MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010524	GCC	2	6	3125735	3125740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_010524	GCA	2	6	3127249	3127254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_010524	CG	3	6	3127275	3127280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_010524	GC	3	6	3134444	3134449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_010524	TCT	2	6	3135035	3135040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_010524	CG	3	6	3135817	3135822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_010524	CGC	2	6	3135844	3135849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_010524	A	7	7	3136828	3136834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_010524	GCG	2	6	3137709	3137714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_010524	CCCG	2	8	3137751	3137758	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5511	NC_010524	CA	4	8	3137816	3137823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_010524	CCGT	2	8	3137843	3137850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_010524	GCC	2	6	3137851	3137856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_010524	CGG	3	9	3142639	3142647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_010524	CTTT	2	8	3144905	3144912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_010524	CAG	2	6	3144925	3144930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_010524	GAA	2	6	3144946	3144951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_010524	AAT	2	6	3145052	3145057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_010524	ATT	2	6	3145076	3145081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_010524	GGC	2	6	3145088	3145093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_010524	CA	3	6	3145115	3145120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_010524	GAT	2	6	3145133	3145138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_010524	CGT	2	6	3145152	3145157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_010524	CGATC	2	10	3145158	3145167	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5525	NC_010524	GAC	2	6	3145168	3145173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_010524	A	6	6	3145179	3145184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_010524	GAC	2	6	3145210	3145215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_010524	TCA	2	6	3145230	3145235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_010524	CTC	2	6	3145771	3145776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_010524	GAAAG	2	10	3147150	3147159	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_010524	CAA	2	6	3147166	3147171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_010524	GC	3	6	3147174	3147179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_010524	CGGGC	2	10	3148379	3148388	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5534	NC_010524	TGG	2	6	3150756	3150761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_010524	AACGGC	2	12	3150821	3150832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_010524	GCCG	2	8	3152410	3152417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_010524	GA	3	6	3155654	3155659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_010524	TGT	2	6	3155691	3155696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_010524	GCC	2	6	3155701	3155706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_010524	GAT	2	6	3155721	3155726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_010524	GCG	2	6	3155733	3155738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_010524	CAGG	2	8	3155739	3155746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_010524	CGG	2	6	3155758	3155763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_010524	TCT	2	6	3157088	3157093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_010524	A	6	6	3157095	3157100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_010524	GGCC	2	8	3157104	3157111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_010524	CCGGA	2	10	3157124	3157133	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5548	NC_010524	GAG	2	6	3160280	3160285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_010524	ACC	2	6	3164981	3164986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_010524	CAT	2	6	3165075	3165080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_010524	TGTGT	2	10	3165101	3165110	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_010524	GTC	2	6	3165138	3165143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_010524	CTG	2	6	3165252	3165257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_010524	TC	3	6	3165271	3165276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_010524	TCG	2	6	3169450	3169455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_010524	CG	3	6	3170271	3170276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_010524	GC	4	8	3170297	3170304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_010524	CGC	2	6	3171457	3171462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_010524	CGCA	2	8	3173313	3173320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_010524	GC	3	6	3173323	3173328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_010524	GCG	2	6	3174613	3174618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_010524	CCGGC	2	10	3174629	3174638	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5563	NC_010524	AC	3	6	3174646	3174651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_010524	GC	3	6	3174664	3174669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5565	NC_010524	CCA	2	6	3174681	3174686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_010524	CCGT	2	8	3178829	3178836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_010524	GCA	2	6	3178850	3178855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_010524	CGG	2	6	3178907	3178912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_010524	GCA	2	6	3178921	3178926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_010524	CG	3	6	3178934	3178939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_010524	TGA	2	6	3178976	3178981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_010524	CGGC	2	8	3179003	3179010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_010524	GAC	2	6	3179027	3179032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_010524	AGGC	2	8	3179901	3179908	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_010524	AGA	2	6	3180912	3180917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_010524	CGG	2	6	3180930	3180935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_010524	GTT	2	6	3180960	3180965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_010524	