MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_010524	GAT	2	6	3885940	3885945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_010524	CAT	2	6	3886000	3886005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_010524	GAC	2	6	3886029	3886034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_010524	CGG	2	6	3886070	3886075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_010524	GGCC	2	8	3886303	3886310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7006	NC_010524	CGGC	2	8	3886718	3886725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7007	NC_010524	ACC	2	6	3886748	3886753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7008	NC_010524	GCC	2	6	3886770	3886775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7009	NC_010524	CCGTG	2	10	3886893	3886902	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7010	NC_010524	CCGG	2	8	3886908	3886915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_010524	TTC	2	6	3886921	3886926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_010524	GAC	2	6	3886954	3886959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_010524	C	11	11	3887000	3887010	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7014	NC_010524	CGC	2	6	3887099	3887104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_010524	CG	3	6	3890818	3890823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7016	NC_010524	TGCAG	2	10	3890836	3890845	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7017	NC_010524	AGC	2	6	3891005	3891010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_010524	CAC	2	6	3891029	3891034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7019	NC_010524	CGGGT	2	10	3891094	3891103	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7020	NC_010524	GCA	2	6	3891151	3891156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_010524	GCACCA	2	12	3891161	3891172	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7022	NC_010524	ACC	2	6	3891176	3891181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_010524	GC	3	6	3891353	3891358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7024	NC_010524	GGCT	2	8	3891359	3891366	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7025	NC_010524	CATCG	2	10	3892076	3892085	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7026	NC_010524	GC	4	8	3892109	3892116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7027	NC_010524	TGC	2	6	3892150	3892155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_010524	TGG	2	6	3892171	3892176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_010524	GCG	2	6	3892195	3892200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_010524	CCG	2	6	3892204	3892209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_010524	GATC	2	8	3892217	3892224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7032	NC_010524	GTC	2	6	3892226	3892231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_010524	TCA	2	6	3892436	3892441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_010524	AGT	2	6	3892458	3892463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_010524	ACC	2	6	3892566	3892571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7036	NC_010524	CAA	2	6	3892612	3892617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_010524	GCC	2	6	3892685	3892690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7038	NC_010524	AGGT	2	8	3892704	3892711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_010524	TGC	2	6	3892759	3892764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_010524	CCCG	2	8	3892782	3892789	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7041	NC_010524	GC	3	6	3892823	3892828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7042	NC_010524	GAT	2	6	3892832	3892837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_010524	CAGG	2	8	3892846	3892853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7044	NC_010524	CAAA	2	8	3892869	3892876	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7045	NC_010524	GCC	2	6	3892880	3892885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_010524	GC	3	6	3892922	3892927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7047	NC_010524	CTG	2	6	3892990	3892995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_010524	GGCTT	2	10	3893124	3893133	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7049	NC_010524	GGC	2	6	3893163	3893168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_010524	GCC	2	6	3893176	3893181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_010524	CGGT	2	8	3893183	3893190	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7052	NC_010524	TGC	2	6	3894309	3894314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_010524	CCGA	2	8	3894372	3894379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7054	NC_010524	TGA	2	6	3895457	3895462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_010524	GTT	2	6	3895468	3895473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_010524	TTG	2	6	3895528	3895533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_010524	A	6	6	3895592	3895597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_010524	A	6	6	3895637	3895642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_010524	CCGG	2	8	3895702	3895709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7060	NC_010524	GTT	2	6	3897444	3897449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_010524	TTC	2	6	3897514	3897519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_010524	CTC	2	6	3898310	3898315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_010524	GCG	2	6	3898318	3898323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_010524	CGGC	2	8	3898331	3898338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7065	NC_010524	GCC	2	6	3898339	3898344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7066	NC_010524	CGC	2	6	3898349	3898354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7067	NC_010524	ACGGC	2	10	3899439	3899448	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7068	NC_010524	AGA	2	6	3900373	3900378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_010524	AC	3	6	3902100	3902105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7070	NC_010524	C	6	6	3907038	3907043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7071	NC_010524	GCC	2	6	3907958	3907963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7072	NC_010524	GAAT	2	8	3907966	3907973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_010524	CCA	2	6	3910484	3910489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7074	NC_010524	TCCT	2	8	3911491	3911498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7075	NC_010524	ATC	2	6	3911509	3911514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_010524	T	6	6	3911549	3911554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_010524	CGG	2	6	3912566	3912571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_010524	GCC	2	6	3912577	3912582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7079	NC_010524	ACC	2	6	3912583	3912588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7080	NC_010524	CG	3	6	3913307	3913312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7081	NC_010524	GGCC	2	8	3913330	3913337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7082	NC_010524	GCG	2	6	3914336	3914341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_010524	CTC	2	6	3914871	3914876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7084	NC_010524	GCC	2	6	3915565	3915570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7085	NC_010524	CGC	2	6	3915582	3915587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7086	NC_010524	TCT	2	6	3915663	3915668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7087	NC_010524	GC	3	6	3915673	3915678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7088	NC_010524	GC	3	6	3915685	3915690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7089	NC_010524	CTT	2	6	3921729	3921734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_010524	CA	3	6	3923334	3923339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7091	NC_010524	CCG	2	6	3923368	3923373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7092	NC_010524	AGAC	2	8	3923377	3923384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7093	NC_010524	ACCCCG	2	12	3924138	3924149	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7094	NC_010524	CG	3	6	3924272	3924277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7095	NC_010524	CAG	2	6	3925827	3925832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7097	NC_010524	CACG	2	8	3925889	3925896	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7098	NC_010524	CGAC	2	8	3925949	3925956	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7099	NC_010524	CGA	2	6	3926722	3926727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_010524	GT	3	6	3926753	3926758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_010524	GTCG	2	8	3927199	3927206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7102	NC_010524	CGC	2	6	3927213	3927218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_010524	GGC	2	6	3927219	3927224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_010524	GT	3	6	3928009	3928014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_010524	AC	3	6	3928495	3928500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7106	NC_010524	GCC	2	6	3928517	3928522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7109	NC_010524	GTC	2	6	3928937	3928942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_010524	CGC	2	6	3931517	3931522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7111	NC_010524	GCA	2	6	3934340	3934345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_010524	GCC	3	9	3934401	3934409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7113	NC_010524	GGC	2	6	3939659	3939664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_010524	GCG	2	6	3939680	3939685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_010524	CGT	2	6	3940988	3940993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7116	NC_010524	CGG	2	6	3941025	3941030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_010524	GCA	2	6	3943348	3943353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7119	NC_010524	TGA	2	6	3943402	3943407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_010524	GCA	2	6	3943425	3943430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_010524	GGC	2	6	3944624	3944629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_010524	CCGT	2	8	3944693	3944700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7123	NC_010524	CCG	2	6	3945099	3945104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7124	NC_010524	ACG	2	6	3945107	3945112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_010524	AGA	2	6	3945153	3945158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_010524	AAGC	2	8	3945168	3945175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7127	NC_010524	GCC	2	6	3945200	3945205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7128	NC_010524	GCG	2	6	3946702	3946707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_010524	C	6	6	3946713	3946718	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7130	NC_010524	AGTC	2	8	3947674	3947681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7131	NC_010524	GTC	2	6	3949302	3949307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7133	NC_010524	GACG	2	8	3950665	3950672	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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