MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010524	CGC	2	6	3591641	3591646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6502	NC_010524	GCA	2	6	3591662	3591667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_010524	CGA	2	6	3591710	3591715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_010524	CGG	2	6	3591773	3591778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_010524	CGC	2	6	3591784	3591789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_010524	GC	4	8	3593265	3593272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6507	NC_010524	GC	3	6	3593288	3593293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6508	NC_010524	GGC	2	6	3593322	3593327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_010524	TCCGA	2	10	3593342	3593351	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6510	NC_010524	ACG	2	6	3595678	3595683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_010524	AGC	2	6	3595690	3595695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_010524	AACT	2	8	3596703	3596710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6513	NC_010524	ATC	2	6	3596744	3596749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_010524	AGC	2	6	3596786	3596791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_010524	ACCG	2	8	3596853	3596860	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6516	NC_010524	ACA	2	6	3596886	3596891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_010524	ACCCG	2	10	3596892	3596901	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6518	NC_010524	GCC	2	6	3596954	3596959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_010524	CGC	2	6	3598012	3598017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6520	NC_010524	CCA	2	6	3598028	3598033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6521	NC_010524	GGCAC	2	10	3598049	3598058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6522	NC_010524	ATT	2	6	3598091	3598096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_010524	CAG	2	6	3598099	3598104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_010524	GTCCC	2	10	3598131	3598140	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6525	NC_010524	GCA	2	6	3598158	3598163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_010524	CG	3	6	3607895	3607900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6527	NC_010524	GCAG	2	8	3611623	3611630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6528	NC_010524	CAT	2	6	3611662	3611667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_010524	GCG	2	6	3611692	3611697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_010524	CTG	2	6	3611747	3611752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_010524	TTCG	2	8	3612929	3612936	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6532	NC_010524	C	6	6	3612940	3612945	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6533	NC_010524	GTC	2	6	3615243	3615248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_010524	GGCC	2	8	3615257	3615264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6535	NC_010524	GCGA	2	8	3616581	3616588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6536	NC_010524	GGT	2	6	3619318	3619323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_010524	G	6	6	3619326	3619331	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_010524	GGC	2	6	3619341	3619346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_010524	GCATCG	2	12	3619352	3619363	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_010524	GCA	2	6	3624831	3624836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_010524	GC	3	6	3624853	3624858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6542	NC_010524	CCG	2	6	3624905	3624910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6543	NC_010524	GCC	2	6	3625271	3625276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6544	NC_010524	CGGC	2	8	3625279	3625286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6545	NC_010524	GCG	2	6	3625291	3625296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_010524	CGG	2	6	3625337	3625342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_010524	CG	3	6	3625367	3625372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6548	NC_010524	CCG	2	6	3625373	3625378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6549	NC_010524	CGG	2	6	3627812	3627817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_010524	CGGCG	2	10	3628925	3628934	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6551	NC_010524	AG	3	6	3629412	3629417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_010524	CGG	2	6	3629449	3629454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_010524	CGG	2	6	3629474	3629479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_010524	GAG	2	6	3629491	3629496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_010524	GAG	2	6	3629598	3629603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_010524	GCCAC	2	10	3629641	3629650	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6557	NC_010524	ACG	2	6	3629667	3629672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_010524	CCCG	2	8	3629679	3629686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6559	NC_010524	AGT	2	6	3629735	3629740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_010524	CGG	2	6	3632530	3632535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_010524	GCA	2	6	3635521	3635526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_010524	A	8	8	3636244	3636251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_010524	TC	3	6	3636561	3636566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_010524	TGAA	2	8	3636568	3636575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_010524	GCT	2	6	3636589	3636594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_010524	CAG	2	6	3636595	3636600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_010524	GC	3	6	3636670	3636675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6568	NC_010524	CGC	2	6	3637897	3637902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6569	NC_010524	GC	3	6	3639052	3639057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6570	NC_010524	GC	3	6	3639075	3639080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_010524	CGG	2	6	3639388	3639393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_010524	GCC	2	6	3639749	3639754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6573	NC_010524	GCG	2	6	3639824	3639829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_010524	AAG	2	6	3639865	3639870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_010524	GCG	2	6	3639957	3639962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_010524	AC	4	8	3639971	3639978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6577	NC_010524	AGCCT	2	10	3639991	3640000	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6578	