TG	3	6	3184401	3184406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_010524	GACA	2	8	3184429	3184436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5580	NC_010524	GACA	2	8	3184449	3184456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_010524	GC	3	6	3184526	3184531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_010524	TAG	2	6	3184547	3184552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_010524	TCA	2	6	3184588	3184593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_010524	GGC	3	9	3185497	3185505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_010524	CAA	2	6	3185556	3185561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_010524	GC	3	6	3185589	3185594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5587	NC_010524	ATC	2	6	3186621	3186626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_010524	TC	4	8	3186625	3186632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5589	NC_010524	GCC	2	6	3186702	3186707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_010524	G	6	6	3186733	3186738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_010524	CCG	2	6	3186751	3186756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_010524	AGC	2	6	3186757	3186762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_010524	GCCG	2	8	3187300	3187307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5594	NC_010524	GCG	2	6	3187308	3187313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_010524	CCG	2	6	3187318	3187323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5596	NC_010524	GCC	2	6	3187404	3187409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5597	NC_010524	GAG	2	6	3187417	3187422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_010524	CCGA	2	8	3187424	3187431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5599	NC_010524	CTC	3	9	3189254	3189262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_010524	G	6	6	3189379	3189384	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_010524	GCA	2	6	3189412	3189417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_010524	CGC	2	6	3189418	3189423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_010524	CGCC	2	8	3189464	3189471	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5604	NC_010524	CGGCC	2	10	3190606	3190615	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5605	NC_010524	GCC	2	6	3191881	3191886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_010524	CG	3	6	3191907	3191912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_010524	A	6	6	3192304	3192309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_010524	CGC	2	6	3192345	3192350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5609	NC_010524	GAC	2	6	3192364	3192369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_010524	TGC	2	6	3192729	3192734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_010524	AGGC	2	8	3192789	3192796	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5612	NC_010524	GAG	2	6	3194509	3194514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_010524	GCG	2	6	3194515	3194520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_010524	GGA	2	6	3194546	3194551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_010524	CG	3	6	3194608	3194613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_010524	GC	3	6	3194626	3194631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5617	NC_010524	GGCCG	2	10	3200499	3200508	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5618	NC_010524	CGG	2	6	3200562	3200567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_010524	CGA	2	6	3200571	3200576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_010524	GCG	2	6	3200583	3200588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_010524	GC	3	6	3200600	3200605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_010524	GAA	2	6	3200635	3200640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_010524	CAC	2	6	3200650	3200655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_010524	CGC	2	6	3200656	3200661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_010524	TCGA	2	8	3204145	3204152	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5626	NC_010524	GC	3	6	3209848	3209853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5627	NC_010524	TC	3	6	3209872	3209877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5628	NC_010524	GC	3	6	3214569	3214574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_010524	CAC	2	6	3214579	3214584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5630	NC_010524	CCCG	2	8	3218963	3218970	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5631	NC_010524	AAG	2	6	3218986	3218991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_010524	CGC	2	6	3220727	3220732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5633	NC_010524	GAG	2	6	3220759	3220764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_010524	GTT	2	6	3220768	3220773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5635	NC_010524	GGT	2	6	3223297	3223302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5636	NC_010524	GATG	2	8	3223313	3223320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5637	NC_010524	AAG	2	6	3224759	3224764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5653	NC_010524	TTA	2	6	3229070	3229075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_010524	C	6	6	3229080	3229085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5655	NC_010524	AGC	2	6	3229179	3229184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5663	NC_010524	GCC	2	6	3231748	3231753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5667	NC_010524	CG	4	8	3232295	3232302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5674	NC_010524	GATC	2	8	3240059	3240066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5675	NC_010524	CCCAC	2	10	3240069	3240078	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5676	NC_010524	CCCGG	2	10	3240127	3240136	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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5685	NC_010524	CCG	2	6	3250988	3250993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5880	NC_010524	GC	3	6	3308844	3308849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5881	NC_010524	GCA	2	6	3308952	3308957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5895	NC_010524	CAA	2	6	3310593	3310598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5896	NC_010524	CGAA	2	8	3310697	3310704	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6000	NC_010524	GCA	2	6	3317325	3317330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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