MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_010524	CCG	2	6	4227285	4227290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7502	NC_010524	CTC	2	6	4227309	4227314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7503	NC_010524	TGG	2	6	4227388	4227393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_010524	GCC	2	6	4227446	4227451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7505	NC_010524	GGA	2	6	4227463	4227468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_010524	GGC	2	6	4229909	4229914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_010524	CAA	2	6	4231385	4231390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7508	NC_010524	GC	3	6	4231392	4231397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7509	NC_010524	CGA	2	6	4231404	4231409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_010524	C	6	6	4231506	4231511	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7511	NC_010524	CAA	2	6	4231572	4231577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7512	NC_010524	ACC	2	6	4231586	4231591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7513	NC_010524	GCCA	2	8	4233318	4233325	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7514	NC_010524	CGG	2	6	4233335	4233340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_010524	TCC	2	6	4233363	4233368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7516	NC_010524	GCC	2	6	4233379	4233384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7517	NC_010524	CCG	2	6	4233840	4233845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7518	NC_010524	ATG	2	6	4233851	4233856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_010524	GCA	2	6	4233882	4233887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_010524	GC	3	6	4235779	4235784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7521	NC_010524	CG	3	6	4235792	4235797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7522	NC_010524	CGAT	2	8	4236929	4236936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7523	NC_010524	GC	4	8	4236942	4236949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7524	NC_010524	CAAT	2	8	4238979	4238986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7525	NC_010524	GCAG	2	8	4239046	4239053	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7526	NC_010524	GTT	2	6	4240587	4240592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_010524	CG	3	6	4240651	4240656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7528	NC_010524	TGGA	2	8	4244001	4244008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_010524	TGGC	2	8	4244036	4244043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7530	NC_010524	CACCT	2	10	4244044	4244053	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7531	NC_010524	TCG	2	6	4244173	4244178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_010524	GCCC	2	8	4244208	4244215	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7533	NC_010524	CGC	2	6	4245637	4245642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7534	NC_010524	CTC	2	6	4246041	4246046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7535	NC_010524	GCCG	2	8	4246101	4246108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7536	NC_010524	A	7	7	4246109	4246115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_010524	CCGGC	2	10	4246119	4246128	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7538	NC_010524	GTT	2	6	4246149	4246154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_010524	CGG	2	6	4247263	4247268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_010524	GCCC	2	8	4247285	4247292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7541	NC_010524	GCA	2	6	4247295	4247300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_010524	GGC	2	6	4250168	4250173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_010524	CTG	2	6	4252902	4252907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7544	NC_010524	G	6	6	4252932	4252937	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_010524	CTC	2	6	4252946	4252951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_010524	GGCC	2	8	4252961	4252968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7547	NC_010524	GCC	2	6	4258973	4258978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7548	NC_010524	GGCA	2	8	4258981	4258988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7549	NC_010524	CCCG	2	8	4259105	4259112	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7550	NC_010524	GGT	2	6	4259114	4259119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_010524	GCT	2	6	4259152	4259157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7552	NC_010524	CAC	2	6	4259232	4259237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7553	NC_010524	TGC	2	6	4259288	4259293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_010524	GCC	2	6	4259294	4259299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7555	NC_010524	GCCC	2	8	4259311	4259318	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7556	NC_010524	TTCAG	2	10	4259354	4259363	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7557	NC_010524	CA	3	6	4259395	4259400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7558	NC_010524	G	6	6	4259408	4259413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_010524	CGT	2	6	4259417	4259422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_010524	GCCGT	2	10	4259436	4259445	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7561	NC_010524	TTC	2	6	4259490	4259495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_010524	CGG	2	6	4259513	4259518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7563	NC_010524	GAT	2	6	4259519	4259524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_010524	CTC	2	6	4259525	4259530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7565	NC_010524	GCG	2	6	4261436	4261441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_010524	GCCA	2	8	4263653	4263660	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7567	NC_010524	GGC	2	6	4263671	