MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 7273

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009513	AATA	2	8	1030461	1030468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_009513	TAAA	2	8	1030493	1030500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_009513	T	7	7	1030519	1030525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_009513	ATG	2	6	1030639	1030644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_009513	GTT	2	6	1030666	1030671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_009513	T	6	6	1030690	1030695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_009513	A	6	6	1030715	1030720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_009513	A	6	6	1030724	1030729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_009513	AGA	2	6	1031098	1031103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_009513	TAC	2	6	1031148	1031153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_009513	GTC	2	6	1031182	1031187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_009513	AACC	2	8	1031262	1031269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_009513	TTAG	2	8	1031293	1031300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_009513	TAC	2	6	1031334	1031339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_009513	CTTT	2	8	1031345	1031352	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_009513	TTG	2	6	1031353	1031358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_009513	TAA	2	6	1031361	1031366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_009513	ACC	2	6	1031388	1031393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_009513	T	6	6	1031474	1031479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_009513	TTA	2	6	1031486	1031491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_009513	CAAT	2	8	1031496	1031503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_009513	ATG	2	6	1031518	1031523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_009513	AGTT	2	8	1031600	1031607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_009513	AT	3	6	1031616	1031621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_009513	TATTT	2	10	1031713	1031722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_009513	AAC	2	6	1031768	1031773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3530	NC_009513	ATT	2	6	1032001	1032006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_009513	ATTT	2	8	1032068	1032075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_009513	ATCAA	2	10	1032087	1032096	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3533	NC_009513	A	7	7	1032139	1032145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_009513	GAA	2	6	1032214	1032219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_009513	AAT	2	6	1032221	1032226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_009513	TTA	2	6	1032233	1032238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3538	NC_009513	AAT	2	6	1032618	1032623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_009513	AAT	2	6	1032634	1032639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_009513	ATA	2	6	1032643	1032648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_009513	A	7	7	1032652	1032658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_009513	GTG	2	6	1032673	1032678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_009513	TTA	2	6	1032704	1032709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_009513	A	6	6	1032758	1032763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_009513	TA	3	6	1032794	1032799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_009513	A	6	6	1032799	1032804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_009513	TA	3	6	1032863	1032868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_009513	GTA	2	6	1033332	1033337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3553	NC_009513	TAAA	2	8	1033478	1033485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_009513	TAAT	2	8	1033508	1033515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_009513	TTA	2	6	1034508	1034513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3557	NC_009513	ATTAA	2	10	1034685	1034694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_009513	TA	3	6	1034695	1034700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_009513	ATC	2	6	1034714	1034719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3561	NC_009513	T	6	6	1035404	1035409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_009513	ATC	2	6	1035463	1035468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_009513	GAG	2	6	1035486	1035491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_009513	ATT	2	6	1035864	1035869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_009513	TTA	2	6	1035903	1035908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_009513	T	6	6	1035918	1035923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_009513	TAA	2	6	1035925	1035930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_009513	A	7	7	1035934	1035940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_009513	TACT	2	8	1035954	1035961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3581	NC_009513	A	7	7	1036464	1036470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3591	NC_009513	T	6	6	1036941	1036946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_009513	A	6	6	1037002	1037007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3597	NC_009513	GTA	2	6	1044596	1044601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3601	NC_009513	AT	3	6	1046363	1046368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_009513	AATGAT	2	12	1046373	1046384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_009513	A	7	7	1046858	1046864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_009513	GAT	2	6	1046887	1046892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_009513	ATT	2	6	1046925	1046930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_009513	TTAAA	2	10	1046957	1046966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3610	NC_009513	TTTC	2	8	1047121	1047128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3616	NC_009513	AT	3	6	1048351	1048356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_009513	ATGC	2	8	1048394	1048401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_009513	TAC	2	6	1048439	1048444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3620	NC_009513	T	6	6	1048492	1048497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_009513	A	6	6	1048518	1048523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_009513	AATA	2	8	1048584	1048591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_009513	TAG	2	6	1049258	1049263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_009513	TTTTA	2	10	1050039	1050048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_009513	CTA	2	6	1050139	1050144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3627	NC_009513	GTT	2	6	1050183	1050188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_009513	ATT	2	6	1050206	1050211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_009513	TGT	2	6	1050311	1050316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_009513	A	6	6	1050328	1050333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_009513	GAA	2	6	1051259	1051264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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