MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 6487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006814	CTA	4	12	1509	1520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006814	AT	3	6	1526	1531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006814	AAG	2	6	1546	1551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006814	AGG	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006814	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006814	ACC	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_006814	GGT	2	6	2748	2753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006814	A	6	6	2783	2788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006814	T	6	6	2801	2806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006814	GT	3	6	2817	2822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006814	A	7	7	2839	2845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006814	TA	3	6	2906	2911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006814	A	6	6	8735	8740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006814	TAA	2	6	8773	8778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006814	A	6	6	8791	8796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006814	T	6	6	8828	8833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006814	AGG	2	6	8917	8922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006814	A	6	6	10070	10075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006814	GTA	2	6	10128	10133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006814	ATTTT	2	10	10143	10152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006814	T	6	6	10149	10154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006814	TAA	2	6	10183	10188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006814	ATG	2	6	10202	10207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006814	AGGA	2	8	10224	10231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006814	AGT	2	6	12738	12743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006814	T	7	7	14186	14192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006814	TA	3	6	14206	14211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006814	AAT	2	6	14292	14297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006814	GGA	2	6	14372	14377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006814	AAAT	2	8	15330	15337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006814	T	6	6	15353	15358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006814	T	7	7	15370	15376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006814	A	6	6	15426	15431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006814	T	6	6	16411	16416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006814	A	6	6	16435	16440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006814	A	7	7	16453	16459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006814	AC	3	6	17364	17369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006814	AAGA	2	8	17408	17415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006814	T	6	6	17429	17434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006814	GTA	2	6	17458	17463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006814	TTA	2	6	17485	17490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006814	ATC	2	6	17700	17705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006814	TTAG	2	8	17724	17731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006814	ATT	2	6	19310	19315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006814	AAT	2	6	19350	19355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006814	T	7	7	19395	19401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006814	A	6	6	19404	19409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006814	TAA	2	6	19438	19443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006814	TGT	2	6	19448	19453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006814	TGA	2	6	19454	19459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006814	ACA	2	6	19461	19466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006814	ATG	2	6	19511	19516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006814	GATT	2	8	19564	19571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006814	T	7	7	19615	19621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006814	ATG	2	6	19634	19639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006814	ATT	2	6	19662	19667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006814	AAT	2	6	19702	19707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006814	A	7	7	19760	19766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006814	TGAG	2	8	20475	20482	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006814	TAAT	2	8	20850	20857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006814	GTT	2	6	20873	20878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006814	TAA	2	6	20914	20919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006814	TGTA	2	8	20953	20960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006814	TAA	2	6	21020	21025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006814	A	6	6	21033	21038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006814	TTTTA	2	10	21060	21069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006814	A	6	6	21073	21078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006814	AAT	2	6	21081	21086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006814	AAT	2	6	21174	21179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006814	T	6	6	21200	21205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006814	A	7	7	21221	21227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006814	ATT	2	6	21265	21270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006814	ATT	2	6	21316	21321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006814	TCT	2	6	22282	22287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006814	ATC	2	6	22331	22336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006814	AAAT	2	8	22378	22385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006814	AGG	2	6	22394	22399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006814	TGTGT	2	10	24405	24414	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006814	A	6	6	24491	24496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006814	AGA	2	6	25462	25467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006814	A	6	6	25509	25514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006814	GAA	2	6	25531	25536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006814	A	7	7	25568	25574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006814	ATT	2	6	25892	25897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006814	CT	3	6	25901	25906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006814	T	6	6	25906	25911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006814	AG	3	6	25915	25920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006814	TTA	2	6	27203	27208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006814	A	6	6	27208	27213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006814	AT	3	6	27219	27224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006814	TAA	2	6	27265	27270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006814	GA	3	6	27288	27293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006814	T	7	7	27301	27307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006814	AAAT	2	8	27336	27343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006814	ATT	2	6	27368	27373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006814	TAT	2	6	27379	27384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006814	TAA	2	6	27390	27395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006814	AAAAT	2	10	27402	27411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006814	TAA	2	6	28077	28082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006814	T	7	7	28117	28123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006814	ATA	2	6	28220	28225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006814	GCA	2	6	28229	28234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006814	ATT	2	6	28235	28240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006814	GAAGA	2	10	28366	28375	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006814	CAT	2	6	28383	28388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006814	ATT	2	6	28414	28419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006814	TAA	2	6	28482	28487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006814	AAG	2	6	28526	28531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006814	GCT	2	6	28587	28592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006814	AGA	2	6	28601	28606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006814	A	7	7	28968	28974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006814	T	6	6	28989	28994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006814	ATA	2	6	29014	29019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006814	A	6	6	29019	29024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006814	T	6	6	29048	29053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006814	CAA	2	6	29167	29172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006814	TAC	2	6	29184	29189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006814	ATA	2	6	29191	29196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006814	T	6	6	29287	29292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006814	AGC	2	6	29315	29320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006814	A	6	6	29326	29331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006814	TGC	2	6	29337	29342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006814	AAT	2	6	30202	30207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006814	TTG	2	6	30254	30259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006814	GTTT	2	8	30266	30273	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006814	TTA	2	6	30319	30324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006814	AGG	2	6	30334	30339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006814	T	6	6	31775	31780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006814	A	6	6	31785	31790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006814	TAG	2	6	31842	31847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006814	TA	3	6	33224	33229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006814	TC	3	6	33266	33271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_006814	TAT	2	6	33279	33284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006814	T	6	6	35525	35530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006814	ATA	2	6	35594	35599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006814	TTC	2	6	35617	35622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006814	T	6	6	35624	35629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006814	TAT	2	6	37896	37901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006814	TATG	2	8	37919	37926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006814	TGG	2	6	37975	37980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006814	A	6	6	38024	38029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006814	T	7	7	38037	38043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006814	A	6	6	38066	38071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006814	ATT	2	6	39768	39773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006814	TCC	2	6	39793	39798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_006814	AAG	2	6	39815	39820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006814	TAA	2	6	39826	39831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006814	ACCA	2	8	39856	39863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_006814	TAA	2	6	39934	39939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006814	ATA	2	6	39950	39955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_006814	A	6	6	41517	41522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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