MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 10158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008526	AC	3	6	129335	129340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_008526	TA	3	6	129341	129346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008526	CTG	2	6	129401	129406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_008526	A	6	6	131689	131694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008526	T	6	6	131718	131723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008526	TCAAA	2	10	131820	131829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
507	NC_008526	TGAA	2	8	131839	131846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008526	CAG	2	6	131918	131923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_008526	GATG	2	8	132608	132615	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008526	AAG	2	6	132641	132646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008526	GAA	2	6	132690	132695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008526	TGA	2	6	132813	132818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008526	ATTA	2	8	132824	132831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008526	ATA	2	6	132833	132838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008526	GTT	2	6	132851	132856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008526	A	6	6	132858	132863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008526	TTAG	2	8	132874	132881	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008526	TGAC	2	8	134300	134307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_008526	TGT	2	6	134327	134332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008526	TCAAG	2	10	134429	134438	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
521	NC_008526	GAT	2	6	134445	134450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008526	TAGC	2	8	135517	135524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
523	NC_008526	GTC	2	6	135562	135567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_008526	ATT	2	6	136386	136391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008526	TCC	2	6	137968	137973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_008526	A	6	6	137975	137980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008526	TGGT	2	8	137988	137995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008526	A	6	6	138018	138023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008526	TCA	3	9	138028	138036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_008526	GTC	2	6	138043	138048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_008526	TTA	2	6	138066	138071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008526	GAAA	2	8	138121	138128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008526	A	6	6	138188	138193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008526	TGTT	2	8	138200	138207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008526	CAG	2	6	138211	138216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_008526	TGA	2	6	138243	138248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008526	CAGA	2	8	138284	138291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_008526	GGC	2	6	138416	138421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_008526	T	6	6	138559	138564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008526	TGG	2	6	138586	138591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008526	AAC	2	6	138616	138621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_008526	CTT	2	6	138622	138627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_008526	GCT	2	6	138629	138634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_008526	AAG	2	6	138635	138640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008526	ATAG	2	8	138653	138660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008526	TAA	2	6	138669	138674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008526	TGT	2	6	138713	138718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008526	TA	3	6	138729	138734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008526	ATTC	2	8	138780	138787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_008526	TCA	2	6	140214	140219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_008526	TTG	2	6	140844	140849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008526	CAA	2	6	140922	140927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_008526	A	6	6	140926	140931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008526	AAAT	2	8	140963	140970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008526	CCT	2	6	141997	142002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_008526	TCGCAG	2	12	142012	142023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_008526	ATTA	2	8	143312	143319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008526	TCG	2	6	143366	143371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_008526	CTG	2	6	143402	143407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_008526	AGA	2	6	143428	143433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008526	TTAA	2	8	143452	143459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008526	AT	3	6	143888	143893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008526	TAT	2	6	145000	145005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008526	A	6	6	145065	145070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008526	AAG	2	6	145083	145088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008526	T	6	6	146774	146779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008526	GATT	2	8	146788	146795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008526	CCT	2	6	147103	147108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_008526	TGA	2	6	147164	147169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008526	GTGA	2	8	147246	147253	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008526	AT	3	6	147790	147795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008526	ACA	2	6	147800	147805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_008526	AT	3	6	147831	147836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008526	GGT	2	6	147864	147869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008526	GAA	2	6	148871	148876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008526	CGC	2	6	148904	148909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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578	NC_008526	CTT	2	6	149726	149731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008526	TGT	2	6	149744	149749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008526	TCA	2	6	149754	149759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_008526	A	8	8	149823	149830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008526	GTC	2	6	149860	149865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_008526	AAG	2	6	151394	151399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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585	NC_008526	CTT	2	6	151458	151463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008526	GCCT	2	8	151853	151860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
587	NC_008526	TAT	2	6	151861	151866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008526	GTCAT	2	10	151876	151885	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
589	NC_008526	TTAC	2	8	152892	152899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_008526	AAC	2	6	153432	153437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_008526	T	7	7	153484	153490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008526	GTGATG	2	12	154211	154222	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008526	ATT	2	6	154294	154299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_008526	T	6	6	154430	154435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008526	A	6	6	154454	154459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008526	TA	3	6	154481	154486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_008526	T	8	8	154529	154536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008526	AGC	2	6	157790	157795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008526	TCA	2	6	157828	157833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_008526	ACA	2	6	157837	157842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_008526	A	6	6	157882	157887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_008526	ACAT	2	8	158692	158699	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
607	NC_008526	GAATAA	2	12	159856	159867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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609	NC_008526	AAG	2	6	160052	160057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008526	GAC	2	6	161851	161856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008526	GAGGC	2	10	161890	161899	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
612	NC_008526	CAC	2	6	162891	162896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_008526	A	7	7	162906	162912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008526	T	6	6	162929	162934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008526	TCC	2	6	163300	163305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_008526	CAG	2	6	163346	163351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_008526	TTA	2	6	163362	163367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008526	ATG	2	6	163379	163384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008526	AAT	2	6	163392	163397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008526	AGG	2	6	164861	164866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008526	A	7	7	164867	164873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008526	A	6	6	166087	166092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008526	TC	3	6	166096	166101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_008526	GA	3	6	166110	166115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008526	CCT	2	6	167000	167005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_008526	CTG	2	6	167137	167142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_008526	AGA	2	6	167167	167172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008526	GTT	2	6	167954	167959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008526	A	7	7	168292	168298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008526	T	7	7	168319	168325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008526	GTC	2	6	168368	168373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_008526	TGA	2	6	168396	168401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008526	GAGC	2	8	168437	168444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_008526	GCC	2	6	168500	168505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_008526	CAC	2	6	168610	168615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_008526	GCA	2	6	168622	168627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_008526	CCA	2	6	168634	168639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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639	NC_008526	CAT	2	6	168767	168772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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