MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 24096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004342	CTT	2	6	604360	604365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_004342	GTT	2	6	604459	604464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_004342	AATT	2	8	604537	604544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_004342	ACT	2	6	604550	604555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_004342	TAT	2	6	604557	604562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_004342	TTG	2	6	604574	604579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_004342	AGT	2	6	604607	604612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_004342	TTCT	2	8	605310	605317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_004342	TAT	2	6	605403	605408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_004342	ACT	2	6	605429	605434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_004342	ACT	2	6	605476	605481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_004342	TTA	2	6	605487	605492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_004342	T	6	6	605548	605553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_004342	T	6	6	605636	605641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_004342	ACA	2	6	605657	605662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_004342	T	7	7	605788	605794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_004342	T	7	7	605824	605830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_004342	TGAAT	2	10	606024	606033	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_004342	A	8	8	606066	606073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_004342	TGT	2	6	606083	606088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_004342	TAA	2	6	606111	606116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_004342	AAGAG	2	10	606633	606642	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_004342	TTAA	2	8	606650	606657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_004342	ATT	2	6	606723	606728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_004342	CTA	2	6	608226	608231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_004342	A	7	7	608264	608270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_004342	ACT	2	6	608419	608424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_004342	TAT	2	6	608492	608497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_004342	ACT	2	6	608538	608543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_004342	CAATT	2	10	608552	608561	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3531	NC_004342	ATTT	2	8	608648	608655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_004342	AGAA	2	8	608665	608672	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_004342	A	6	6	608677	608682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_004342	TGAA	2	8	608717	608724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_004342	TACT	2	8	608725	608732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_004342	TTC	2	6	608733	608738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3538	NC_004342	ATT	2	6	608782	608787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_004342	A	6	6	608796	608801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_004342	TCGAT	2	10	608852	608861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3541	NC_004342	A	6	6	608866	608871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_004342	A	7	7	608909	608915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_004342	TTTTC	2	10	608923	608932	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3544	NC_004342	AGA	2	6	611137	611142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_004342	CAAAAT	2	12	611198	611209	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3546	NC_004342	TTTG	2	8	611229	611236	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_004342	A	6	6	611237	611242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_004342	AATA	2	8	611246	611253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_004342	TAA	2	6	611272	611277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_004342	AT	3	6	611288	611293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_004342	A	6	6	611385	611390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_004342	TCAT	2	8	611396	611403	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_004342	A	6	6	611404	611409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_004342	TTATC	2	10	611412	611421	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3555	NC_004342	AGG	2	6	611432	611437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_004342	A	6	6	611471	611476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_004342	GAA	2	6	611506	611511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_004342	GATT	2	8	611542	611549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_004342	T	6	6	611548	611553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_004342	GTTTT	2	10	611556	611565	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_004342	T	6	6	611562	611567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_004342	AAAG	2	8	611583	611590	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_004342	AAATAG	2	12	611596	611607	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_004342	AAT	2	6	611648	611653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_004342	TGAA	2	8	611662	611669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_004342	CGG	2	6	611784	611789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_004342	T	8	8	611834	611841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_004342	GATA	2	8	611853	611860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_004342	TCT	2	6	611892	611897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_004342	GAG	2	6	613083	613088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_004342	AAG	2	6	613089	613094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_004342	CTTT	2	8	613963	613970	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_004342	T	6	6	613968	613973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_004342	A	6	6	613974	613979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_004342	GTTTT	2	10	614044	614053	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_004342	T	6	6	614050	614055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3581	NC_004342	TCT	2	6	614573	614578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3584	NC_004342	GAA	2	6	617841	617846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_004342	GTTT	2	8	617979	617986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_004342	ATG	2	6	618036	618041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3598	NC_004342	TTAA	2	8	618350	618357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3600	NC_004342	CGTT	2	8	618417	618424	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_004342	TAG	2	6	618452	618457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3603	NC_004342	TGTTTT	2	12	618494	618505	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_004342	TAG	2	6	618527	618532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3606	NC_004342	AT	3	6	618865	618870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_004342	AT	3	6	618969	618974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3609	NC_004342	GTT	2	6	619131	619136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_004342	T	6	6	619191	619196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_004342	CAAT	2	8	619242	619249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_004342	A	8	8	619295	619302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_004342	AATT	2	8	619338	619345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_004342	A	6	6	619359	619364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3619	NC_004342	T	6	6	622494	622499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_004342	TATT	2	8	622585	622592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_004342	A	6	6	622614	622619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3623	NC_004342	TTA	2	6	622662	622667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_004342	GTT	2	6	622771	622776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_004342	T	6	6	623059	623064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_004342	TAC	2	6	623083	623088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3634	NC_004342	T	6	6	623184	623189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_004342	T	6	6	623201	623206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_004342	TAA	2	6	623222	623227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3637	NC_004342	AGT	2	6	623252	623257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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