MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 24096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004342	TAT	2	6	315049	315054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_004342	GTT	2	6	315089	315094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_004342	T	6	6	315093	315098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_004342	TGAT	2	8	315411	315418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_004342	GTA	2	6	315503	315508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_004342	GAT	2	6	315535	315540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_004342	CT	3	6	315816	315821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_004342	TTA	2	6	315827	315832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_004342	TTTTAA	2	12	315894	315905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_004342	AT	3	6	315940	315945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_004342	GTT	2	6	315971	315976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_004342	CAA	2	6	315991	315996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_004342	AATT	2	8	316047	316054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_004342	CAA	2	6	316058	316063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_004342	AGGA	2	8	316075	316082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_004342	T	6	6	316143	316148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_004342	T	8	8	316213	316220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_004342	TAT	2	6	316299	316304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_004342	AAG	2	6	316333	316338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_004342	TGA	2	6	316359	316364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_004342	A	6	6	317307	317312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_004342	ATTTT	2	10	317352	317361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_004342	TAA	2	6	317412	317417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_004342	AATT	2	8	317462	317469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_004342	ATTT	2	8	317533	317540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_004342	TTAT	2	8	317596	317603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1529	NC_004342	TAT	2	6	317726	317731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_004342	A	6	6	317794	317799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_004342	ATT	2	6	317824	317829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_004342	TAG	2	6	317893	317898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1534	NC_004342	A	6	6	317925	317930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_004342	A	6	6	317959	317964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1542	NC_004342	A	6	6	318801	318806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_004342	TAA	3	9	318828	318836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_004342	AGT	2	6	318926	318931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_004342	TAT	2	6	319147	319152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1549	NC_004342	TAAA	2	8	320207	320214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_004342	TCT	2	6	320604	320609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_004342	TAAA	2	8	320704	320711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_004342	A	6	6	320709	320714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_004342	GTT	2	6	320779	320784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_004342	GTT	2	6	320788	320793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_004342	A	7	7	320816	320822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1561	NC_004342	GTT	2	6	320972	320977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1563	NC_004342	AATT	2	8	321048	321055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_004342	CAA	2	6	321059	321064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_004342	AAG	2	6	321077	321082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_004342	AAAG	2	8	321090	321097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_004342	AAT	2	6	321103	321108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_004342	GTT	2	6	321139	321144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_004342	ATT	2	6	321172	321177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_004342	ATTTG	2	10	321199	321208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1572	NC_004342	TATAA	2	10	321698	321707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_004342	TTA	2	6	321710	321715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_004342	TAATA	2	10	321744	321753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_004342	TAAT	2	8	321760	321767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1580	NC_004342	TTCT	2	8	321922	321929	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1583	NC_004342	AGT	2	6	322003	322008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_004342	TTG	2	6	322058	322063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_004342	TAT	2	6	322114	322119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1587	NC_004342	AGT	2	6	322136	322141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_004342	TAT	2	6	323535	323540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_004342	T	6	6	325449	325454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_004342	A	6	6	325482	325487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_004342	T	6	6	325522	325527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_004342	AAAACA	2	12	325569	325580	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1606	NC_004342	ATA	2	6	326861	326866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_004342	GTT	2	6	326869	326874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_004342	TCG	2	6	326938	326943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1611	NC_004342	CTT	2	6	329897	329902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_004342	GGGAA	2	10	329905	329914	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_004342	TCT	2	6	329994	329999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_004342	AT	3	6	330121	330126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_004342	GTA	2	6	330193	330198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_004342	T	7	7	330205	330211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_004342	CCT	2	6	330224	330229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_004342	ATTT	2	8	330235	330242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_004342	TGAATT	2	12	330289	330300	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_004342	CAT	2	6	330351	330356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_004342	TTTTA	2	10	330425	330434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_004342	T	6	6	330490	330495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_004342	TCG	2	6	330523	330528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_004342	ACT	2	6	330593	330598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1626	NC_004342	ACT	2	6	330668	330673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_004342	T	6	6	330713	330718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_004342	ATA	2	6	330743	330748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_004342	CTA	2	6	330790	330795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_004342	TAT	2	6	330802	330807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_004342	TAG	2	6	330829	330834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_004342	AAG	2	6	330903	330908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_004342	CTG	2	6	330986	330991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_004342	TGGT	2	8	331043	331050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_004342	A	6	6	331074	331079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_004342	T	7	7	331116	331122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_004342	CCTT	2	8	332420	332427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1915	NC_004342	TTTTG	2	10	388705	388714	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_004342	TGT	2	6	388760	388765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_004342	GATA	2	8	388826	388833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1931	NC_004342	T	6	6	389999	390004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_004342	GAATA	2	10	390021	390030	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_004342	T	6	6	390038	390043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1934	NC_004342	A	7	7	390095	390101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1943	NC_004342	TAA	2	6	393460	393465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1944	NC_004342	T	6	6	393482	393487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_004342	ATA	2	6	393510	393515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1946	NC_004342	T	6	6	393601	393606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1947	NC_004342	TTG	2	6	393617	393622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1948	NC_004342	GTTGT	2	10	393660	393669	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1951	NC_004342	AAC	2	6	393756	393761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1953	NC_004342	CCA	2	6	393830	393835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1955	NC_004342	TTG	2	6	394032	394037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1958	NC_004342	A	6	6	395201	395206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1959	NC_004342	TGCAC	2	10	395223	395232	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1968	NC_004342	T	6	6	395813	395818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1969	NC_004342	TA	3	6	395911	395916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1970	NC_004342	TAT	2	6	395953	395958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1971	NC_004342	TTTC	2	8	396039	396046	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1972	NC_004342	A	6	6	396104	396109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1973	NC_004342	GATT	2	8	396130	396137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1974	NC_004342	ACT	2	6	396198	396203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1977	NC_004342	TAT	2	6	396401	396406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1996	NC_004342	TATT	2	8	397306	397313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_004342	A	6	6	397917	397922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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