MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 11167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009004	TAA	2	6	2310937	2310942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_009004	TCC	2	6	2311331	2311336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_009004	CAT	2	6	2313262	2313267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_009004	AATG	2	8	2313274	2313281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_009004	CCT	2	6	2313516	2313521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10006	NC_009004	AT	3	6	2313557	2313562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_009004	CAA	3	9	2313597	2313605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_009004	TCTT	2	8	2313613	2313620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10009	NC_009004	TTTTTA	2	12	2313711	2313722	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_009004	TTG	2	6	2313726	2313731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_009004	TAAAA	2	10	2313772	2313781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_009004	A	6	6	2313778	2313783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_009004	TGATTT	2	12	2314469	2314480	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_009004	AT	3	6	2316516	2316521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_009004	TAT	2	6	2316545	2316550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_009004	T	6	6	2316670	2316675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_009004	A	7	7	2316680	2316686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_009004	TAT	2	6	2317808	2317813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_009004	TAA	2	6	2317855	2317860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_009004	AAT	2	6	2317861	2317866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_009004	TGTC	2	8	2317885	2317892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10022	NC_009004	ACC	2	6	2317940	2317945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_009004	T	6	6	2317960	2317965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_009004	ACG	2	6	2318040	2318045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_009004	T	6	6	2318680	2318685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_009004	AAAAT	2	10	2318693	2318702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_009004	GT	3	6	2319359	2319364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_009004	T	6	6	2319371	2319376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_009004	ATG	2	6	2319697	2319702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_009004	T	6	6	2319709	2319714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_009004	AAT	2	6	2319717	2319722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_009004	CAG	2	6	2319737	2319742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_009004	CCT	2	6	2320031	2320036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_009004	A	7	7	2320115	2320121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_009004	ATT	2	6	2320923	2320928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_009004	TAA	3	9	2321311	2321319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_009004	A	6	6	2321340	2321345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_009004	TCC	2	6	2321757	2321762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_009004	CTC	2	6	2323699	2323704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_009004	CTA	2	6	2324025	2324030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_009004	CGG	2	6	2324031	2324036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_009004	ATA	2	6	2324083	2324088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_009004	TCC	2	6	2324982	2324987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_009004	TCCTT	2	10	2325926	2325935	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10045	NC_009004	CTC	2	6	2326893	2326898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_009004	GT	3	6	2326967	2326972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_009004	TCTAT	2	10	2327019	2327028	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10048	NC_009004	T	7	7	2327064	2327070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_009004	TAAA	2	8	2327109	2327116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_009004	TA	3	6	2327207	2327212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_009004	GGA	2	6	2327213	2327218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_009004	T	9	9	2327614	2327622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_009004	T	6	6	2330423	2330428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_009004	ATC	2	6	2330471	2330476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_009004	T	7	7	2330482	2330488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_009004	ATA	2	6	2330489	2330494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_009004	TATT	2	8	2331072	2331079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_009004	T	6	6	2331078	2331083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_009004	ATA	2	6	2331173	2331178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_009004	TTA	2	6	2331179	2331184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_009004	AAGAA	2	10	2331224	2331233	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_009004	ATT	2	6	2331480	2331485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_009004	TTA	2	6	2331504	2331509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_009004	ATT	2	6	2331741	2331746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_009004	ACT	2	6	2333626	2333631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_009004	TCT	2	6	2333638	2333643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_009004	T	8	8	2333666	2333673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_009004	T	6	6	2335928	2335933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_009004	TACT	2	8	2335941	2335948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10070	NC_009004	T	8	8	2335989	2335996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_009004	TAT	2	6	2336107	2336112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_009004	TAT	2	6	2336183	2336188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_009004	AATA	2	8	2336201	2336208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_009004	ATC	2	6	2336209	2336214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_009004	TAAATT	2	12	2336257	2336268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_009004	C	6	6	2337386	2337391	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10077	NC_009004	TAA	2	6	2337393	2337398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_009004	TAT	2	6	2337400	2337405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_009004	A	7	7	2337409	2337415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_009004	TAAT	2	8	2337416	2337423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_009004	TA	3	6	2337431	2337436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_009004	ATT	2	6	2337437	2337442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_009004	TTA	2	6	2337934	2337939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_009004	AAG	2	6	2337949	2337954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_009004	AAT	2	6	2338980	2338985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_009004	T	8	8	2338994	2339001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_009004	ATTGG	2	10	2339026	2339035	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_009004	T	6	6	2339051	2339056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_009004	TTCGT	2	10	2339062	2339071	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10090	NC_009004	TTC	2	6	2339111	2339116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_009004	TAG	2	6	2339139	2339144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10093	NC_009004	AAG	2	6	2339166	2339171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_009004	ATT	2	6	2339223	2339228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_009004	T	7	7	2339227	2339233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_009004	ACG	2	6	2339298	2339303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_009004	CCT	2	6	2339333	2339338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10098	NC_009004	GGTT	2	8	2339364	2339371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_009004	GTT	2	6	2339400	2339405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_009004	CTT	2	6	2339436	2339441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_009004	GTG	2	6	2339473	2339478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_009004	TCT	2	6	2339489	2339494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_009004	AGT	2	6	2339595	2339600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_009004	T	6	6	2339616	2339621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_009004	GTT	2	6	2339663	2339668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_009004	GT	3	6	2339704	2339709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_009004	TTA	2	6	2339752	2339757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_009004	AGT	2	6	2339780	2339785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10110	NC_009004	TGT	2	6	2339886	2339891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_009004	CAC	2	6	2339990	2339995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_009004	T	6	6	2340080	2340085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_009004	AAG	2	6	2340110	2340115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_009004	ATT	2	6	2340122	2340127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_009004	TTCG	2	8	2340293	2340300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10116	NC_009004	AAT	2	6	2340322	2340327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_009004	C	7	7	2340332	2340338	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10118	NC_009004	TTTTAG	2	12	2340366	2340377	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_009004	ATA	2	6	2340397	2340402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_009004	CTT	2	6	2340458	2340463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_009004	TAG	2	6	2342033	2342038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_009004	T	6	6	2342070	2342075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_009004	GAA	2	6	2342145	2342150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_009004	CTT	3	9	2342165	2342173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_009004	TCC	2	6	2343475	2343480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10126	NC_009004	TA	3	6	2343502	2343507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_009004	AAT	2	6	2343518	2343523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_009004	ATT	2	6	2343538	2343543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_009004	TA	3	6	2343848	2343853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_009004	CCT	2	6	2343862	2343867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10131	NC_009004	TCCT	2	8	2345320	2345327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10132	NC_009004	A	7	7	2347284	2347290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_009004	T	6	6	2347308	2347313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10251	NC_009004	GA	3	6	2373738	2373743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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