NC_010524	CAA	2	6	3641175	3641180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_010524	GCA	2	6	3641787	3641792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_010524	CCA	2	6	3641853	3641858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6581	NC_010524	TGC	2	6	3644189	3644194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_010524	T	8	8	3644229	3644236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_010524	TGC	2	6	3644342	3644347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_010524	CACC	2	8	3644406	3644413	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6585	NC_010524	GAG	2	6	3644414	3644419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_010524	GCGTG	2	10	3645257	3645266	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6587	NC_010524	CGC	2	6	3646417	3646422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6588	NC_010524	AGC	2	6	3650460	3650465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_010524	GCC	2	6	3650466	3650471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6590	NC_010524	TTTG	2	8	3651486	3651493	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_010524	ACC	2	6	3651560	3651565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6592	NC_010524	CCGCC	2	10	3652865	3652874	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6593	NC_010524	AGA	2	6	3652888	3652893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_010524	GAC	2	6	3659095	3659100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_010524	TTGATC	2	12	3659121	3659132	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6596	NC_010524	GGCA	2	8	3659136	3659143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6597	NC_010524	GCC	2	6	3662595	3662600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6598	NC_010524	GATC	2	8	3665978	3665985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6599	NC_010524	GAA	2	6	3666060	3666065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_010524	ACG	2	6	3666074	3666079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_010524	GACC	2	8	3666080	3666087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6602	NC_010524	ACA	2	6	3666151	3666156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_010524	ACC	2	6	3666175	3666180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6604	NC_010524	GCA	2	6	3667483	3667488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_010524	CCACC	2	10	3669551	3669560	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6606	NC_010524	CGAAC	2	10	3669564	3669573	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6607	NC_010524	TCCA	2	8	3672043	3672050	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6608	NC_010524	A	6	6	3672074	3672079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_010524	CAAT	2	8	3672129	3672136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6610	NC_010524	CAT	2	6	3672140	3672145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_010524	TCA	2	6	3672159	3672164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_010524	CTT	2	6	3672176	3672181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_010524	CAT	2	6	3672193	3672198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_010524	GAC	2	6	3673294	3673299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_010524	CACC	2	8	3673338	3673345	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6616	NC_010524	TGC	2	6	3673836	3673841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_010524	CGTT	2	8	3673905	3673912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6618	NC_010524	TTC	2	6	3674445	3674450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_010524	GAA	2	6	3674453	3674458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_010524	GACA	2	8	3674517	3674524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6621	NC_010524	TCG	2	6	3674554	3674559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_010524	GGA	2	6	3674564	3674569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_010524	GGC	2	6	3675468	3675473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_010524	GCC	2	6	3677076	3677081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_010524	CG	5	10	3677095	3677104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6626	NC_010524	GC	3	6	3677106	3677111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_010524	TTCAG	2	10	3677147	3677156	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6628	NC_010524	TGT	2	6	3678218	3678223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_010524	GGC	2	6	3678231	3678236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6631	NC_010524	CG	3	6	3678262	3678267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6763	NC_010524	CGT	2	6	3767225	3767230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6764	NC_010524	GCC	2	6	3768138	3768143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6765	NC_010524	TGT	2	6	3769074	3769079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6766	NC_010524	GCTGC	2	10	3769100	3769109	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6770	NC_010524	CCGGG	2	10	3772107	3772116	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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6776	NC_010524	GC	3	6	3773764	3773769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6777	NC_010524	ACGC	2	8	3778577	3778584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6783	NC_010524	CCG	2	6	3782870	3782875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6785	NC_010524	AAC	2	6	3790595	3790600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6791	NC_010524	CGGC	2	8	3793750	3793757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6793	NC_010524	GCA	2	6	3793814	3793819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6794	NC_010524	CACC	2	8	3793825	3793832	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6795	NC_010524	GCT	2	6	3793845	3793850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6798	NC_010524	CCG	2	6	3795183	3795188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6799	NC_010524	CG	3	6	3795937	3795942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6806	NC_010524	ATTCA	2	10	3797461	3797470	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6851	NC_010524	GCCGG	2	10	3834758	3834767	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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6877	NC_010524	TCGG	2	8	3849236	3849243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6878	NC_010524	GCC	2	6	3849280	3849285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6891	NC_010524	GC	3	6	3853759	3853764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6892	NC_010524	CCT	2	6	3853800	3853805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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