MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 5821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005362	ACC	2	6	501952	501957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_005362	TGA	2	6	502048	502053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_005362	CTTTT	2	10	502086	502095	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1504	NC_005362	AT	3	6	502136	502141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_005362	AGG	2	6	502181	502186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_005362	TAA	2	6	504168	504173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_005362	TGA	2	6	504198	504203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_005362	GTA	2	6	504221	504226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_005362	TAA	2	6	504240	504245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_005362	A	6	6	504244	504249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_005362	T	6	6	504261	504266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_005362	AAGA	2	8	504270	504277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_005362	A	6	6	505161	505166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_005362	AAT	2	6	505251	505256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_005362	AAT	2	6	505274	505279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_005362	CAATTT	2	12	505280	505291	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1517	NC_005362	AAT	2	6	505309	505314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_005362	TAT	2	6	505331	505336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_005362	ATT	2	6	505337	505342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_005362	ATAC	2	8	505426	505433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_005362	TAT	2	6	505461	505466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_005362	A	6	6	505481	505486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_005362	TAT	2	6	505487	505492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_005362	A	7	7	505496	505502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_005362	ATTA	2	8	505533	505540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_005362	ATT	2	6	505545	505550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_005362	A	6	6	505554	505559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_005362	TA	3	6	505566	505571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_005362	TAA	2	6	505580	505585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_005362	AGG	2	6	505598	505603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_005362	AGT	2	6	505620	505625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_005362	TCA	2	6	505635	505640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_005362	AATA	2	8	505654	505661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_005362	AAT	2	6	505673	505678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_005362	TTG	2	6	505690	505695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_005362	TCA	2	6	505703	505708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_005362	AGG	2	6	505709	505714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_005362	TTC	2	6	507494	507499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_005362	T	7	7	507520	507526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_005362	GAA	2	6	507587	507592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_005362	TGA	2	6	512681	512686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_005362	ATT	2	6	513743	513748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_005362	TTAA	2	8	513758	513765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_005362	T	6	6	514248	514253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_005362	T	7	7	514255	514261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_005362	GTAG	2	8	514314	514321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_005362	ATAAA	2	10	516899	516908	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_005362	GA	4	8	516922	516929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_005362	GTA	2	6	519276	519281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_005362	ATT	2	6	519304	519309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_005362	T	7	7	519316	519322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_005362	AG	3	6	519326	519331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_005362	AAAT	2	8	519390	519397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_005362	AACA	2	8	519410	519417	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_005362	GGT	2	6	519431	519436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_005362	T	6	6	519473	519478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_005362	GTTC	2	8	522153	522160	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_005362	AAG	2	6	522179	522184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_005362	AGG	2	6	522188	522193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_005362	A	6	6	523213	523218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_005362	T	6	6	523240	523245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_005362	AGTA	2	8	526233	526240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_005362	CTA	2	6	526244	526249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_005362	ATTT	2	8	526272	526279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_005362	TAA	2	6	526286	526291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_005362	ATAA	2	8	526607	526614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_005362	A	8	8	526613	526620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_005362	TAT	2	6	526657	526662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_005362	TCT	2	6	527101	527106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_005362	ATC	2	6	527151	527156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_005362	ATTT	2	8	527157	527164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_005362	T	7	7	527172	527178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_005362	T	6	6	528657	528662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_005362	TAT	2	6	528679	528684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_005362	AT	3	6	528683	528688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_005362	T	6	6	528705	528710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_005362	AAGC	2	8	540921	540928	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_005362	GCTT	2	8	540936	540943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_005362	T	6	6	540945	540950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_005362	ATT	2	6	540951	540956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_005362	ATA	2	6	540967	540972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_005362	TA	3	6	541016	541021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_005362	ACT	2	6	542262	542267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_005362	CAT	2	6	543173	543178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_005362	AAT	2	6	543245	543250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_005362	AAT	2	6	543271	543276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_005362	GGA	2	6	543281	543286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_005362	TTA	2	6	543728	543733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_005362	T	7	7	544113	544119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_005362	A	7	7	544124	544130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_005362	T	6	6	545292	545297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_005362	ATA	2	6	545321	545326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_005362	AAT	2	6	545333	545338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_005362	T	6	6	546468	546473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_005362	AT	3	6	546475	546480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_005362	TAT	2	6	549340	549345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_005362	A	7	7	549349	549355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_005362	TTA	2	6	549389	549394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_005362	T	6	6	552248	552253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_005362	TAAT	2	8	552257	552264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_005362	TAG	2	6	552266	552271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_005362	TA	3	6	556618	556623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_005362	TAA	2	6	557596	557601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_005362	TCC	2	6	557606	557611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_005362	TTAA	2	8	557645	557652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_005362	TAAT	2	8	557664	557671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_005362	AGT	2	6	558080	558085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_005362	T	6	6	558099	558104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_005362	AATTA	2	10	558167	558176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_005362	TTAA	2	8	558177	558184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_005362	AT	4	8	558198	558205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_005362	A	6	6	558235	558240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_005362	A	6	6	558288	558293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_005362	A	7	7	558298	558304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_005362	GAT	2	6	558325	558330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_005362	GA	4	8	558352	558359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_005362	A	6	6	558370	558375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_005362	ATATA	2	10	558402	558411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_005362	GTA	2	6	558432	558437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_005362	CAAA	2	8	558489	558496	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_005362	GCAA	2	8	558511	558518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_005362	AAAG	2	8	558536	558543	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_005362	GGC	2	6	558618	558623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_005362	CGAG	2	8	558643	558650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_005362	GAT	2	6	558659	558664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_005362	AGCG	2	8	558697	558704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_005362	AAC	2	6	558782	558787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_005362	TGGA	2	8	558834	558841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_005362	GGTAA	2	10	558863	558872	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_005362	ATG	2	6	558888	558893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_005362	GA	3	6	558906	558911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_005362	GCA	2	6	558960	558965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_005362	CGC	2	6	559007	559012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_005362	GTGA	2	8	559013	559020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_005362	GAA	2	6	559056	559061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_005362	GTA	2	6	559070	559075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_005362	AGA	2	6	559269	559274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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