MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010524	GCG	2	6	4519723	4519728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_010524	TGC	2	6	4519751	4519756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_010524	GGCGG	2	10	4520308	4520317	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8004	NC_010524	GAGCGG	2	12	4520319	4520330	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8005	NC_010524	CTG	2	6	4520663	4520668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_010524	GC	3	6	4520701	4520706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8007	NC_010524	A	6	6	4520716	4520721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_010524	CGG	2	6	4520724	4520729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_010524	GCG	2	6	4523489	4523494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_010524	CCG	2	6	4523509	4523514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_010524	TG	3	6	4523530	4523535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_010524	GCG	2	6	4523573	4523578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_010524	CAC	2	6	4523676	4523681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_010524	CGCC	2	8	4523729	4523736	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8015	NC_010524	AC	3	6	4525980	4525985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8016	NC_010524	ACG	2	6	4528602	4528607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_010524	CTG	2	6	4529605	4529610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_010524	CGG	5	15	4529622	4529636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_010524	TTC	2	6	4529638	4529643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_010524	GCG	2	6	4529651	4529656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_010524	CTG	2	6	4529659	4529664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_010524	GCG	2	6	4529690	4529695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_010524	CTGG	2	8	4529701	4529708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8024	NC_010524	CTG	4	12	4529716	4529727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_010524	GGC	2	6	4529731	4529736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_010524	CAG	2	6	4529815	4529820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_010524	CAC	2	6	4529952	4529957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8028	NC_010524	CAGGC	2	10	4529964	4529973	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8029	NC_010524	CGA	2	6	4529996	4530001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_010524	CGA	2	6	4530029	4530034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_010524	CGG	2	6	4530053	4530058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_010524	CACG	2	8	4530080	4530087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_010524	GCA	2	6	4530088	4530093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_010524	AGC	2	6	4530097	4530102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_010524	AC	3	6	4532155	4532160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8036	NC_010524	GTT	2	6	4532184	4532189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_010524	CGG	2	6	4532240	4532245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_010524	CGGC	2	8	4533045	4533052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8039	NC_010524	GCG	2	6	4533594	4533599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_010524	CGGG	2	8	4533609	4533616	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8041	NC_010524	CG	3	6	4533653	4533658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8042	NC_010524	CGGGC	2	10	4533668	4533677	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8043	NC_010524	GC	3	6	4533676	4533681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8044	NC_010524	GCC	2	6	4535247	4535252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_010524	G	7	7	4537447	4537453	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_010524	CCG	2	6	4538632	4538637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_010524	CG	3	6	4538680	4538685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_010524	CG	3	6	4538771	4538776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8049	NC_010524	CG	3	6	4538790	4538795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8050	NC_010524	G	6	6	4539493	4539498	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_010524	CGC	2	6	4539510	4539515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8052	NC_010524	GCGCG	2	10	4540178	4540187	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8053	NC_010524	CCG	2	6	4540202	4540207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8054	NC_010524	GGC	2	6	4540208	4540213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_010524	GCGA	2	8	4542186	4542193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8056	NC_010524	CAC	2	6	4547271	4547276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8057	NC_010524	CGG	2	6	4549962	4549967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_010524	ACG	2	6	4549982	4549987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_010524	CGA	2	6	4554337	4554342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_010524	TCG	2	6	4554362	4554367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_010524	AGC	2	6	4554368	4554373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_010524	CCG	2	6	4554380	4554385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_010524	CAGG	2	8	4554475	4554482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8064	NC_010524	ACG	2	6	4554519	4554524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_010524	ACC	2	6	4555173	4555178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_010524	TCG	2	6	4556828	4556833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_010524	GGCG	2	8	4557722	4557729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8068	NC_010524	CGGC	2	8	4557810	4557817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8069	NC_010524	TCGG	2	8	4562091	4562098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8070	NC_010524	GCC	2	6	4562121	4562126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_010524	CCG	2	6	4562191	4562196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8072	NC_010524	CCGGC	2	10	4562240	4562249	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8073	NC_010524	CAGCG	2	10	4574308	4574317	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8074	NC_010524	CCGC	2	8	4574356	4574363	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8075	NC_010524	CGC	3	9	4574361	4574369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8076	NC_010524	CGT	2	6	4575781	4575786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8078	NC_010524	CCG	2	6	4576753	4576758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_010524	GCG	2	6	4576761	4576766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_010524	CGCGG	2	10	4584329	4584338	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8081	NC_010524	ACC	2	6	4585422	4585427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_010524	CGGG	2	8	4585453	4585460	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8083	