MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus gasseri ATCC 33323 chromosome

Total Repeats: 5649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008530	TAT	2	6	5	10	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008530	T	6	6	12	17	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008530	GTTA	2	8	36	43	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008530	TAA	2	6	1501	1506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008530	TTC	2	6	1519	1524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008530	ACT	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008530	CTA	3	9	1603	1611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008530	AT	3	6	1627	1632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008530	TAAA	2	8	1636	1643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008530	AGG	2	6	1669	1674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008530	T	7	7	2842	2848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008530	TTG	2	6	2850	2855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008530	A	6	6	2938	2943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008530	A	7	7	2977	2983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008530	TAA	2	6	2989	2994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008530	A	6	6	3029	3034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008530	AT	3	6	3052	3057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008530	AGA	2	6	3079	3084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008530	A	7	7	8840	8846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008530	TAA	3	9	8863	8871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008530	T	7	7	8914	8920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008530	ATT	2	6	8954	8959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008530	AGG	2	6	9005	9010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008530	ATT	2	6	9015	9020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008530	ATA	2	6	10143	10148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008530	TATTT	2	10	10174	10183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008530	T	6	6	10181	10186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008530	TAT	2	6	10191	10196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008530	AAG	2	6	10199	10204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008530	AAT	2	6	10924	10929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008530	AAT	2	6	10936	10941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008530	CTT	2	6	10981	10986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008530	T	6	6	11014	11019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008530	GAAT	2	8	11021	11028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008530	TAA	2	6	11066	11071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008530	TGCT	2	8	11140	11147	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008530	GAT	2	6	11155	11160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008530	AGCA	2	8	11162	11169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008530	T	6	6	11170	11175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008530	TATAA	2	10	11180	11189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008530	ATG	2	6	11191	11196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008530	T	6	6	11206	11211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008530	AGGA	2	8	11231	11238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008530	ATTA	2	8	15128	15135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008530	AAT	2	6	15173	15178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008530	A	6	6	16107	16112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008530	T	6	6	17348	17353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008530	CAA	2	6	17393	17398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008530	A	6	6	17397	17402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008530	CTT	2	6	17419	17424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008530	A	7	7	19483	19489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008530	GT	3	6	19490	19495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008530	AC	3	6	19514	19519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008530	TA	3	6	20271	20276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008530	A	6	6	20336	20341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008530	ATA	2	6	20360	20365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008530	ATG	2	6	20433	20438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008530	T	6	6	20469	20474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008530	TTAA	2	8	20485	20492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008530	ATT	2	6	20503	20508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008530	T	6	6	20531	20536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008530	CTTTG	2	10	20537	20546	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008530	T	6	6	20584	20589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008530	CTT	2	6	20636	20641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008530	TAT	2	6	20651	20656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008530	T	6	6	20658	20663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008530	TAAT	2	8	20687	20694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008530	TTA	2	6	20695	20700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008530	GTA	2	6	20735	20740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008530	TTAT	2	8	21386	21393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008530	A	6	6	21440	21445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008530	CTA	2	6	21446	21451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008530	AATAGC	2	12	21460	21471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008530	CAT	2	6	21484	21489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008530	TAAT	2	8	21493	21500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008530	T	6	6	21554	21559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008530	TGTT	2	8	21645	21652	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008530	AT	3	6	21666	21671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008530	AAAT	2	8	21686	21693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008530	AT	4	8	21720	21727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008530	TTG	2	6	22498	22503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008530	ATC	2	6	23580	23585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008530	TAG	2	6	23594	23599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008530	ATG	2	6	23651	23656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008530	T	7	7	23719	23725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008530	ATA	2	6	23745	23750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008530	AAAT	2	8	23759	23766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008530	TGT	2	6	24972	24977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008530	TTTAAA	2	12	25018	25029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008530	T	6	6	25053	25058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008530	GCTAA	2	10	25062	25071	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008530	AG	3	6	25089	25094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008530	AGA	2	6	26619	26624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008530	AT	3	6	28238	28243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008530	AGA	2	6	28267	28272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008530	A	6	6	28302	28307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008530	CTT	2	6	28525	28530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008530	A	6	6	28533	28538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008530	GA	3	6	28576	28581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008530	TTA	2	6	28598	28603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008530	ATAA	2	8	28636	28643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008530	T	6	6	28732	28737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008530	ATTA	2	8	28738	28745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008530	T	7	7	28820	28826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008530	TAA	2	6	28843	28848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008530	CTAT	2	8	28861	28868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008530	ATTA	2	8	30814	30821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008530	CCT	2	6	31781	31786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008530	T	6	6	31795	31800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008530	AT	3	6	31808	31813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008530	TTA	2	6	31852	31857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008530	A	6	6	31880	31885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008530	TTA	2	6	31914	31919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008530	AGCT	3	12	32011	32022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008530	TAC	2	6	32230	32235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008530	AGG	2	6	32248	32253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008530	TC	4	8	32553	32560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008530	AATG	2	8	32622	32629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008530	ATA	2	6	32658	32663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008530	TCT	2	6	33529	33534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008530	T	6	6	33534	33539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008530	ATA	2	6	36435	36440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008530	ATT	2	6	36441	36446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008530	GGA	2	6	36471	36476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008530	AG	3	6	36477	36482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008530	TA	3	6	37680	37685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008530	TAT	2	6	37690	37695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008530	TTAA	2	8	37709	37716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008530	AAG	2	6	37745	37750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008530	TAA	2	6	37756	37761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008530	AGC	2	6	38837	38842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008530	GCT	2	6	38850	38855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008530	AT	3	6	38896	38901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008530	CAATA	2	10	38945	38954	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008530	A	7	7	38965	38971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008530	TGT	2	6	38982	38987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008530	TAA	2	6	39012	39017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008530	TCTT	2	8	39031	39038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008530	GAAA	2	8	39054	39061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008530	A	6	6	40410	40415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008530	A	6	6	42277	42282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008530	T	6	6	42307	42312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008530	AAT	2	6	42319	42324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008530	TAT	2	6	43386	43391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008530	TAA	2	6	43406	43411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008530	T	7	7	43427	43433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008530	A	6	6	43533	43538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008530	CTA	2	6	43554	43559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008530	TTA	2	6	43565	43570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008530	TA	3	6	46226	46231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008530	T	6	6	46248	46253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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