4263676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_010524	CA	3	6	4263689	4263694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7569	NC_010524	CGC	3	9	4263718	4263726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7570	NC_010524	CGGC	2	8	4263746	4263753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7571	NC_010524	TC	3	6	4263777	4263782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7572	NC_010524	CGG	2	6	4266128	4266133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_010524	CAT	2	6	4266136	4266141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7574	NC_010524	GAC	2	6	4266683	4266688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_010524	CGGG	2	8	4266690	4266697	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7576	NC_010524	GC	3	6	4267776	4267781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7577	NC_010524	ACG	2	6	4267790	4267795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7578	NC_010524	ATC	2	6	4267796	4267801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7579	NC_010524	GAC	2	6	4267819	4267824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7580	NC_010524	G	6	6	4268783	4268788	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_010524	CAAC	2	8	4271777	4271784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7582	NC_010524	GC	3	6	4272904	4272909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7583	NC_010524	CGGC	2	8	4274410	4274417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7584	NC_010524	GC	3	6	4274473	4274478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7585	NC_010524	GAT	2	6	4276121	4276126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7586	NC_010524	GCC	2	6	4276137	4276142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7587	NC_010524	GGC	2	6	4276159	4276164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7588	NC_010524	TCG	2	6	4277113	4277118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7589	NC_010524	CGG	2	6	4277121	4277126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7590	NC_010524	GGCCC	2	10	4277129	4277138	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7591	NC_010524	TGA	2	6	4277146	4277151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_010524	ATT	2	6	4277156	4277161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_010524	GCG	2	6	4277223	4277228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7594	NC_010524	ACG	2	6	4278438	4278443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_010524	GCCC	2	8	4278494	4278501	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7596	NC_010524	T	7	7	4278514	4278520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_010524	CA	3	6	4279043	4279048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7598	NC_010524	C	6	6	4280067	4280072	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7599	NC_010524	GCGG	2	8	4280574	4280581	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7600	NC_010524	GCC	2	6	4280593	4280598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7601	NC_010524	CCG	2	6	4281438	4281443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7602	NC_010524	ACG	2	6	4282399	4282404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7603	NC_010524	CGTT	2	8	4282405	4282412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7604	NC_010524	GTG	2	6	4282518	4282523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_010524	CAA	2	6	4282610	4282615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7606	NC_010524	GCA	2	6	4282649	4282654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7609	NC_010524	GCC	2	6	4286646	4286651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7610	NC_010524	AGAC	2	8	4286661	4286668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7611	NC_010524	CGG	2	6	4287583	4287588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_010524	GCA	2	6	4287616	4287621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7614	NC_010524	GT	3	6	4287663	4287668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_010524	CGCC	2	8	4287845	4287852	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7616	NC_010524	CGA	2	6	4287863	4287868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7617	NC_010524	CAG	2	6	4294064	4294069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7618	NC_010524	A	6	6	4294075	4294080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_010524	GCCG	2	8	4294092	4294099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7620	NC_010524	T	6	6	4294702	4294707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_010524	GCA	2	6	4294714	4294719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7622	NC_010524	AAC	2	6	4294764	4294769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7623	NC_010524	CGGC	2	8	4294824	4294831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7624	NC_010524	CCG	2	6	4294838	4294843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7625	NC_010524	GAC	2	6	4297447	4297452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7626	NC_010524	GACA	2	8	4297509	4297516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7627	NC_010524	CCA	2	6	4297557	4297562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7628	NC_010524	CCAC	2	8	4298626	4298633	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7629	NC_010524	CG	3	6	4298690	4298695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7630	NC_010524	ATC	2	6	4298796	4298801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7631	NC_010524	GCAG	2	8	4298826	4298833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7632	NC_010524	CA	3	6	4298884	4298889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7633	NC_010524	TGG	2	6	4298902	4298907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7666	NC_010524	GCGGG	2	10	4316336	4316345	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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7762	NC_010524	CCG	2	6	4367514	4367519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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