MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 8162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008011	TTA	2	6	1243712	1243717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_008011	GGAACA	2	12	1243790	1243801	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7003	NC_008011	TATT	2	8	1243846	1243853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_008011	TAGAG	2	10	1243868	1243877	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_008011	ATTT	2	8	1243919	1243926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_008011	T	6	6	1243924	1243929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_008011	T	6	6	1243933	1243938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_008011	TA	3	6	1243942	1243947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_008011	A	7	7	1243947	1243953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_008011	GTTA	2	8	1243954	1243961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_008011	GATA	2	8	1243966	1243973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_008011	TATTAA	2	12	1244011	1244022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_008011	T	7	7	1244029	1244035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_008011	ATA	3	9	1244051	1244059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_008011	TGT	2	6	1244970	1244975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_008011	TAA	2	6	1244976	1244981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_008011	T	6	6	1244984	1244989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_008011	AAT	2	6	1244996	1245001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_008011	AGTTA	2	10	1245012	1245021	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_008011	TTA	2	6	1245032	1245037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_008011	TAT	2	6	1245050	1245055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_008011	AT	3	6	1245071	1245076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_008011	TAA	2	6	1245103	1245108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_008011	GAT	2	6	1245141	1245146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_008011	A	8	8	1245168	1245175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_008011	TATT	2	8	1245185	1245192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_008011	AGT	2	6	1245206	1245211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_008011	T	7	7	1245859	1245865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_008011	AGTA	2	8	1245901	1245908	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_008011	AAG	2	6	1245920	1245925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_008011	AGT	2	6	1245988	1245993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_008011	AAC	2	6	1246045	1246050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_008011	ATTA	2	8	1246063	1246070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_008011	ATTA	2	8	1246076	1246083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_008011	AGT	2	6	1246094	1246099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_008011	AAT	2	6	1246109	1246114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_008011	ATA	2	6	1246136	1246141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_008011	ATA	2	6	1246160	1246165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_008011	T	7	7	1247172	1247178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_008011	T	6	6	1247190	1247195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_008011	TAG	2	6	1250910	1250915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_008011	TTG	2	6	1250917	1250922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_008011	A	6	6	1250928	1250933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_008011	ATT	2	6	1250960	1250965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_008011	AATT	2	8	1250967	1250974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_008011	T	6	6	1250984	1250989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_008011	AGAT	2	8	1250999	1251006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_008011	ATA	2	6	1251013	1251018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_008011	ATGA	2	8	1251041	1251048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_008011	AT	3	6	1251053	1251058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_008011	TTA	2	6	1251061	1251066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_008011	AT	3	6	1251087	1251092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_008011	GTTATA	2	12	1251115	1251126	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_008011	AGA	3	9	1251146	1251154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_008011	TTA	2	6	1251158	1251163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_008011	CTT	2	6	1253316	1253321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_008011	GGAA	2	8	1253346	1253353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_008011	TGA	2	6	1253432	1253437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_008011	ATT	2	6	1253449	1253454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_008011	GCT	2	6	1253481	1253486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_008011	TTTA	2	8	1253499	1253506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_008011	ATAA	2	8	1253529	1253536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_008011	A	6	6	1253543	1253548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_008011	T	7	7	1253549	1253555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_008011	TTTA	4	16	1253561	1253576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_008011	GAG	2	6	1253592	1253597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_008011	CCT	2	6	1254577	1254582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7068	NC_008011	TAG	2	6	1254596	1254601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_008011	ATT	2	6	1256230	1256235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_008011	GAT	2	6	1256282	1256287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_008011	AGA	2	6	1256288	1256293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_008011	CTA	2	6	1256321	1256326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_008011	ATT	2	6	1256344	1256349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_008011	CTG	2	6	1256409	1256414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_008011	CTAC	2	8	1256440	1256447	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7076	NC_008011	CTC	2	6	1259389	1259394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7077	NC_008011	TGAA	2	8	1259395	1259402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_008011	ATA	2	6	1259470	1259475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_008011	TAGA	2	8	1259500	1259507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_008011	AGT	2	6	1261374	1261379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7082	NC_008011	GGC	2	6	1261404	1261409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_008011	TAT	2	6	1261461	1261466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7085	NC_008011	TAC	2	6	1267557	1267562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7087	NC_008011	TAATT	2	10	1267653	1267662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_008011	T	9	9	1267674	1267682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_008011	AATG	2	8	1267690	1267697	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_008011	AAG	2	6	1267767	1267772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_008011	TTAAG	2	10	1267835	1267844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_008011	GTCC	2	8	1267909	1267916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7093	NC_008011	TAT	2	6	1267935	1267940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_008011	TAA	2	6	1267957	1267962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_008011	TAG	2	6	1268213	1268218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7097	NC_008011	T	8	8	1268309	1268316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_008011	ATA	3	9	1268322	1268330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_008011	AGT	2	6	1269207	1269212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_008011	TG	3	6	1269238	1269243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_008011	ATG	2	6	1271738	1271743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7103	NC_008011	ACTA	2	8	1271784	1271791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7104	NC_008011	ATTT	2	8	1271827	1271834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_008011	GTAG	2	8	1272329	1272336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_008011	GAA	2	6	1272353	1272358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_008011	TAT	2	6	1272364	1272369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_008011	TTA	2	6	1272379	1272384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_008011	GTAT	2	8	1272453	1272460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_008011	AGAT	2	8	1273902	1273909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_008011	CAT	2	6	1273922	1273927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_008011	AT	7	14	1273929	1273942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_008011	ACTA	2	8	1273960	1273967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7114	NC_008011	AT	3	6	1273989	1273994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_008011	TGT	2	6	1274008	1274013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_008011	TTA	2	6	1274014	1274019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_008011	ATT	2	6	1274035	1274040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_008011	T	6	6	1274039	1274044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_008011	ACA	2	6	1274056	1274061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_008011	AAT	2	6	1274074	1274079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_008011	T	6	6	1274103	1274108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_008011	TA	4	8	1274133	1274140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_008011	TAG	2	6	1274166	1274171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_008011	T	6	6	1274182	1274187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_008011	TAAA	2	8	1274190	1274197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_008011	AGT	3	9	1275659	1275667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_008011	CAT	2	6	1275668	1275673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_008011	TAA	2	6	1275680	1275685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_008011	TAA	2	6	1275690	1275695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_008011	TAT	2	6	1275701	1275706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_008011	TA	3	6	1275714	1275719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_008011	GAAAGG	2	12	1275735	1275746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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