MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010524	CAC	2	6	2518197	2518202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_010524	GCG	2	6	2518234	2518239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_010524	GGTG	2	8	2518293	2518300	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_010524	GCG	2	6	2519855	2519860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_010524	CCG	2	6	2521193	2521198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_010524	GCA	2	6	2522835	2522840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_010524	CCG	2	6	2522847	2522852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_010524	GGCCC	2	10	2524282	2524291	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4509	NC_010524	TGC	2	6	2524316	2524321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_010524	CCG	2	6	2524380	2524385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_010524	TCG	2	6	2524404	2524409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_010524	CTG	2	6	2525085	2525090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_010524	G	6	6	2525163	2525168	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_010524	TGC	2	6	2525183	2525188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_010524	CGC	2	6	2525191	2525196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_010524	GTG	2	6	2525267	2525272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_010524	CCG	2	6	2525273	2525278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_010524	T	7	7	2525830	2525836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_010524	CGA	2	6	2525854	2525859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_010524	A	7	7	2525859	2525865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_010524	TC	3	6	2525924	2525929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_010524	TG	3	6	2526387	2526392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_010524	CGG	2	6	2526404	2526409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_010524	CGA	2	6	2526515	2526520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_010524	ACC	2	6	2526525	2526530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_010524	ACC	2	6	2526589	2526594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_010524	GGC	2	6	2526714	2526719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_010524	CAG	2	6	2526732	2526737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_010524	CCG	2	6	2527418	2527423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_010524	CA	3	6	2527462	2527467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_010524	CAC	2	6	2527537	2527542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_010524	ACTGC	2	10	2527587	2527596	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4533	NC_010524	T	6	6	2528297	2528302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_010524	ACC	2	6	2528332	2528337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_010524	CCGG	2	8	2528803	2528810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_010524	TGT	2	6	2530783	2530788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_010524	TGGC	2	8	2530791	2530798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4538	NC_010524	ACG	2	6	2538094	2538099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_010524	CGA	2	6	2538124	2538129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_010524	AGC	2	6	2538146	2538151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_010524	CCA	2	6	2538216	2538221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_010524	CGGG	2	8	2538242	2538249	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_010524	ACC	2	6	2538274	2538279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_010524	AAC	2	6	2538289	2538294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_010524	CAGG	2	8	2538845	2538852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_010524	CGG	2	6	2538956	2538961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_010524	CCT	2	6	2539021	2539026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_010524	CAGAT	2	10	2539995	2540004	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4549	NC_010524	T	7	7	2542767	2542773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_010524	GAG	2	6	2542875	2542880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_010524	GCC	2	6	2542887	2542892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_010524	CCG	2	6	2542899	2542904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_010524	CA	3	6	2542949	2542954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_010524	TCC	2	6	2543030	2543035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_010524	TCGG	2	8	2543118	2543125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_010524	CAC	2	6	2543190	2543195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_010524	TCG	2	6	2543313	2543318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_010524	CCT	2	6	2543321	2543326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_010524	CGA	2	6	2543356	2543361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_010524	TCT	2	6	2543420	2543425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_010524	AGC	2	6	2543571	2543576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_010524	GCC	2	6	2546398	2546403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_010524	AACC	2	8	2546417	2546424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_010524	GAA	2	6	2546450	2546455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_010524	ACC	2	6	2546467	2546472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_010524	CAACA	2	10	2546506	2546515	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4567	NC_010524	ATA	4	12	2546567	2546578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_010524	ATG	2	6	2548411	2548416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_010524	ACA	2	6	2551445	2551450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_010524	TTC	2	6	2554120	2554125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_010524	GGC	2	6	2555094	2555099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_010524	AAC	2	6	2556803	2556808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_010524	C	6	6	2556819	2556824	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4574	NC_010524	C	6	6	2556826	2556831	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4575	NC_010524	GCG	2	6	2556891	2556896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_010524	T	6	6	2556917	2556922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_010524	GCT	2	6	2557615	2557620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_010524	GTT	2	6	2557626	2557631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_010524	TTC	2	6	2557642	2557647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_010524	CAA	2	6	2557882	2557887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_010524	TCA	2	6	2557911	2557916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_010524	CGG	2	6	2557927	2557932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_010524	GGA	2	6	2558007	2558012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_010524	GGAA	2	8	2558048	2558055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_010524	