MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 1736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004343	TGT	2	6	315383	315388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_004343	GTA	2	6	315398	315403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_004343	TA	3	6	315522	315527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_004343	CTT	2	6	315550	315555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_004343	AAAAT	2	10	315581	315590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_004343	ATA	2	6	315617	315622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_004343	TGT	2	6	315674	315679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_004343	A	6	6	315693	315698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_004343	AGAAT	2	10	315845	315854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_004343	CAGA	2	8	315878	315885	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_004343	A	6	6	316010	316015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_004343	AAAATT	2	12	316055	316066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_004343	AGA	2	6	316731	316736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_004343	TAA	2	6	316749	316754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_004343	GCT	2	6	319108	319113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_004343	A	6	6	319133	319138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_004343	A	7	7	319142	319148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_004343	AAT	2	6	319798	319803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_004343	TAA	2	6	319830	319835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_004343	ATT	2	6	319886	319891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_004343	AAT	2	6	319946	319951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_004343	T	6	6	319967	319972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_004343	TGAAT	2	10	320880	320889	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_004343	AT	4	8	320888	320895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_004343	T	6	6	320906	320911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_004343	A	6	6	320935	320940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_004343	AT	3	6	320954	320959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_004343	TAT	2	6	321033	321038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_004343	TAT	2	6	321392	321397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_004343	TTC	2	6	321410	321415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_004343	CTT	2	6	321465	321470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_004343	ATGA	2	8	323810	323817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_004343	ACT	2	6	323969	323974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_004343	T	6	6	324031	324036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_004343	AGA	2	6	325241	325246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_004343	T	8	8	325268	325275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_004343	TCAT	2	8	325325	325332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_004343	A	6	6	326440	326445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_004343	CTT	2	6	326446	326451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_004343	A	7	7	326457	326463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_004343	TAA	3	9	326474	326482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_004343	A	6	6	326523	326528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_004343	T	6	6	326546	326551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_004343	CTTT	2	8	326561	326568	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_004343	T	6	6	326593	326598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_004343	T	7	7	326943	326949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_004343	GTT	2	6	326986	326991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_004343	TACT	2	8	327132	327139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_004343	T	6	6	327151	327156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_004343	TA	3	6	327164	327169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_004343	CATT	2	8	327226	327233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_004343	T	7	7	327658	327664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_004343	AC	3	6	327665	327670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_004343	A	8	8	327795	327802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_004343	TTA	2	6	327808	327813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_004343	ATT	2	6	327862	327867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_004343	T	7	7	328671	328677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_004343	TTCT	2	8	328694	328701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_004343	TTA	2	6	328706	328711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_004343	TAT	2	6	328736	328741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_004343	A	7	7	328792	328798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_004343	GAA	2	6	328802	328807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_004343	GAAATC	2	12	328873	328884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1564	NC_004343	T	6	6	328890	328895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_004343	T	8	8	328950	328957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_004343	A	6	6	329090	329095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_004343	TAAA	2	8	330186	330193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_004343	AATC	2	8	330226	330233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_004343	CCATTA	2	12	330272	330283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_004343	T	6	6	330294	330299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_004343	CTTC	2	8	330347	330354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_004343	TTA	2	6	330395	330400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_004343	TAA	2	6	330442	330447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_004343	T	7	7	330464	330470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_004343	AATCA	2	10	330477	330486	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1576	NC_004343	TA	3	6	330503	330508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_004343	TCG	2	6	331397	331402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_004343	TAC	2	6	331449	331454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_004343	A	6	6	331470	331475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_004343	CGA	2	6	331504	331509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1582	NC_004343	ATGA	2	8	331767	331774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_004343	AAT	2	6	331965	331970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_004343	GTG	2	6	331998	332003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_004343	AGC	2	6	332131	332136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1588	NC_004343	CAC	2	6	332318	332323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1591	NC_004343	TAAAA	2	10	332517	332526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_004343	ATG	2	6	332564	332569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_004343	GAT	2	6	333036	333041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_004343	T	6	6	333041	333046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_004343	A	6	6	333049	333054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_004343	T	6	6	333122	333127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_004343	TTA	2	6	333153	333158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_004343	ACCT	2	8	333181	333188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_004343	ACG	2	6	333194	333199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1602	NC_004343	GGA	2	6	333242	333247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_004343	TA	3	6	334233	334238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_004343	AATT	2	8	334272	334279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_004343	TCAA	2	8	334289	334296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_004343	TTA	2	6	334298	334303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_004343	AATT	2	8	334824	334831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_004343	ATT	2	6	334842	334847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_004343	ATT	2	6	334854	334859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_004343	AAAT	2	8	334863	334870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_004343	TGTT	2	8	334875	334882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_004343	AG	3	6	334984	334989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_004343	AG	3	6	335101	335106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_004343	AACC	2	8	335111	335118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_004343	ACC	2	6	335234	335239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_004343	CCCA	2	8	335247	335254	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1617	NC_004343	CT	3	6	335280	335285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_004343	AG	3	6	336553	336558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_004343	CTT	2	6	336578	336583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_004343	GGTT	2	8	336734	336741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_004343	AG	3	6	336747	336752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_004343	AG	3	6	336782	336787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_004343	ACC	2	6	337158	337163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_004343	TGC	2	6	337183	337188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1626	NC_004343	TAA	2	6	337208	337213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_004343	AGT	2	6	337249	337254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_004343	CAA	2	6	337281	337286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_004343	T	7	7	337565	337571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_004343	AGG	2	6	337637	337642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_004343	TGTT	2	8	337644	337651	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_004343	TTA	2	6	337740	337745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_004343	ATT	2	6	337760	337765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_004343	A	6	6	337803	337808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_004343	ATT	2	6	337831	337836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_004343	TAA	2	6	337844	337849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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