MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 8162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008011	TAT	2	6	543639	543644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3003	NC_008011	TAA	2	6	543656	543661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008011	AAT	2	6	544037	544042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_008011	AT	6	12	545680	545691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3009	NC_008011	TAT	2	6	546689	546694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_008011	TTA	2	6	546812	546817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_008011	AT	7	14	548492	548505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008011	T	6	6	549935	549940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_008011	T	6	6	549966	549971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_008011	TA	3	6	549987	549992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008011	ATA	2	6	550566	550571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_008011	A	6	6	550640	550645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008011	CAT	2	6	552003	552008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3019	NC_008011	ACT	2	6	552044	552049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3021	NC_008011	GAT	2	6	552077	552082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3023	NC_008011	A	6	6	553528	553533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3025	NC_008011	TAT	2	6	555083	555088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008011	AT	3	6	555143	555148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3041	NC_008011	ATT	2	6	555529	555534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3043	NC_008011	TAA	2	6	556190	556195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3063	NC_008011	A	6	6	562242	562247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3073	NC_008011	A	6	6	562378	562383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_008011	CT	3	6	565324	565329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_008011	TTTA	3	12	565330	565341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_008011	CTTT	2	8	565343	565350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3092	NC_008011	TACAA	2	10	565463	565472	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3098	NC_008011	AT	3	6	565657	565662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_008011	CATA	2	8	565690	565697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3102	NC_008011	TAC	2	6	565791	565796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3115	NC_008011	AT	3	6	566130	566135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3118	NC_008011	ATA	2	6	566190	566195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3133	NC_008011	TCTA	2	8	572769	572776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3134	NC_008011	A	7	7	572783	572789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3136	NC_008011	TA	3	6	572851	572856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_008011	ATTAT	2	10	572857	572866	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3418	NC_008011	TA	3	6	614709	614714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3419	NC_008011	A	6	6	614718	614723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3420	NC_008011	TTA	2	6	616372	616377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3421	NC_008011	ATA	2	6	616434	616439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3423	NC_008011	A	7	7	616447	616453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_008011	TAGT	3	12	628921	628932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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