CGG	2	6	2558074	2558079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_010524	TAAT	2	8	2558090	2558097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_010524	TCAG	2	8	2558127	2558134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4588	NC_010524	TGA	2	6	2558182	2558187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_010524	TCTT	2	8	2558553	2558560	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4590	NC_010524	CTTGGC	2	12	2558597	2558608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_010524	CAGA	2	8	2558614	2558621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_010524	AAGC	2	8	2558623	2558630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4593	NC_010524	GGT	2	6	2558634	2558639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_010524	CCA	2	6	2558672	2558677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_010524	GTT	2	6	2558702	2558707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_010524	ACGCG	2	10	2559716	2559725	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4597	NC_010524	GC	3	6	2562756	2562761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_010524	GCG	2	6	2563647	2563652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_010524	CACC	2	8	2564883	2564890	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4600	NC_010524	TGG	3	9	2565495	2565503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_010524	CGA	2	6	2565579	2565584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_010524	AAT	2	6	2565608	2565613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_010524	GAACG	2	10	2568414	2568423	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4604	NC_010524	GCG	2	6	2568439	2568444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_010524	GCCC	2	8	2568448	2568455	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4606	NC_010524	GCG	2	6	2569012	2569017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_010524	CTG	2	6	2569025	2569030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_010524	A	6	6	2569076	2569081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_010524	CGGCC	2	10	2569112	2569121	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4610	NC_010524	CGGG	2	8	2570105	2570112	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_010524	AGG	2	6	2572368	2572373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_010524	CCG	2	6	2572449	2572454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_010524	CGC	2	6	2573449	2573454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_010524	AGCA	2	8	2573464	2573471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4615	NC_010524	CGG	2	6	2573498	2573503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_010524	CACG	2	8	2573596	2573603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_010524	A	6	6	2573657	2573662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_010524	TCTGA	2	10	2574546	2574555	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4619	NC_010524	GATCC	2	10	2574621	2574630	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4620	NC_010524	TAG	2	6	2574652	2574657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_010524	GAG	2	6	2574674	2574679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_010524	AC	3	6	2577495	2577500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_010524	GGC	2	6	2583945	2583950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_010524	GACG	2	8	2584968	2584975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_010524	CA	4	8	2586293	2586300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_010524	GA	3	6	2586313	2586318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_010524	CG	3	6	2586365	2586370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_010524	CGG	2	6	2587771	2587776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_010524	GCTT	2	8	2587867	2587874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4630	NC_010524	GGC	2	6	2590358	2590363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_010524	CTG	2	6	2590555	2590560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_010524	ACGG	2	8	2590599	2590606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4633	NC_010524	CTG	2	6	2590632	2590637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_010524	GCG	3	9	2590664	2590672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4636	NC_010524	GC	3	6	2593701	2593706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4637	NC_010524	CGG	2	6	2593707	2593712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4666	NC_010524	GGTC	2	8	2616354	2616361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4667	NC_010524	GTGG	2	8	2616439	2616446	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4763	NC_010524	GGC	2	6	2681922	2681927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4764	NC_010524	GC	3	6	2681933	2681938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4765	NC_010524	TTG	2	6	2684123	2684128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4775	NC_010524	CGG	3	9	2693147	2693155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4863	NC_010524	ACCTG	2	10	2751211	2751220	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4867	NC_010524	CCG	2	6	2752707	2752712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4868	NC_010524	CGG	2	6	2752959	2752964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4873	NC_010524	GATC	2	8	2754174	2754181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4874	NC_010524	CCACG	2	10	2754249	2754258	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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4878	NC_010524	CAA	3	9	2755944	2755952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4879	NC_010524	TCC	2	6	2756046	2756051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4880	NC_010524	CGG	2	6	2756097	2756102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4881	NC_010524	CGGG	2	8	2756117	2756124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4882	NC_010524	C	6	6	2756133	2756138	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4883	NC_010524	GATG	2	8	2756165	2756172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4884	NC_010524	TGCCC	2	10	2756190	2756199	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4885	NC_010524	GTC	2	6	2756207	2756212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4886	NC_010524	CGA	2	6	2756216	2756221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4888	NC_010524	AC	3	6	2757815	2757820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4889	NC_010524	T	6	6	2757843	2757848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4890	NC_010524	GGC	2	6	2760050	2760055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4891	NC_010524	CGC	2	6	2760070	2760075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4892	NC_010524	TTTCT	2	10	2760759	2760768	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4894	NC_010524	GGC	2	6	2763195	2763200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4992	NC_010524	CATC	2	8	2808261	2808268	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5000	NC_010524	CGGTG	2	10	2813621	2813630	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

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