NC_010524	CG	3	6	4585487	4585492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8084	NC_010524	ATCG	2	8	4585495	4585502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_010524	CCG	2	6	4585520	4585525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8086	NC_010524	GCG	2	6	4585530	4585535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_010524	GTTG	2	8	4587588	4587595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_010524	CGG	2	6	4588664	4588669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_010524	GAA	2	6	4588682	4588687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_010524	GC	3	6	4595489	4595494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8091	NC_010524	CCG	2	6	4598125	4598130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_010524	ACC	2	6	4598157	4598162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8093	NC_010524	GAT	2	6	4598163	4598168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_010524	CGG	2	6	4598172	4598177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_010524	CGC	2	6	4598183	4598188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8099	NC_010524	GCG	3	9	4598356	4598364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_010524	TGG	2	6	4598376	4598381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_010524	GCC	2	6	4598389	4598394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8102	NC_010524	GCC	2	6	4598413	4598418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_010524	CGC	2	6	4599090	4599095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8104	NC_010524	CCCG	2	8	4599100	4599107	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8105	NC_010524	CGG	2	6	4599848	4599853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_010524	CG	3	6	4599871	4599876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8107	NC_010524	GAG	2	6	4599881	4599886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_010524	CG	3	6	4609469	4609474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8109	NC_010524	CGG	2	6	4609514	4609519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_010524	GGC	2	6	4610526	4610531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_010524	GCG	2	6	4612210	4612215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_010524	ATTA	2	8	4612762	4612769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_010524	GCC	3	9	4612776	4612784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_010524	GCG	2	6	4612809	4612814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_010524	TGA	2	6	4612841	4612846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8117	NC_010524	TTG	2	6	4614111	4614116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_010524	CCGCG	2	10	4617483	4617492	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8119	NC_010524	CGG	2	6	4617958	4617963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_010524	CG	4	8	4618043	4618050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_010524	CAG	2	6	4618068	4618073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_010524	GTTC	2	8	4626147	4626154	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8123	NC_010524	CGG	2	6	4626718	4626723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_010524	GCA	2	6	4632910	4632915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_010524	GC	3	6	4632916	4632921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8126	NC_010524	ATGG	2	8	4638325	4638332	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_010524	GTGTCG	2	12	4638341	4638352	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8128	NC_010524	CTC	2	6	4640324	4640329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8129	NC_010524	GGTT	2	8	4642351	4642358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_010524	CGT	2	6	4642363	4642368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_010524	CAG	2	6	4642411	4642416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8132	NC_010524	CA	3	6	4642433	4642438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8133	NC_010524	CGC	2	6	4642488	4642493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8134	NC_010524	CGG	2	6	4643667	4643672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8135	NC_010524	GC	3	6	4644565	4644570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8139	NC_010524	GC	3	6	4645643	4645648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8164	NC_010524	CTG	2	6	4651646	4651651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8245	NC_010524	CGT	2	6	4686570	4686575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8247	NC_010524	GC	3	6	4687465	4687470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8249	NC_010524	CGC	2	6	4690700	4690705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8250	NC_010524	GCTC	2	8	4692217	4692224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8251	NC_010524	GCCAC	2	10	4692269	4692278	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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8253	NC_010524	TG	3	6	4692309	4692314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8254	NC_010524	GGCGC	2	10	4692318	4692327	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8255	NC_010524	CCA	2	6	4692692	4692697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8256	NC_010524	ACA	2	6	4693797	4693802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8257	NC_010524	GT	3	6	4693844	4693849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8258	NC_010524	GCCCG	2	10	4694470	4694479	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8259	NC_010524	TG	3	6	4694488	4694493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8260	NC_010524	CG	3	6	4694509	4694514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8390	NC_010524	CCCG	2	8	4764506	4764513	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8391	NC_010524	GCG	2	6	4764521	4764526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8392	NC_010524	CG	3	6	4764587	4764592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8395	NC_010524	GCCC	2	8	4768369	4768376	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8396	NC_010524	TCA	2	6	4768403	4768408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8398	NC_010524	CTG	2	6	4768428	4768433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8399	NC_010524	GTT	2	6	4771127	4771132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8400	NC_010524	ATCG	2	8	4771140	4771147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8401	NC_010524	GGC	2	6	4771165	4771170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8403	NC_010524	GCC	2	6	4773195	4773200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8405	NC_010524	CCACC	2	10	4773255	4773264	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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8481	NC_010524	CCG	2	6	4803459	4803464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8482	NC_010524	CGCT	2	8	4803469	4803476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8483	NC_010524	CGTG	2	8	4803522	4803529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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