MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 5821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005362	A	6	6	329073	329078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_005362	CCT	2	6	329079	329084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_005362	AAT	2	6	329113	329118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_005362	TTC	2	6	329185	329190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_005362	T	6	6	329217	329222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_005362	TCC	2	6	329754	329759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_005362	TA	3	6	329767	329772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_005362	TCA	2	6	330380	330385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_005362	TA	3	6	330435	330440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_005362	ATT	2	6	330444	330449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_005362	AC	3	6	330450	330455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_005362	TC	3	6	331707	331712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_005362	TAT	2	6	331721	331726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_005362	AATTG	2	10	331743	331752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_005362	AATA	2	8	332589	332596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_005362	T	6	6	332612	332617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_005362	T	7	7	332623	332629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_005362	A	7	7	332642	332648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_005362	TAT	2	6	332674	332679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_005362	AATTG	2	10	332690	332699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_005362	GAA	2	6	332964	332969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_005362	GAA	2	6	334016	334021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_005362	TAGA	2	8	334083	334090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_005362	GAT	2	6	334127	334132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_005362	TGA	2	6	334498	334503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_005362	A	6	6	334503	334508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_005362	A	6	6	334522	334527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_005362	A	8	8	334575	334582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_005362	AT	3	6	334585	334590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_005362	GTT	2	6	334617	334622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_005362	AGG	2	6	334649	334654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_005362	T	6	6	334702	334707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_005362	CAAGA	2	10	334709	334718	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1034	NC_005362	TAG	2	6	334730	334735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_005362	CAA	2	6	334774	334779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_005362	A	7	7	334778	334784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_005362	ACTG	2	8	334791	334798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_005362	ATTTA	2	10	334831	334840	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_005362	ACT	2	6	335231	335236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_005362	ATT	2	6	337998	338003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_005362	AAC	2	6	338006	338011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_005362	ATGT	2	8	338015	338022	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_005362	ATG	2	6	338035	338040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_005362	A	6	6	338999	339004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_005362	TTA	2	6	339138	339143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_005362	CAA	2	6	339155	339160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_005362	AGG	2	6	339163	339168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_005362	ATG	2	6	339210	339215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_005362	CAT	2	6	339243	339248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_005362	TAG	2	6	339304	339309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_005362	ATA	2	6	339313	339318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_005362	AGA	2	6	339328	339333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_005362	T	6	6	339858	339863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_005362	TTTA	2	8	339870	339877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_005362	GTT	2	6	339890	339895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_005362	TCG	2	6	339913	339918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_005362	GGT	2	6	339927	339932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_005362	ACA	2	6	339944	339949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_005362	CGA	2	6	339953	339958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_005362	AGA	2	6	340010	340015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_005362	TGAC	2	8	340037	340044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_005362	GTC	2	6	340066	340071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_005362	T	7	7	340159	340165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_005362	TAT	2	6	340227	340232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_005362	AT	3	6	340231	340236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_005362	T	6	6	340242	340247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_005362	CCATG	2	10	340266	340275	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1068	NC_005362	AAG	2	6	340379	340384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_005362	TCT	2	6	340389	340394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_005362	CGG	2	6	340438	340443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_005362	A	6	6	340463	340468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_005362	GTAATA	2	12	340506	340517	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_005362	TA	5	10	340516	340525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_005362	GTTTA	2	10	340548	340557	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_005362	TTTG	2	8	340677	340684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_005362	TCA	2	6	340708	340713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_005362	TAT	2	6	340843	340848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_005362	TAA	2	6	340917	340922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_005362	TG	3	6	341043	341048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_005362	CAT	2	6	341093	341098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_005362	GTAG	2	8	341113	341120	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_005362	GTC	2	6	341142	341147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_005362	GGT	2	6	341148	341153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_005362	CTT	2	6	341229	341234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_005362	T	7	7	341233	341239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_005362	ATT	2	6	341249	341254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_005362	AAT	2	6	341258	341263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_005362	AT	3	6	342693	342698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_005362	TTTTA	2	10	343318	343327	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_005362	A	6	6	343338	343343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_005362	T	6	6	348404	348409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_005362	AAT	2	6	348447	348452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_005362	GTAA	2	8	352620	352627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_005362	ACA	2	6	352672	352677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_005362	AGG	2	6	359556	359561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_005362	AAT	2	6	364818	364823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_005362	ATTA	2	8	364838	364845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_005362	TGA	2	6	364895	364900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_005362	AAG	2	6	364909	364914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_005362	A	6	6	367150	367155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_005362	AATT	2	8	367169	367176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_005362	T	6	6	367189	367194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_005362	ACA	2	6	367199	367204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_005362	TAT	2	6	367212	367217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_005362	TTA	2	6	367233	367238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_005362	TTAC	2	8	367244	367251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_005362	CAA	2	6	367272	367277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_005362	T	6	6	367341	367346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_005362	TGT	2	6	367406	367411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_005362	ATC	2	6	367419	367424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_005362	CCT	2	6	367508	367513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_005362	AGG	2	6	367520	367525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_005362	AAT	2	6	367539	367544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_005362	GTT	2	6	367803	367808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_005362	AATT	2	8	367815	367822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_005362	TGTTT	2	10	367831	367840	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_005362	AAT	2	6	367920	367925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_005362	ATAA	2	8	367945	367952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_005362	ATT	2	6	367985	367990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_005362	T	6	6	368027	368032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_005362	TA	3	6	368034	368039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_005362	AAG	2	6	368123	368128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_005362	T	6	6	370612	370617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_005362	GAT	2	6	370699	370704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_005362	GTT	2	6	370725	370730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_005362	T	7	7	370735	370741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_005362	TA	3	6	370797	370802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_005362	AGG	2	6	374452	374457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_005362	A	6	6	378171	378176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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