	GCC	2	6	4909188	4909193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8676	NC_010524	ACGC	2	8	4909241	4909248	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8677	NC_010524	GC	3	6	4909275	4909280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8678	NC_010524	CCG	2	6	4909293	4909298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8679	NC_010524	ACA	2	6	4909318	4909323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8680	NC_010524	GCG	3	9	4909331	4909339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...6789101112131415161718Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.